| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,127,616 | T→C | 8.6% | Q90R (CAG→CGG) | PP_5375 ← | LysR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,127,616 | 0 | T | C | 8.6% | 159.9 / 4.8 | 59 | Q90R (CAG→CGG) | PP_5375 | LysR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/25); new base C (2/3); total (30/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.10e-01 | |||||||||||
GCGTAATCCTTCACATGATCGTGGGCGATGATCCGCAGGTCGATGTTTTCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGCTACGGGTGGTACGGGTGAATAGTGCCTTGCCCAGGTAGTCCTCAAGAAGGCGAAC > NC_002947/6127472‑6127761 | gCGTAATCCTTCACATGATCGTGGGCGATGATCCGCAGGTCGATGTTTTCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGc < 8:28348/148‑1 (MQ=255)gCGTAATCCTTCACATGATCGTGGGCGATGATCCGCAGGTCGATGTTTTCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGc < 2:214820/148‑1 (MQ=255) tCCTTCACATGATCGTGGGCGATGATCCGCAGGTCGATGTTTTCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑c < 8:104709/149‑1 (MQ=255) aTGCTCGTGGGCGATGATCCGCAGGTCGAGGTTTTCATGGGCACTCTCGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAAGCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTgg < 7:206795/149‑1 (MQ=255) aTGATCGTGGGCGATGATCCGCAGGTCGATGTTTTCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTgg > 4:262484/1‑149 (MQ=255) aTGATCGTGGGCGATGATCCGCAGGTCGATGTTTTCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACCGGCG‑ATATACGC‑‑‑‑‑‑‑CAGTgg < 5:299584/149‑1 (MQ=255) aTCGTGGGCGATGATCCGCAGGGCGATGTTTTCATGGGCACTCTGTAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACCGGCG‑ATATACGC‑‑‑‑‑‑‑CAGTGgcaa < 6:140135/149‑3 (MQ=255) tCGTGGGCGATGATCCGCAGGTCGATGTTTTCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGCGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACCGGCG‑ATATACGC‑‑‑‑‑‑‑CAGTGgcaag < 1:117419/149‑4 (MQ=255) atCCGCAGGTCGATGTTTTCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGt > 1:89925/1‑120 (MQ=255) atCCGCAGGTCGATGTTTTCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGt < 2:89925/120‑1 (MQ=255) tCCGCAGGTCGATGTTTTCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑gc < 6:41517/149‑1 (MQ=255) ccGCAGGTCGATGTTTTCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑gca > 3:137547/1‑149 (MQ=255) gCAGGTCGATGTTTTCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGa > 4:277547/1‑143 (MQ=255) gCAGGTCGATGTTTTCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGa < 3:277547/143‑1 (MQ=255) gATGTTTTCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTg > 5:59598/1‑121 (MQ=255) gATGTTTTCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTg < 6:59598/121‑1 (MQ=255) ttttCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAATGCATGC‑TTCAcctg < 3:103191/148‑4 (MQ=255) tttCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCggg > 1:289221/1‑123 (MQ=255) tttCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCggg < 2:289221/123‑1 (MQ=255) tttCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCAcc > 2:112071/1‑149 (MQ=255) tCATGGGCACTCTGGAATTCCGCCACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGgc > 4:67107/1‑116 (MQ=255) tCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTTTAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGt > 3:58632/1‑149 (MQ=255) tCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTg > 4:43868/1‑114 (MQ=255) tCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGgc > 6:185047/1‑116 (MQ=255) tctGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCAcc > 7:116330/1‑137 (MQ=255) tctGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCAcc < 8:116330/137‑1 (MQ=255) tctGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACGGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCa < 5:192143/131‑1 (MQ=255) tctGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACCGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCa > 6:192143/1‑131 (MQ=255) tctGGAATTCCGACACCGTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATa > 4:37657/1‑148 (MQ=255) tGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACTGAGGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATAc > 1:278197/1‑149 (MQ=255) acCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTTTAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTggg < 4:58632/149‑1 (MQ=255) cTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCg > 8:252591/1‑127 (MQ=255) ttGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTgggg < 8:12556/147‑1 (MQ=255) ttGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTgggg > 7:12556/1‑147 (MQ=255) cAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAgg > 6:196495/1‑148 (MQ=255) cacaGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGc > 4:88836/1‑148 (MQ=255) acaGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGCTa < 3:37657/149‑1 (MQ=255) gCGACGCCATGGGGGTTTTGGGGGCAACGGTGTTT‑‑TTTTTGTTTCCTTGCCATTGGGTTATTT‑CCCCCTTTTTCGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACAt < 1:112071/149‑1 (MQ=255) gACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAggg < 2:64723/136‑1 (MQ=255) gACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGCTACGggt < 5:196495/149‑1 (MQ=255) cATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGACACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTAACGCACCGTTTAGTAATACTTCGCGCAGGTGGGGGTCAGGGACATGCTACTGGTGGTAc > 1:276515/1‑149 (MQ=255) gTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGCTACGGGTGGTACGGGTGaa > 1:65911/1‑149 (MQ=255) cTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGCTACGGGTGGTACGGGTGAATa < 3:88836/148‑1 (MQ=255) gtggCAACGGTGACT‑‑TGTTGGATGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCAtt > 5:226399/1‑76 (MQ=255) gtggCAACGGTGACT‑‑TGTTGGATGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCAtt < 6:226399/76‑1 (MQ=255) tggCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGCTACGGGTGGTACGGGTGAATAGTGcc < 2:278197/149‑1 (MQ=255) gCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGCTACGGGTGGTACGGGTGAATAGTg < 7:331607/145‑1 (MQ=255) gCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGCTACGGGTGGTACGGGTGAATAGTg > 8:331607/1‑145 (MQ=255) gCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGCTACGGGTGGTACGGGTGAATAGTGCCtt > 8:257263/1‑149 (MQ=255) aaCGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGCTACGGGTGGTACGGGTGaa > 4:63896/1‑138 (MQ=255) aaCGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGCTACGGGTGGTACGGGTGaa < 3:63896/138‑1 (MQ=255) cGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGCTACGGGTGGTACGGGTGAATAGTg < 4:91311/141‑1 (MQ=255) cGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGCTACGGGTGGTACGGGTGAATAGTg > 3:91311/1‑141 (MQ=255) gTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGAc < 2:226578/111‑1 (MQ=255) gTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGAc > 1:226578/1‑111 (MQ=255) t‑‑tgttgGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGCTACGggtg < 2:11989/118‑1 (MQ=255) t‑‑tgttgGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGCTACGggtg > 1:11989/1‑118 (MQ=255) gcgccACCGGCG‑ATATACGC‑‑‑‑‑‑‑CAGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGCTACGGGTGGTACGGGTGAATAGTGCCTTGCCCAGGTAGTc > 5:20571/3‑138 (MQ=255) cACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGCTACGGGTGGTACGGGTGAATAGTGCCTTGCCCAGGTAGTCCTCAAGAAGGCGAAc > 2:264214/1‑149 (MQ=255) | GCGTAATCCTTCACATGATCGTGGGCGATGATCCGCAGGTCGATGTTTTCATGGGCACTCTGGAATTCCGACACCTTGGGCAGTAACCACAGCGACGCCATGGCGGTACTGGTGGCAACGGTGACT‑‑TGTTGGTTGCCTTGCCACTGGCGTATAT‑CGC‑‑‑‑‑‑‑CGGTGGCGCGGGCCAGGTGAA‑GCATGCATTCACGCACCGTTTCGTAATACTGCGCGCCGGTGGGGGTCAGGGACATGCTACGGGTGGTACGGGTGAATAGTGCCTTGCCCAGGTAGTCCTCAAGAAGGCGAAC > NC_002947/6127472‑6127761 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |