Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 629,375 | A→G | 5.6% | S275P (TCG→CCG) | eutB ← | ethanolamine ammonia‑lyase subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 629,375 | 0 | A | G | 5.6% | 210.5 / 2.1 | 71 | S275P (TCG→CCG) | eutB | ethanolamine ammonia‑lyase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/32); new base G (2/2); total (37/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 |
GGAACGGCTTGAAGTGACGAGCCACGGCATAGGCGCGGGTTTCGCAGGTCTGCTGGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGTTGATCGCTTCGATCGAGGTGGTGACGTGGGTCAGC > NC_002947/629228‑629523 | ggAACGGCTTGAAGTGACGAGCCACGGCATAGGCGCGGGTTTCGCAGGTCTGCTGGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGa > 6:358805/1‑148 (MQ=255) aCGGCTTGAAGTGACGAGCCACGGCATAGGCGCGGGTTTCGCAGGTCTGCTGGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGc > 6:325259/1‑149 (MQ=255) gTGACGAGCCACGGCATAGGCGCGGGTTTCGCAGGTCTGCTGGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGt < 7:325792/149‑1 (MQ=255) tGACGAGCCACGGCATAGGCGCGGGTTTCGCAGGTCTGCTGGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTa < 5:325259/149‑1 (MQ=255) tGACGAGCCACGGCATAGGCGCGGGTTTCGCAGGTCTGCTGGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTa < 3:294623/149‑1 (MQ=255) gACGAGCCACGGCATAGGCGCGGGTTTAGCAGGTCTGCTGGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGCGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAAAACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAg > 6:223512/1‑149 (MQ=255) gCCACGGCATAGGCGCGGGTTTCGCAGGTCTGCTGGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTc < 3:281571/149‑1 (MQ=255) aCGGCATAGGCGCGGGTTTCGCAGGTCTGCTGGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTg < 8:129068/149‑1 (MQ=255) ggCATAGGCGCGGGTTTCGCAGGTCTGCTGTTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCt < 6:327364/130‑1 (MQ=255) ggCATAGGCGCGGGTTTCGCAGGTCTGCTGGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCt > 5:327364/1‑130 (MQ=255) gcgGGTTTCGCAGGTCTGCTGGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGGCAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGtt > 6:25283/1‑147 (MQ=255) gcgGGTTTCGCAGGTCTGCTGGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGGCAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGtt > 5:129417/1‑147 (MQ=255) gcgGGTTTCGCAGGTCTGCTGGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGc > 7:192401/1‑139 (MQ=255) gcgGGTTTCGCAGGTCTGCTGGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGc < 8:192401/139‑1 (MQ=255) gTCTGCTGGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCTGGTTGATGCCg > 1:139416/1‑147 (MQ=255) gctgGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCg > 5:72448/1‑149 (MQ=255) ctgGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCgg > 3:187806/1‑149 (MQ=255) tgGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCa > 7:30036/1‑130 (MQ=255) tgGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCa < 8:30036/130‑1 (MQ=255) gTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGt > 5:119135/1‑149 (MQ=255) gACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAg > 6:117325/1‑126 (MQ=255) gACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAg < 5:117325/126‑1 (MQ=255) gACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTgg > 3:219345/1‑149 (MQ=255) aCGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGGCAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGgc < 5:25283/149‑1 (MQ=255) aCGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGGCAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGgc < 6:129417/149‑1 (MQ=255) tggGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGAt < 6:296207/122‑1 (MQ=255) tggGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCtgt < 6:72448/149‑1 (MQ=255) gCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCctct > 1:333294/1‑144 (MQ=255) gCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCctct < 2:333294/144‑1 (MQ=255) gCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGAt < 4:219345/149‑1 (MQ=255) agagCGCGCTGCCCTGGCCGCTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGGTTCAGCGACAGCCCTGCATCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGCCGATGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGAc > 5:364423/1‑149 (MQ=255) cTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAacac < 5:223512/149‑1 (MQ=255) cTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAacac < 5:358805/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAgg < 2:232088/149‑1 (MQ=255) cGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAg < 4:295976/148‑1 (MQ=255) cGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAg > 3:295976/1‑148 (MQ=255) ggTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTg < 4:187806/149‑1 (MQ=255) gTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGCTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTgg > 1:30275/1‑149 (MQ=255) tttCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATg < 8:62392/89‑1 (MQ=255) tttCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATg > 7:62392/1‑89 (MQ=255) ttCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCa > 3:261764/1‑149 (MQ=255) cGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCAcg > 5:150441/1‑149 (MQ=255) aTCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATg > 5:155737/1‑78 (MQ=255) aTCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATg < 6:155737/78‑1 (MQ=255) aTCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGtt < 4:261764/149‑1 (MQ=255) aTCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGtt > 7:187794/1‑149 (MQ=255) tCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGgccgc > 6:55254/1‑97 (MQ=255) tCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGc < 8:88993/105‑1 (MQ=255) tCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGc > 7:88993/1‑105 (MQ=255) tCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGtt > 7:115777/1‑148 (MQ=255) tCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGtt > 7:281622/1‑148 (MQ=255) tCAGGTTCTGCCCGAGGGAGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGTTg > 5:278665/1‑149 (MQ=255) gTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGAc > 5:182125/1‑112 (MQ=255) gTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGAc < 6:182125/112‑1 (MQ=255) gCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGTTGATCGCTtc > 8:150244/1‑148 (MQ=255) cccGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGTTGATCGCTtcga > 3:336140/1‑149 (MQ=255) ccGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACAcc < 3:311845/114‑1 (MQ=255) ccGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACAcc > 4:311845/1‑114 (MQ=255) cGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGTTGATCGCTtcgatc < 7:150244/149‑1 (MQ=255) gttgtgcACTTTTCAGGGACACCCCTGCTTCGTAGCATTCGTGCAAGACGTTCAGGTTGTTGTCGAAGCCGGGGTTGGCCGACTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGTTGATCGCTTCGATCGAg < 6:364423/143‑1 (MQ=255) gggTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGTTGATCGCTTCGATCGAg > 7:50621/1‑149 (MQ=255) gggTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGTTGATCGCTTCGATCGAg < 6:150441/149‑1 (MQ=255) gggTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGTTGATCGCTTCGATCGAg < 3:338380/149‑1 (MQ=255) cACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTTATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGTTGATCGCTTCGATCGAGgtggtg < 8:187794/149‑1 (MQ=255) cACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGt < 4:277914/113‑1 (MQ=255) cACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGt > 3:277914/1‑113 (MQ=255) cACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGtt > 3:219590/1‑127 (MQ=255) cACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGtt < 4:219590/127‑1 (MQ=255) cACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGTTGATCGCTTCGATCGAggtggt > 1:36251/1‑148 (MQ=255) tttCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGTTGATCGCTTCGATCGAGGTGGTGACGt < 2:30275/149‑1 (MQ=255) gCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGTTGATCGCTTCGATCGAGGTGGTGACGTGGGt > 2:67220/1‑148 (MQ=255) gACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGTTGATCGCTTCGATCGAGGTGGTGACGTGGGTCAg > 4:114632/1‑149 (MQ=255) aCAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGTTGATCGCTTCGATCGAGGTGGTGACGTGGGTCAGc < 8:281622/149‑1 (MQ=255) | GGAACGGCTTGAAGTGACGAGCCACGGCATAGGCGCGGGTTTCGCAGGTCTGCTGGTCGACGCCGTGGTGGGCGTTGGCCGAGAGCGCGCTGCCCTGGCCGGTTTCGAAATACATCAGGTTCTGCCCGAGGGTGCCACGTTTCAGCGACAGCCCTGCTTCGTAGCCTTCCTGCAACACGTTCAGGTTGATGCCGAAGCCGGCGTTGGCCGCCTCTGTGCCGGCGATGGACTGGAACACCAGGTCCAGTGGCACGCCGCGGTTGATCGCTTCGATCGAGGTGGTGACGTGGGTCAGC > NC_002947/629228‑629523 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |