Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 101,804 | G→T | 6.2% | K208N (AAG→AAT) ‡ | prlC → | oligopeptidase A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 101,804 | 0 | G | T | 6.2% | 205.3 / 4.0 | 64 | K208N (AAG→AAT) ‡ | prlC | oligopeptidase A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/31); new base T (2/2); total (31/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.71e-01 |
GAGCAAGCTCAGCGAGCTGGGCAGCCGTTTCTCCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTGCGCGAAGAGCTATACGCCGCCTACTGCACCCGCGCCTCCGACCAGGGCCCGAATGCCGGCCAGTTCGA > NC_002947/101657‑101950 | gagCAAGCTCAGCGAGCTGGGCAGCCGTTTCTCCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAgg < 5:127793/149‑1 (MQ=255) cAAGCTCAGCGAGCTGGGCAGCCGTTTCTCCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGcc > 5:291980/1‑149 (MQ=255) aGCTCAGCGAGCTGGGCAGCCGTTTCTCCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTg < 6:70284/149‑1 (MQ=255) gCTCAGCGAGCTGGGCAGCCGTTTCTCCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAgg < 5:276727/143‑1 (MQ=255) gCTCAGCGAGCTGGGCAGCCGTTTCTCCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAgg > 6:276727/1‑143 (MQ=255) gCTCAGCGAGCTGGGCAGCCGTTTCTCCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTg > 5:362825/1‑148 (MQ=255) gCTCAGCGAGCTGGGCAGCCGTTTCTCCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTg > 6:239954/1‑148 (MQ=255) tCAGCGAGCTGGGCAGCCGTTTCTCCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGAc > 7:233151/1‑149 (MQ=255) tCAGCGAGCTGGGCAGCCGTTTCTCCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGAc > 7:134841/1‑149 (MQ=255) cAGCGAGCTGGGCAGCCGTTTCTCCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCt > 5:125569/1‑144 (MQ=255) cAGCGAGCTGGGCAGCCGTTTCTCCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCt < 6:125569/144‑1 (MQ=255) cGAGCTGGGCAGCCGTTTCTCCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCt < 6:291980/149‑1 (MQ=255) ggCAGCCGTTTCTCCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCATGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGa < 5:239954/148‑1 (MQ=255) aGCCGTTTCTCCAATCAGCTGCTAGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCAc > 7:51818/1‑149 (MQ=255) ctcCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGaa < 3:9014/148‑1 (MQ=255) ctcCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGaa < 8:134841/148‑1 (MQ=255) tcCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTAGCCGACGAAGATCCGCTGGCCGGCCTGACCGATACGGCCAAGCCGCAGATGGCCGATGCAGCCAAGGCCAAGGGCCTGGACGGATGGTTGATCACCCTTGaa > 1:252896/1‑148 (MQ=255) tcCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAg < 7:264317/117‑1 (MQ=255) tcCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAg > 8:264317/1‑117 (MQ=255) cattctgctgctGGACGCCACCCTGGCCTGGACCATGCATGTTA‑CCGAGTACGGTGCGGTGGGCGGCCTGACCTTTTCGGCCATGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTc < 8:255107/142‑1 (MQ=255) cAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTcc < 8:233151/149‑1 (MQ=255) aaTCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCCTTGGCCTgggc < 2:298152/123‑3 (MQ=255) aaTCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCCTTGGCCTgggc > 1:298152/1‑121 (MQ=255) aaTCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTcc > 7:260491/1‑148 (MQ=255) tccgctgctGGACGCCACCCAGGCCTGCACAAACCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGTTTCGGCCATGGCGCATATGGCCGCTTCAGCCTTGTCTATGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCa < 8:51818/146‑1 (MQ=255) ggtgctgGAGGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCTGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTg < 2:124247/125‑1 (MQ=255) gtcGCCACCCAGGCCGGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGGTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTAcgc < 6:362825/147‑1 (MQ=255) cGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCgg < 7:10878/149‑1 (MQ=255) gCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGt < 7:276145/149‑1 (MQ=255) cACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGa > 6:239392/1‑126 (MQ=255) cACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGa < 5:239392/126‑1 (MQ=255) ccAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGAc < 4:79349/103‑1 (MQ=255) ccAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGAc > 3:79349/1‑103 (MQ=255) ccAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCt < 4:285052/120‑1 (MQ=255) ccAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCt > 3:285052/1‑120 (MQ=255) gCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTccc > 6:169042/1‑125 (MQ=255) gCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTccc < 5:169042/125‑1 (MQ=255) gCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGAGGACCTa > 1:293360/1‑149 (MQ=255) aCCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCCTTGGCCTggg < 2:203498/92‑2 (MQ=255) aaGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGa > 1:269683/1‑149 (MQ=255) aaGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGa > 3:172487/1‑149 (MQ=255) aaGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGa > 3:282033/1‑149 (MQ=255) aTGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACcgc < 2:293360/149‑1 (MQ=255) ttA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTAcgcg > 8:188766/1‑122 (MQ=255) cgacgaAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTgc > 2:214016/1‑149 (MQ=255) cgacgaAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTgc > 1:327413/1‑149 (MQ=255) cgacgaAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTgc < 6:267558/149‑1 (MQ=255) gacgaAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTgcg < 4:172487/149‑1 (MQ=255) gacgaAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTgcg > 4:269449/1‑149 (MQ=255) aGCTGCGCTGTCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCTCGCCCTGCGCGAag < 4:282033/149‑1 (MQ=255) cgcTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTGCGCGAAGAGCta < 2:252896/149‑1 (MQ=255) gcTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGctact < 6:364309/101‑1 (MQ=255) gcTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGctact > 5:364309/1‑101 (MQ=255) tGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTGCGCGAAGAGCTATACGCCGCCTAc > 5:37108/1‑149 (MQ=255) aCCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGTCTGGTTGATCAGCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGGGCCGTGCGCGAAGAGCTATACGCCGCCTACt < 8:260491/148‑1 (MQ=255) ccGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTGCGCGAAGAGCTATACGCCGCCTACTg > 8:240396/1‑148 (MQ=255) gATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTGCGCGAAGAGCTATACGCCGCCTACTGCAc < 2:327413/149‑1 (MQ=255) gATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTGCGCGAAGAGCTATACGCCGCCTACTGCAc > 4:111145/1‑149 (MQ=255) gATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTGCGCGAAGAGCTATACGCCGCCTACTGCACCCGCGCCTCCGACCAgg < 2:269683/149‑1 (MQ=255) cGCTGCCCCCCCGCCCATGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTGCGCGAAGAGCta < 2:166017/109‑1 (MQ=255) cGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTGCGCGAAGAGCta > 1:166017/1‑109 (MQ=255) ccgtccACGCCCATGGCCTGGACCGCTGGTTGATCACCCTTGAATTAACCAGCTACTACCCGGTGATGACCTACCCCAGCGACCGCGCCCTGCGCGAACAGCAATACCCCGCCTACTGCACCCGCGCCTCCGACCACCGCCCGAATGcc > 2:146608/5‑149 (MQ=255) cccAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTGCGCGAAGAGCTATACGCCGCCTACTGCACCCGCGCCTCCGACCAGGGCCCGAATGCCGGc < 3:269449/149‑1 (MQ=255) cccAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTGCGCGAAGAGCTATACGCCGCCTACTGCACCCGCGCCTCCGACCAGGGCCCGAATGCCGGc < 7:240396/149‑1 (MQ=255) cccAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTGCGCGAAGAGCTATACGCCGCCTACTGCACCCGCGCCTCCGACCAGGGCCCGAATGCCGGc < 3:111145/149‑1 (MQ=255) cAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTAcgcg < 3:343004/57‑1 (MQ=255) cAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTAcgcg > 4:343004/1‑57 (MQ=255) cAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTGCGCGAAGAGCTATACGCCGCCTACTGCACCCGCGCCTCCGACCAGGGCCCGAATGCCGGCCAGTTc > 3:179353/1‑148 (MQ=255) aaGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTGCGCGAAGAGCTATACGCCGCCTACTGCACCCGCGCCTCCGACCAGGGCCCGAATGCCGGCCAGTTCGa > 4:59660/1‑149 (MQ=255) gggCCTGGTCGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTGCGCGAAGAGCTATACGCCGCCTACTGCACCCGCGCCTCCGACCAGGGCCCGAATGCCgg < 6:97630/138‑1 (MQ=255) gggCCTGGTCGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTGCGCGAAGAGCTATACGCCGCCTACTGCACCCGCGCCTCCGACCAGGGCCCGAATGCCgg > 5:97630/1‑138 (MQ=255) | GAGCAAGCTCAGCGAGCTGGGCAGCCGTTTCTCCAATCAGCTGCTGGACGCCACCCAGGCCTGGACCAAGCATGTTA‑CCGACGAAGCTGCGCTGGCCGGCCTGACCGATTCGGCCAAGGCGCAGATGGCCGCTGCAGCCCAGGCCAAGGGCCTGGACGGCTGGTTGATCACCCTTGAATTCCCCAGCTACTACGCGGTGATGACCTACGCCAGCGACCGCGCCCTGCGCGAAGAGCTATACGCCGCCTACTGCACCCGCGCCTCCGACCAGGGCCCGAATGCCGGCCAGTTCGA > NC_002947/101657‑101950 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |