Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 646,272 | T→A | 9.5% | intergenic (‑178/‑106) | PP_0556 ← / → acoR | acetoin catabolism protein/acetoin catabolism regulatory protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 646,272 | 0 | T | A | 9.5% | 175.9 / 7.5 | 63 | intergenic (‑178/‑106) | PP_0556/acoR | acetoin catabolism protein/acetoin catabolism regulatory protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/28); new base A (2/4); total (31/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.72e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.07e-01 |
CAGGAGCAAGCGGGGTGCCAGCTTTCTTCGCGATGGCTGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAACCGGAGGGCCTGAATGCTTGCCGCGAACTCCCGAGCCCATGTGGACTGCGTCAG > NC_002947/646124‑646418 | cAGGAGCAAGCGGGGTGCCAGCTTTCTTCGCGATGGCTGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCt < 6:52747/149‑1 (MQ=255) cAGGAGCAAGCGGGGTGCCAGCTTTCTTCGCGATGGCTGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCt > 6:144346/1‑149 (MQ=255) cAAGCGGGGTGCCAGCTTTCTTCGCGATGGCTGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGTACGTGTTAGGGCAGGT‑TTTAACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACAGAGAAGCTGCGtc > 1:100809/1‑149 (MQ=255) cAAGCGGGGTGCCAGCTTTCTTCGCGATGGCTGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGtct > 4:346077/1‑149 (MQ=255) cAAGCGGGGTGCCAGCTTTCTTCGCGATGGCTGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCAGCGtct > 1:269283/1‑149 (MQ=255) gCGGGGTGCCAGCTTTCTTCGCGATGGCTGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCaa < 3:346077/149‑1 (MQ=255) gCGGGGGGCCAGCTTTCTTCGCGATGGCTGAAGGGGCCGGGCTACAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCaa < 6:182755/149‑1 (MQ=255) cGGGGTGCCAGCTTTCTTCGCGATGGCTGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCAGCGTCTCagt < 3:246767/149‑3 (MQ=255) cGGGGTGCCAGCTTTCTTCGCGATGGCTGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCAGCGTCTCag < 2:269283/148‑2 (MQ=255) gggTGCCAGCTTTCTTCGCGATGGCTGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCAGCGTCTCagtgt < 4:126845/149‑5 (MQ=255) ggTGCCAGCTTTCTTCGCGATGGCTGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCAGCGTCTCagtgtc < 3:206227/149‑6 (MQ=255) gCTTTCTTCGCGATGGCTGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGt > 7:93251/1‑148 (MQ=255) tgttcGCGATGGCTGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATc < 2:100809/146‑1 (MQ=255) tcttcGCGATGGCTGGAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATca > 4:306210/1‑149 (MQ=255) cttcGCGATGGCTGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGG‑CGGGTGCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATca < 8:95566/148‑1 (MQ=255) ttcGCGATGGCTGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATcaca > 4:308997/1‑149 (MQ=255) gcgATGGCTGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGTCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATcacaca < 3:49010/148‑1 (MQ=255) gcgATGGCTGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATcacaca < 8:93251/148‑1 (MQ=255) tGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGTGTTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCGAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGt > 1:68057/1‑149 (MQ=255) gAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCg > 2:293737/1‑149 (MQ=255) gAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCg < 6:177144/149‑1 (MQ=255) gCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCAt > 8:9353/1‑149 (MQ=255) cGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCg < 7:99651/141‑1 (MQ=255) cGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCg > 8:99651/1‑141 (MQ=255) cGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCAGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGc > 5:339263/1‑149 (MQ=255) gT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAAt < 7:9353/147‑1 (MQ=255) gtgtTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACGCTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCg > 3:116660/1‑149 (MQ=255) gtgtTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGcc < 6:339263/148‑1 (MQ=255) gtTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGa > 5:170952/1‑149 (MQ=255) ggCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAAc > 8:101976/1‑148 (MQ=255) ggCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGCGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAAc > 2:333143/1‑148 (MQ=255) ggCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGCGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGACGGACTAc > 2:338557/1‑148 (MQ=255) gCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGa > 5:51144/1‑149 (MQ=255) cAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGCTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGa > 2:235055/1‑148 (MQ=255) tttCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATaaaaa > 1:295638/1‑149 (MQ=255) tCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATaaaaa > 6:358506/1‑147 (MQ=255) cACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACa < 1:293737/148‑1 (MQ=255) cGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTa < 6:170952/149‑1 (MQ=255) gggTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTaa < 1:333143/149‑1 (MQ=255) gggTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTaa < 7:101976/149‑1 (MQ=255) gggTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCCTCTCAATCCAGCCGGTAAACACACAGTGCTTGTCGGCGCATGCCCAGAGGCGCTTAAAGGCCGGACAACGATAAAAACAGTaa < 1:338557/149‑1 (MQ=255) gTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAAc > 3:220538/1‑149 (MQ=255) gCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACaa > 3:147808/1‑124 (MQ=255) gCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACaa < 4:147808/124‑1 (MQ=255) gCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAACCg > 6:107076/1‑148 (MQ=255) gagaCGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGt > 6:61823/1‑81 (MQ=255) gagaCGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGt < 5:61823/81‑1 (MQ=255) gagaCGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAACCGGAg < 3:306210/149‑1 (MQ=255) gaCGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCgg < 3:91006/88‑1 (MQ=255) gaCGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCgg > 4:91006/1‑88 (MQ=255) gaCGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACgaga < 5:70448/140‑1 (MQ=255) gaCGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACgaga > 6:70448/1‑140 (MQ=255) cGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACTCTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAACCGGAGGGcc < 4:116660/149‑1 (MQ=255) gggTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAACCGGAGGGCCTGaa < 5:144346/149‑1 (MQ=255) aGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAACCGGAGGGCCTGAATGCTTGc > 7:212826/1‑149 (MQ=255) cGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAACCGGAGGGCCTGAATGCTTGCCGCGAACTCCCGa < 8:212826/149‑1 (MQ=255) ttGAGACGCAGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAACCGGAGGGCCTGAATGCTTGCCGCGAACTCCCGAGCCCATGTGGACt > 1:304749/2‑149 (MQ=255) cTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAACCGGAGGGCCTGAATGCTTGCCGCGAACTCCCGAGCCCATGTGGACt > 5:85236/1‑149 (MQ=255) tGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAACCGGAGGGCCTGAATGCTTGCCGCGAACTCCCGAGCCCATGTGGACTg > 7:85668/1‑149 (MQ=255) agaCGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAACCGGAGGGCCTGAATGCTTGCCGCGAACTCCCGAGCCCATGTGGACTGc < 6:85236/148‑1 (MQ=255) agaCGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAACCGGAGGGCCTGAATGCTTGCCGCGAACTCCCGAGCCCATGTGGACTGc < 8:85668/148‑1 (MQ=255) agaCGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAACCGGAGGGCCTGAATGCTTGCCGCGAACTCCCGAGCCCATGTGGACTGc < 2:295638/148‑1 (MQ=255) gaCGCTGCGTCTCGAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAACCGGAGGGCCTGAATGCTTGCCGCGAACTCCCGAGCCCATGTGGACTGCGt < 2:68057/149‑1 (MQ=255) aCGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAACCGGAGGGCCTGAATGCTTGCCGCGAACTCCCGAGCCCATGTGGACTGCGTc < 1:235055/149‑1 (MQ=255) cTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAACCGGAGGGCCTGAATGCTTGCCGCGAACTCCCGAGCCCATGTGGACTGCGTcag > 5:340960/1‑148 (MQ=255) tGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAACCGGAGGGCCTGAATGCTTGCCGCGAACTCCCGAGCCCATGTGGACTGCGTcag > 6:103555/1‑147 (MQ=255) | CAGGAGCAAGCGGGGTGCCAGCTTTCTTCGCGATGGCTGAAGTGGCCGGGCTAGAGGGCTCTGGT‑CGTGTTCGGGCAGGT‑TTTCACGGGTAGGGTGGCGAGACGCCGGGTGCCAGCGCCGGGCCTGCGTTGCCGAGACACTGAGACGCTGCGTCTCAAGCCAGCCGGTAATCACACAGTGCTTGTCGGGGCATGCCCAGAGGCGCTTAATGGCCGGACAACGATAAAAACAGTAACGAGAACCGGAGGGCCTGAATGCTTGCCGCGAACTCCCGAGCCCATGTGGACTGCGTCAG > NC_002947/646124‑646418 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |