Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 704,281 | A→C | 6.2% | Q125P (CAG→CCG) | PP_5745 → | paraquat‑inducible protein A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 704,281 | 0 | A | C | 6.2% | 199.8 / 4.2 | 65 | Q125P (CAG→CCG) | PP_5745 | paraquat‑inducible protein A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/30); new base C (2/2); total (33/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.06e-01 |
CCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCGAAGCCAACCTGGGC > NC_002947/704135‑704426 | accGGACATGATGGTGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGNCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGc > 1:109653/2‑149 (MQ=255) accGGACATGATGGTGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGc > 1:105775/2‑149 (MQ=255) acCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCTGCCGCCGCtgaa < 5:227849/149‑4 (MQ=255) ccATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCg < 3:150677/149‑1 (MQ=255) catcatGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCgg > 1:210911/1‑149 (MQ=255) atcatGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGc > 4:12383/1‑149 (MQ=255) atcatGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGc > 5:67282/1‑149 (MQ=255) tcatGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGcc > 4:252476/1‑149 (MQ=255) atcaCCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATAtt > 7:34698/1‑149 (MQ=255) aCCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGAt < 3:232575/149‑1 (MQ=255) aCCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGAt < 5:117722/149‑1 (MQ=255) ccTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGt < 3:12383/149‑1 (MQ=255) cTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTa < 6:67282/149‑1 (MQ=255) cTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCttt > 5:4995/1‑121 (MQ=255) cTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCttt < 6:4995/121‑1 (MQ=255) tCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGACATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGt > 5:303419/1‑144 (MQ=255) tCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGACATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGt < 6:303419/144‑1 (MQ=255) aCGGCATGTTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCGACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTGCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGTCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATc < 1:338320/149‑1 (MQ=255) gCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGaa < 8:66965/149‑1 (MQ=255) gCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGc > 3:272125/1‑133 (MQ=255) gCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGc < 4:272125/133‑1 (MQ=255) aTTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGgcg > 5:272099/1‑149 (MQ=255) aTTGCGGCTGTGGTGTTAATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGgcg > 1:79158/1‑149 (MQ=255) gtgtTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGc < 2:210911/148‑1 (MQ=255) tgtTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTg > 5:247483/1‑149 (MQ=255) gtTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTg > 7:216016/1‑148 (MQ=255) ttCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTg > 7:313966/1‑130 (MQ=255) ttCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTg < 8:313966/130‑1 (MQ=255) ttCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑a < 2:109653/149‑1 (MQ=255) ttCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑a < 2:105775/149‑1 (MQ=255) ccAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTc < 6:247483/149‑1 (MQ=255) tATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCa < 3:252476/149‑1 (MQ=255) ccTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTg > 8:248335/1‑149 (MQ=255) gTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGcc < 8:216016/147‑1 (MQ=255) cccAGGTTCAAGCTGGTGTGCTTCGGGTTGGTGTTGTAGTCCGTTCTGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGGAGCGGATATTGATGTAGCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCAtt < 2:152094/141‑1 (MQ=255) cccACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGGTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTCG‑‑ACATCTTCGTCAtt > 1:152094/1‑141 (MQ=255) cccACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCAtt < 2:146729/141‑1 (MQ=255) cccACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCAtt > 1:146729/1‑141 (MQ=255) cccACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCt < 2:330595/149‑1 (MQ=255) cccACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCt > 1:330595/1‑149 (MQ=255) ccACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTCCCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCtg > 8:316112/1‑149 (MQ=255) ccACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCtg > 1:135502/1‑149 (MQ=255) ccACGTACAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGTCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTCTTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCtg > 6:338612/1‑149 (MQ=255) cACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCtgg > 5:76367/1‑149 (MQ=255) cACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCtgg > 7:284935/1‑149 (MQ=255) aCGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCtggt < 7:316112/149‑1 (MQ=255) aaGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAg < 6:76367/148‑1 (MQ=255) aGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑Ac < 4:306183/119‑1 (MQ=255) aGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑Ac > 3:306183/1‑119 (MQ=255) gCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCtggtg < 5:70618/134‑1 (MQ=255) gCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCtggtg > 6:70618/1‑134 (MQ=255) cATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTg > 2:318118/1‑149 (MQ=255) ggCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATTCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGcc < 8:34698/148‑1 (MQ=255) cTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGc < 7:248335/149‑1 (MQ=255) tgttgtACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCtggt > 2:190698/1‑121 (MQ=255) gtACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGAAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCCCAGGAATAAGCTGGATAGATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAg > 1:112133/1‑149 (MQ=255) tACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAgtg < 8:284935/148‑1 (MQ=255) tACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAgtg < 6:272099/148‑1 (MQ=255) tCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCg > 6:31429/1‑148 (MQ=255) gccgaaaGCGGCTGCCGCCGCTTTCGGCGCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCg > 1:196530/7‑147 (MQ=255) ttCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAAt < 6:5105/133‑1 (MQ=255) ttCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAAt > 5:5105/1‑133 (MQ=255) aaaGCGGCTGCCGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAgtggt > 6:66166/3‑117 (MQ=255) aaaGCGGCTGCCGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAgtggt < 5:66166/115‑1 (MQ=255) ggcAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCGAAGCCAACCTGGgc < 5:31429/149‑1 (MQ=255) | CCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGG‑‑ACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCGAAGCCAACCTGGGC > NC_002947/704135‑704426 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |