Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 109,431 | A→G | 8.9% | N208D (AAC→GAC) | PP_0103 → | cytochrome c oxidase subunit 2 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 109,431 | 0 | A | G | 8.9% | 182.9 / 7.4 | 67 | N208D (AAC→GAC) | PP_0103 | cytochrome c oxidase subunit 2 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/27); new base G (3/3); total (37/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 |
TGAGCACTACCTGCTGGAAGTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAGCGCAAGG > NC_002947/109286‑109575 | tGAGCACTACCTGCTGGAAGTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACg < 4:27891/149‑1 (MQ=255) ccagcgggAAGTCGACCACCCGCTGGTGCGGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTGCCTGGTCACAGCTGCCGAGGTGAGCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCACAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTCGTTGACAAAGCCTgg < 6:355974/142‑1 (MQ=255) ctgGAAGTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCg > 1:66616/1‑149 (MQ=255) gAAGTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGAt > 2:72631/1‑149 (MQ=255) gTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCg > 8:170591/1‑148 (MQ=255) gACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGaaaa < 7:170591/149‑1 (MQ=255) gACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTCGTTGACAAAGCCTg > 3:191419/1‑134 (MQ=255) gACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTCGTTGACAAAGCCTg < 4:191419/134‑1 (MQ=255) ccAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGaaaa < 8:223761/147‑1 (MQ=255) ccAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGc < 2:35251/149‑1 (MQ=255) aGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGc > 4:315987/1‑147 (MQ=255) gCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAg < 4:24455/149‑1 (MQ=255) gTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTa > 5:210772/1‑149 (MQ=255) gctgcCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTCGTTGACAAAGCCTg < 4:650/120‑1 (MQ=255) gctgcCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTCGTTGACAAAGCCTg > 3:650/1‑120 (MQ=255) tgcCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACcgc > 6:330577/1‑149 (MQ=255) gTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCa < 6:210772/149‑1 (MQ=255) gggCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGc < 5:289765/145‑1 (MQ=255) gggCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGc > 6:289765/1‑145 (MQ=255) gcgcGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGCCGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGAGCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGc > 8:115736/1‑149 (MQ=255) gAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCAcc > 1:152210/1‑148 (MQ=255) tGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCt < 1:72631/149‑1 (MQ=255) cggcTTCCTGGGCCCTGCTGCGTATGTTTTCAATTCATGGGGGGTGCGGGCCTGCGGGTGAAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCtgt < 2:66616/147‑1 (MQ=255) ctcTTGCTGGTCACTGCTGCGTATTTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGGCATCCCAGGCTTTGTCAACGTAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCtgt < 2:152210/146‑1 (MQ=255) ttCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCgg > 6:49898/1‑149 (MQ=255) tGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAg > 1:272258/1‑149 (MQ=255) gTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGa < 5:293496/149‑1 (MQ=255) ctgctgCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTAAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGACAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGAcaaa > 8:135049/1‑146 (MQ=255) ttatgcCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCACATGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACg < 7:135049/146‑1 (MQ=255) tgctgcCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACg > 5:235801/1‑149 (MQ=255) tgcCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCt < 6:235801/149‑1 (MQ=255) gATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCAt > 4:164614/1‑149 (MQ=255) aTCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCggt > 6:269941/1‑149 (MQ=255) tCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCggtg < 3:164614/149‑1 (MQ=255) gatctcTGGTGGGGTCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGTCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCggtgg < 8:331160/143‑1 (MQ=255) aCTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGGCGACGCCATCCAAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCggtggt > 1:222977/1‑149 (MQ=255) tCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCggtggtggt > 1:135124/1‑149 (MQ=255) tggtggGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGTA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGATTCATGCCcgtgggagatc > 7:331160/1‑142 (MQ=255) tggtggGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTc > 6:302894/1‑147 (MQ=255) tggtggGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCACTGCACCGCGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTTGTc > 8:79425/1‑147 (MQ=255) ggtgCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCAcc < 8:254087/100‑1 (MQ=255) ggtgCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCAcc > 7:254087/1‑100 (MQ=255) gtgCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCaa < 2:222977/149‑1 (MQ=255) ggCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCa < 5:269941/149‑1 (MQ=255) ttCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCaa > 1:197312/1‑104 (MQ=255) ttCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCaa < 2:197312/104‑1 (MQ=255) ttCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGc > 6:21087/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGc > 6:300122/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGc > 4:150480/1‑149 (MQ=255) cgcgGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCATCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGc < 3:315987/147‑1 (MQ=255) cgcgGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCg > 1:56899/1‑148 (MQ=255) gcgGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGa < 3:150480/149‑1 (MQ=255) ggTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGAtt < 2:56899/149‑1 (MQ=255) aaaC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACg > 2:265581/1‑148 (MQ=255) aaaC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGa > 5:117003/1‑149 (MQ=255) aC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGaca > 3:156075/1‑149 (MQ=255) aC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGaca > 8:179021/1‑149 (MQ=255) gcgACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACAcc > 4:287722/1‑149 (MQ=255) ccATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCtt < 5:330577/149‑1 (MQ=255) ggtccAGGCTTCGTTGACAAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTgg > 3:182857/4‑149 (MQ=255) ccAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGc > 4:175490/1‑147 (MQ=255) aGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAgc > 6:152728/1‑149 (MQ=255) gCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGAGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAgcg > 5:237692/1‑148 (MQ=255) tGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAGCGCaa < 5:300122/147‑1 (MQ=255) tGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAGCGCaa < 5:21087/147‑1 (MQ=255) gTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAGCGCAAgg < 1:265581/148‑1 (MQ=255) gTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAGCGCAAgg < 3:287722/148‑1 (MQ=255) | TGAGCACTACCTGCTGGAAGTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAAC‑GCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGA‑CCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAGCGCAAGG > NC_002947/109286‑109575 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |