Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 945,967 | C→A | 5.7% | E468* (GAA→TAA) ‡ | norR ← | DNA‑binding transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 945,967 | 0 | C | A | 5.7% | 226.3 / 3.4 | 70 | E468* (GAA→TAA) ‡ | norR | DNA‑binding transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/31); new base A (2/2); total (37/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.46e-01 |
GCCCTAGCCTGCGGGCCAAACGGCTCAGGTTTGCGCGGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAGGGTGCTGGCCCAGCGCCTTGAGTGCCGAGC > NC_002947/945820‑946113 | gCCCTAGCCTGCGGGCCAAACGGCTCAGGTTTGCGCGGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCa < 5:148300/149‑1 (MQ=255) gCCCTAGCCTGCGGGCCAAACGGCTCAGGTTTGCGCGGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCa < 8:19931/149‑1 (MQ=255) tGCGGGCCAAACGGCTCAGGTTTGCGCGGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGgtgt > 8:230032/1‑148 (MQ=255) tGCGGGCCAAACGGCTCAGGTTTGCGCGGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGtgtg > 5:352009/1‑149 (MQ=255) tCAGGTTTGCGCGGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTtgcagcggt > 2:276904/1‑149 (MQ=255) ttGCGCGGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTtgcagcggtgcagcg > 4:172219/1‑149 (MQ=255) cgcgGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTCACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTTCAGCggg < 7:230032/148‑1 (MQ=255) cgcgGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTGAAGGCggc < 4:49931/122‑2 (MQ=255) cgcgGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTGAAGGCggc > 7:240160/1‑121 (MQ=255) cgcgGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTGAAGGCggc > 3:49931/1‑121 (MQ=255) cgcgGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTGAAGGCggc < 8:240160/122‑2 (MQ=255) cgGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGa < 6:352009/149‑1 (MQ=255) ggTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAg < 6:229932/149‑1 (MQ=255) gTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCACAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAgg < 7:258229/149‑1 (MQ=255) aGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAg > 2:198777/1‑149 (MQ=255) aCCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCg > 7:277845/1‑149 (MQ=255) cGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTc > 2:33281/1‑95 (MQ=255) cGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTc < 1:33281/95‑1 (MQ=255) gCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTtgca > 8:202026/1‑112 (MQ=255) gCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTtgca < 7:202026/112‑1 (MQ=255) tgcCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGc > 7:259771/1‑144 (MQ=255) tgcCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGc < 8:259771/144‑1 (MQ=255) ccAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGacacac < 8:188738/149‑1 (MQ=255) ccAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGacacac > 7:135071/1‑149 (MQ=255) ccAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGacacac > 7:188738/1‑149 (MQ=255) gTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGcaggt > 5:15266/1‑149 (MQ=255) tCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGcaggtc > 1:221212/1‑149 (MQ=255) gATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGcaggtccagg > 8:278031/1‑149 (MQ=255) gATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGc > 3:310970/1‑140 (MQ=255) gATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGc < 4:310970/140‑1 (MQ=255) aTGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGcaggtccaggt < 7:158917/149‑1 (MQ=255) ccGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGa < 8:277845/149‑1 (MQ=255) cGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCGTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGAt < 2:221212/149‑1 (MQ=255) tGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGc > 2:18049/1‑149 (MQ=255) ggcaggcTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTc > 1:310712/1‑148 (MQ=255) caggcTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAg < 1:18049/149‑1 (MQ=255) aggcTTCGATCACCTGTCTCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCATCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAgg < 6:333328/149‑1 (MQ=255) gcTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGt < 1:276904/149‑1 (MQ=255) ttCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGt > 5:55328/1‑147 (MQ=255) ccTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGt > 3:131541/1‑149 (MQ=255) ccTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGt < 8:135071/149‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGtt > 6:196130/1‑100 (MQ=255) cTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGtt < 5:196130/100‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGAGGTGCAGCCGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCCATGGCTTCGAGGGTGAGGATACgag > 5:283043/1‑147 (MQ=255) gTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGAGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGCGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACTCACGCAGCTCCAGGTCGATGGCTTCCAGGGTGACGAAACGTGTCCGATCAg > 8:132114/1‑149 (MQ=255) aaCTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAggg > 5:263510/1‑149 (MQ=255) tCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGAt > 6:242711/1‑128 (MQ=255) tCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGAt < 5:242711/128‑1 (MQ=255) tCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAGGGTGc < 6:15266/147‑1 (MQ=255) tCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAGGGTGCTg < 4:131541/149‑1 (MQ=255) ggCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGa > 4:310329/1‑119 (MQ=255) ggCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGa < 3:310329/119‑1 (MQ=255) ggCTGCACGCTAGGCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGGTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGTTAGGTGGGCGATCAGGGGGCTGGCCCa < 6:283043/149‑1 (MQ=255) ttCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAGGGTGCTGGCCCAgcg > 4:161873/1‑149 (MQ=255) cACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGACGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAgg < 7:18890/133‑1 (MQ=255) cACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGACGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAgg > 8:18890/1‑133 (MQ=255) aCGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAGGGTGCTgg < 4:96320/139‑1 (MQ=255) aCGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAGGGTGCTgg > 3:96320/1‑139 (MQ=255) aCGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAGGGTGCTGGCCCAGCGCCt > 7:111575/1‑149 (MQ=255) cGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAGGGTGCTGGCCCAGCGCCtt < 3:161873/149‑1 (MQ=255) gCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCTACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGa > 8:286220/1‑111 (MQ=255) gCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAGGGTGCTGGCCCAGCGCCtt > 1:131906/1‑148 (MQ=255) gCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAGGGTGCTGGCCCAGCGCCtt > 3:254279/1‑148 (MQ=255) gCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCCACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGa < 7:286220/111‑1 (MQ=255) aaGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAGGGTGCTGGCCCAGCGCCTTGAg < 6:55328/149‑1 (MQ=255) aGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCAGTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAGGGTGCTGGCCCAGCGCCTTGAGt < 7:278031/149‑1 (MQ=255) gccgccTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAGGGTGCTGGCCCAGCGCCTTGAGTg > 3:314080/1‑149 (MQ=255) ccgccTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAgg < 2:236115/125‑1 (MQ=255) ccgccTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAgg > 1:236115/1‑125 (MQ=255) cgccTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATc < 7:317583/121‑1 (MQ=255) cgccTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATc > 8:317583/1‑121 (MQ=255) ttCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAGGGTGCTGGCCCAGCGCCTTGAGTGCCGAGc > 4:314005/1‑149 (MQ=255) | GCCCTAGCCTGCGGGCCAAACGGCTCAGGTTTGCGCGGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCTGGCGTGGTTGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGGGTGAGGATACGTGGCCGATCAGGGTGCTGGCCCAGCGCCTTGAGTGCCGAGC > NC_002947/945820‑946113 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |