| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,048,985 | G→T | 6.2% | Y205* (TAC→TAA) ‡ | PP_0907 ← | RND transporter membrane fusion protein‑like protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,048,985 | 0 | G | T | 6.2% | 236.9 / 2.9 | 74 | Y205* (TAC→TAA) ‡ | PP_0907 | RND transporter membrane fusion protein‑like protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/35); new base T (2/3); total (36/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGGGAAGCGCTGACCCGGGTAGGCGGCCACTTGCACCAGCACCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGA > NC_002947/1048838‑1049133 | ggggAAGCGCTGACCCGGGTAGGCGGCCACTTGCACCAGCACCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAgg > 2:197096/1‑148 (MQ=255) gggAAGCGCTGACCCGGGTAGGCGGCCACTTGCACCAGCACCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTa < 2:83302/149‑1 (MQ=255) aGCGCTGACCCGGGTAGGCGGCCACTTGCACCAGCACCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTgg < 6:75729/149‑1 (MQ=255) cTGACCCGGGTAGGCGGCCACTTGCACCAGCACCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGa < 8:238490/149‑1 (MQ=255) cggcCACTTGCACCAGCACCTGCTGGCCCACGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAc‑catcgg > 1:29463/1‑143 (MQ=255) gcCACTTGCACCAGCACCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGAt > 8:192944/1‑149 (MQ=255) cACTTGCACCAGCACCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGc < 7:192944/149‑1 (MQ=255) cACTTGCACCAGCACCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGc > 8:331291/1‑149 (MQ=255) aCTTGCACCAGCACCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGcc > 4:171453/1‑149 (MQ=255) ttGCACCAGCACCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGa > 4:273336/1‑149 (MQ=255) aCCAGCACCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGt < 7:331291/149‑1 (MQ=255) aCCAGCACCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGt > 6:229536/1‑149 (MQ=255) aCCAGCACCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGt > 3:250026/1‑149 (MQ=255) ccAGCACCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTTTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTg > 7:95081/1‑149 (MQ=255) cACCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGAt > 1:333930/1‑120 (MQ=255) cACCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGAt < 2:333930/120‑1 (MQ=255) aCCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGAt < 7:19746/140‑1 (MQ=255) aCCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGAt > 8:19746/1‑140 (MQ=255) ctgGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCACGCTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGaaa < 1:197096/149‑1 (MQ=255) ctgGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAg > 5:3434/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGt < 6:3434/148‑1 (MQ=255) gCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTg < 2:340378/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCa < 3:273336/149‑1 (MQ=255) cTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGAt < 7:243058/149‑1 (MQ=255) tCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGt < 8:304982/140‑1 (MQ=255) tCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATg > 3:101276/1‑149 (MQ=255) tCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTCCCGCTGAAAGGt > 7:304982/1‑140 (MQ=255) ggTGTGGCAGCGCCTGTTCAGGAACGTTGAATTCTACGTACAGGCTGTAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGTTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGt < 2:32029/149‑1 (MQ=255) gtgGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTc > 2:310604/1‑149 (MQ=255) ggCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCtt > 2:253635/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGa < 3:171453/149‑1 (MQ=255) gcCTGTTCCGGCACGTTTAAGTCTACTTACAGGCTGGAGGTGTCTTTCAGGGTGGCGATCACTGTGCGGGCGGCATGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTg < 6:241004/127‑1 (MQ=255) gcCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTg > 5:241004/1‑127 (MQ=255) ccTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGAtcttc < 5:229536/149‑1 (MQ=255) tGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGACAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATAGATGCGTTTCTTGATCTTCTg > 7:275686/1‑149 (MQ=255) tGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGTTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAgctgc > 6:76363/1‑149 (MQ=255) tGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAgctgc > 2:9745/1‑149 (MQ=255) tCTAGGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGTGTGGCGATCACATTTCCGGCGGCGAGGTACTGGACTATGTCCTT‑CTGGCGGATGCAGAGGGTGGCTCTGAAAGGTGCATTGATTCGTTTCTTGTTCTTGTGCGCCTTATGCTGCTCGac < 4:250026/149‑1 (MQ=255) tACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGAtctt < 5:260754/126‑1 (MQ=255) tACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGAtctt > 6:260754/1‑126 (MQ=255) aCGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGGAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTg < 5:47271/120‑1 (MQ=255) aCGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTg > 6:47271/1‑120 (MQ=255) cAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGcc < 1:9745/148‑1 (MQ=255) gCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGt > 7:265800/1‑149 (MQ=255) gAGGTGTCTTGCAGGGTGGCTATCACAGTGGCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTgc < 7:144330/148‑1 (MQ=255) aGGTGTCTTTCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGTAATGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTgcgc < 6:88371/149‑1 (MQ=255) aGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTgcgc > 1:94809/1‑149 (MQ=255) aGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTgcgc < 4:101276/149‑1 (MQ=255) ggTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGcc > 5:26039/1‑149 (MQ=255) gtgtCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCg < 2:94809/149‑1 (MQ=255) gtgtCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCg > 2:5574/1‑149 (MQ=255) ttGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACt > 2:272797/1‑149 (MQ=255) cAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTggg < 8:265800/149‑1 (MQ=255) cAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTgg < 1:310604/148‑1 (MQ=255) aGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGgga < 1:253635/149‑1 (MQ=255) aGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCACTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTgg > 4:111410/1‑147 (MQ=255) gggTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGcc > 6:47347/1‑138 (MQ=255) gggTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGcc < 5:47347/138‑1 (MQ=255) ggTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGac > 6:69695/1‑120 (MQ=255) ggTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGac < 5:69695/120‑1 (MQ=255) gCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAg > 7:218106/1‑149 (MQ=255) gCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCACTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAg < 3:111410/149‑1 (MQ=255) 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cggcggCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAgg < 1:135962/137‑1 (MQ=255) ggcggcCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTcgc > 5:324677/1‑149 (MQ=255) atcggcCAGTACCTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTgg > 6:79823/3‑127 (MQ=255) atcggcCAGTACCTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTgg < 5:79823/125‑1 (MQ=255) atcggcCAGTACCTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTcgc < 7:333273/147‑1 (MQ=255) atcggcCAGTACCTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTcgc > 8:333273/3‑149 (MQ=255) gcggcCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTcgcc < 6:281499/149‑1 (MQ=255) gcggcCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTcgcc > 5:281499/1‑149 (MQ=255) gTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGGATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGgaga < 6:324677/149‑1 (MQ=255) | GGGGAAGCGCTGACCCGGGTAGGCGGCCACTTGCACCAGCACCTGCTGGCCCAGGCTCAGGTGTGGCAGCGCCTGTTCCGGCACGTTGAAGTCTACGTACAGGCTGGAGGTGTCTTGCAGGGTGGCGATCACAGTGCCGGCGGCCAGGTACTGGCCGATGTCCAC‑CTGGCGGATGCCGATGGTGCCGCTGAAAGGTGCATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGA > NC_002947/1048838‑1049133 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |