| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,366,232 | C→G | 5.7% | L156L (CTG→CTC) | PP_1191 ← | S4 domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,366,232 | 0 | C | G | 5.7% | 227.1 / 4.2 | 70 | L156L (CTG→CTC) | PP_1191 | S4 domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/32); new base G (2/2); total (36/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.11e-01 | |||||||||||
AGGCGCAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCA > NC_002947/1366089‑1366378 | aGGCGCAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAgcgc > 4:56469/1‑149 (MQ=255) cgcAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTg < 2:264172/149‑1 (MQ=255) cAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTggg < 3:56469/149‑1 (MQ=255) cAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGCTGGAACGCCTggc < 3:5242/149‑2 (MQ=255) aGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTgggg > 1:263106/1‑149 (MQ=255) aGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTgggg < 6:325325/149‑1 (MQ=255) gTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTgggggg < 4:78657/149‑1 (MQ=255) aGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGgg‑tg > 2:213136/1‑149 (MQ=255) aGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGgg‑tg > 7:330131/1‑149 (MQ=255) ggCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGgg‑tg < 7:94528/148‑1 (MQ=255) ggCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGgg‑tg < 2:263106/148‑1 (MQ=255) gcATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGgg‑tggt > 4:260306/1‑147 (MQ=255) gcATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGgg‑tggt < 3:260306/147‑1 (MQ=255) tAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTcgc < 2:343824/149‑1 (MQ=255) gCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTcgcc < 1:213136/148‑1 (MQ=255) ggAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCgcgc < 8:330131/148‑1 (MQ=255) gAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCCCCAGGCGCTGGAACGCCTggc > 6:28597/1‑129 (MQ=255) gAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCCCCAGGCGCTGGAACGCCTggc < 5:28597/130‑2 (MQ=255) tGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAat > 6:163933/1‑149 (MQ=255) tCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCaa < 6:309321/146‑1 (MQ=255) tCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAatga > 8:42557/1‑149 (MQ=255) cTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAatgatg < 1:303005/149‑1 (MQ=255) tgtgGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGTCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAatg > 4:87617/1‑141 (MQ=255) tgtgGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGTCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAatg < 3:87617/141‑1 (MQ=255) tgGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCt > 5:208765/1‑149 (MQ=255) ggTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGc < 5:163933/149‑1 (MQ=255) gTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTcc > 5:96027/1‑100 (MQ=255) gTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTcc < 6:96027/100‑1 (MQ=255) ttttCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTc > 8:140015/1‑148 (MQ=255) aaCACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCGACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGc > 6:87375/1‑148 (MQ=255) aaCACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAAc < 6:301179/135‑1 (MQ=255) aaCACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAAc > 5:301179/1‑135 (MQ=255) acacCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGa > 4:330311/1‑149 (MQ=255) acCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCt < 4:337415/97‑1 (MQ=255) acCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCt > 3:337415/1‑97 (MQ=255) ccATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAat < 8:98057/124‑1 (MQ=255) ccATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAat > 7:98057/1‑124 (MQ=255) cATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTggggg > 2:183873/1‑100 (MQ=255) cgcAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGt < 3:330311/148‑1 (MQ=255) gcAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCg > 4:331094/1‑149 (MQ=255) ggTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGcc < 7:140015/149‑1 (MQ=255) gTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGc < 3:331094/149‑1 (MQ=255) tGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGa > 7:174200/1‑149 (MQ=255) gCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGa > 5:239319/1‑148 (MQ=255) tggccttggcctTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGa < 8:288970/116‑1 (MQ=255) tggccttggcctTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGa > 7:288970/1‑116 (MQ=255) tggccttggcctTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGc < 8:174200/149‑1 (MQ=255) ccttggccttggGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGc > 1:288763/1‑111 (MQ=255) ccttggccttggGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGc < 2:288763/111‑1 (MQ=255) ccgtggGCAACTCGCGGGCAGTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTgg < 6:302222/146‑1 (MQ=255) cttggGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTggg > 6:290546/1‑149 (MQ=255) ttggGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTggg > 3:94495/1‑148 (MQ=255) ttggGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTgg < 5:244702/147‑1 (MQ=255) ttggGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTgg > 6:244702/1‑147 (MQ=255) aaCTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTaaa > 8:304339/1‑146 (MQ=255) aaCTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTaaa > 8:299555/1‑146 (MQ=255) aaCTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTaaa < 7:299555/146‑1 (MQ=255) aaCTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTaaa < 7:304339/146‑1 (MQ=255) tCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGc < 4:231038/129‑1 (MQ=255) tCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGc > 3:231038/1‑129 (MQ=255) tCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTg > 1:130851/1‑149 (MQ=255) gcgGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGc < 7:232763/116‑1 (MQ=255) gcgGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGc > 8:232763/1‑116 (MQ=255) gcgGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTg > 6:81095/1‑147 (MQ=255) gcgGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGc < 6:239319/148‑1 (MQ=255) gcATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGgcg > 7:137115/1‑149 (MQ=255) aTGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGATGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCCCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGgcgc > 1:64001/1‑149 (MQ=255) aTGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGgcgc > 7:20815/1‑148 (MQ=255) ccACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTc < 2:130851/149‑1 (MQ=255) cgcCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCg < 8:137115/149‑1 (MQ=255) ccccAGGCGCTGGAACGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCg > 4:282820/3‑149 (MQ=255) gcCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCgg > 6:266641/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCa < 5:87375/148‑1 (MQ=255) | AGGCGCAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGG‑TGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCA > NC_002947/1366089‑1366378 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |