| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,592,302 | T→A | 6.5% | G69G (GGT→GGA) | PP_1396 → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,592,302 | 0 | T | A | 6.5% | 181.2 / 3.0 | 61 | G69G (GGT→GGA) | PP_1396 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/29); new base A (2/2); total (30/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.78e-01 | |||||||||||
GCAGAGCTGGGCGCGCGCCTGCGTGACCTGCTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGATGAGGTAAAGTGACGCTCTTGTTCAACAACCCGGACAGCAACATGGCACGTAG > NC_002947/1592156‑1592449 | gCAGAGCTGGGCGCGCGCCTGCGTGACCTGCTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTa < 5:186898/149‑1 (MQ=255) agagCTGGGCGCGCGCCTGCGTGACCTGCTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGtt > 4:319818/1‑146 (MQ=255) agagCTGGGCGCGCGCCTGCGTGACCTGCTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGtt < 3:319818/146‑1 (MQ=255) agagCTGGGCGCGCGCCTGCGTGACCTGCTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACt > 8:128012/1‑149 (MQ=255) cTGGGCGCGCGCCTGCGTGACCTGCTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACtt > 4:15655/1‑146 (MQ=255) cTGGGCGCGCGCCTGCGTGACCTGCTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACtt < 3:15655/146‑1 (MQ=255) gCGTGACCTGCTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTc < 5:198353/138‑1 (MQ=255) gCGTGACCTGCTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTc > 6:198353/1‑138 (MQ=255) cGTGACCTGCTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTg < 7:128012/147‑1 (MQ=255) gTGACCTGCTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAg < 1:130534/149‑1 (MQ=255) gTGACCTGCTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAg < 1:72821/149‑1 (MQ=255) gACCTGCTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAg < 5:255181/147‑1 (MQ=255) tGCTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGt > 4:276757/1‑119 (MQ=255) tGCTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGt < 3:276757/119‑1 (MQ=255) tGCTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTg < 8:153268/126‑1 (MQ=255) tGCTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTg > 7:153268/1‑126 (MQ=255) cTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCg < 6:83996/148‑1 (MQ=255) gCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCg < 7:123170/143‑1 (MQ=255) gCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCg > 8:123170/1‑143 (MQ=255) cTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCATCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAg < 4:51884/133‑1 (MQ=255) cTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGcc < 6:238836/123‑1 (MQ=255) cTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAg > 3:51884/1‑133 (MQ=255) tCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGt > 2:270675/1‑149 (MQ=255) cacCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCCGCGTTCTCAGGCGGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAg < 5:330873/149‑1 (MQ=255) ccGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGCGTAAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAgg > 1:274134/1‑149 (MQ=255) ccTGAGTTTTAGCGTGCAGCGTTCTCTGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGATGCTGGCAGGACCAGCATGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTcagc < 5:73481/148‑1 (MQ=255) ccTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGTAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTCACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGc < 6:31282/135‑1 (MQ=255) ccTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGTAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTCACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGc > 5:31282/1‑135 (MQ=255) ccTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTcag > 2:236839/1‑147 (MQ=255) tGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCagcagc > 2:327729/1‑149 (MQ=255) gTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGACCTCTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGc < 1:270675/149‑1 (MQ=255) gTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGATACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCa > 5:7771/1‑149 (MQ=255) gTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGATACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCa > 5:2778/1‑149 (MQ=255) ctcAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAACCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGAc > 7:10292/1‑149 (MQ=255) gCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTg > 1:312547/1‑146 (MQ=255) gCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTg < 2:312547/146‑1 (MQ=255) tGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGt > 8:190990/1‑149 (MQ=255) aTGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCTATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTg < 3:40924/148‑1 (MQ=255) aTGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTg < 1:327729/148‑1 (MQ=255) gCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAg > 7:153136/1‑105 (MQ=255) cTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGAt > 1:191680/1‑148 (MQ=255) gACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTg > 1:339208/1‑123 (MQ=255) gACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTg < 2:339208/123‑1 (MQ=255) tgtgGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGATGAGGTa > 3:282057/1‑148 (MQ=255) tgGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGATGAGGTAAAg < 7:190990/149‑1 (MQ=255) tgGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGATACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGATGAGGTaaa < 6:7771/148‑1 (MQ=255) tgGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGATACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGATGAGGTaaa < 6:2778/148‑1 (MQ=255) tCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTgg > 3:47262/1‑131 (MQ=255) tCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTgg < 4:47262/131‑1 (MQ=255) tCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGATGAGGTAAAGTGACGct > 6:310228/1‑149 (MQ=255) aGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAg > 6:172275/1‑60 (MQ=255) aGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGATGAGGTAAAGTGACg > 5:286503/1‑145 (MQ=255) aGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGATGAGGTAAAGTGACg < 6:286503/145‑1 (MQ=255) ggAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGATGAGGTAAAGTGACGCTCTTGt < 1:236839/149‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGATGAGGTAAAGTGACGCTCTTGtt > 7:174204/1‑149 (MQ=255) aaGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCATCGACTGAGCGTGGATGAGGTAAAGt > 2:217208/1‑136 (MQ=255) aaGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCATCGACTGAGCGTGGATGAGGTAAAGt < 1:217208/136‑1 (MQ=255) aGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACt < 4:129216/108‑1 (MQ=255) aGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACt > 3:129216/1‑108 (MQ=255) gACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGATGAGGTAAAGTGACGCTCTTGTTCAACAACCCg > 1:49600/1‑148 (MQ=255) ccAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGATGAGGTAAAGTGACGCTCTTGTTCAACAACCCGGa > 3:22036/1‑148 (MQ=255) agcagGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGACGAGGTAAAGTGACGCTCTTGTTCAACAAGCCGGTCAg < 8:10292/149‑1 (MQ=255) gcagGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGATGAgg > 6:345928/1‑115 (MQ=255) gcagGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGATGAgg < 5:345928/115‑1 (MQ=255) gTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGATGAGGTAAAGTGACGCTCTTGTTCAACAACCCGGACAGCAACATGGCACGTAg < 8:174204/149‑1 (MQ=255) ttACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGATGAGGTAAAGTGACGCTCTTGTTCAACAACCCGGACAGCAACATg < 1:54466/140‑1 (MQ=255) ttACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGATGAGGTAAAGTGACGCTCTTGTTCAACAACCCGGACAGCAACATg > 2:54466/1‑140 (MQ=255) | GCAGAGCTGGGCGCGCGCCTGCGTGACCTGCTCGAGCCCTCGCTGCGTACACCGGGTTGCCTGAGTTTTACCGTGCAGCGTTCTCAGGCTGATGCTGACCTGTGGTTGC‑TCAGCGGAAGCTGGCAGGACCAGCAGGCGATGAGTGGTTACTTTGCTTCGCCGA‑CACTGGAGGTGTTCGGTGAACTGGTGCAGGCCCAGGTGGTCAGCAGCCTGGACTTGCATACCTTCGACTGAGCGTGGATGAGGTAAAGTGACGCTCTTGTTCAACAACCCGGACAGCAACATGGCACGTAG > NC_002947/1592156‑1592449 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |