| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,637,212 | T→C | 5.8% | L221P (CTG→CCG) | pdxJ → | pyridoxine 5'‑phosphate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,637,212 | 0 | T | C | 5.8% | 202.4 / 2.1 | 69 | L221P (CTG→CCG) | pdxJ | pyridoxine 5'‑phosphate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/29); new base C (2/2); total (38/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
CTGAAGAGCTCAAGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCGGCCGATCA > NC_002947/1637065‑1637359 | cTGAAGAGCTCAAGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCtg > 4:40785/1‑149 (MQ=255) gCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCt < 7:189381/149‑1 (MQ=255) cGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCCCGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCtt < 5:178473/149‑1 (MQ=255) gATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATg < 4:223258/143‑1 (MQ=255) gATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATg > 3:223258/1‑143 (MQ=255) gTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGgctg > 4:150884/1‑149 (MQ=255) cGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGGCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTgg < 5:233539/149‑1 (MQ=255) gggCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCTTTGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCga < 1:107954/149‑1 (MQ=255) aTGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGAGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGAt > 1:325978/1‑148 (MQ=255) aTCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGa < 1:343057/142‑1 (MQ=255) aTCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGa > 2:343057/1‑142 (MQ=255) tCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCAt > 1:236425/1‑98 (MQ=255) tCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCAt < 2:236425/98‑1 (MQ=255) tCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATc > 7:82088/1‑149 (MQ=255) tCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATc > 7:287001/1‑149 (MQ=255) tGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTgg > 3:274803/1‑149 (MQ=255) aCGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTcg > 5:54247/1‑149 (MQ=255) cATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGAtt < 3:150884/149‑1 (MQ=255) cATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGAtt > 3:153965/1‑149 (MQ=255) aTTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCa > 6:336333/1‑96 (MQ=255) aTTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCa < 5:336333/96‑1 (MQ=255) aTTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCCGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTggc > 3:252663/1‑133 (MQ=255) aTTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCCGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTggc > 7:110283/1‑133 (MQ=255) aTTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCCGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTggc < 8:110283/133‑1 (MQ=255) aTTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCCGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTggc < 4:252663/133‑1 (MQ=255) ttACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGgctgct < 8:151160/103‑1 (MQ=255) ttACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGgctgct > 7:151160/1‑103 (MQ=255) ttACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGAttgt > 1:48471/1‑149 (MQ=255) ttACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGAttgt > 3:255481/1‑149 (MQ=255) aCCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGAttgtt < 4:274803/148‑1 (MQ=255) ccACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCt > 1:216348/1‑89 (MQ=255) ccACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCt < 2:216348/89‑1 (MQ=255) cacaACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGt > 2:60822/1‑149 (MQ=255) acaACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTc < 2:325978/149‑1 (MQ=255) tCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTg > 7:65556/1‑148 (MQ=255) tCGAGGCGGTCGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCATTGT‑TTGTAGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATGGTg > 6:224328/1‑119 (MQ=255) cGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATc < 7:244682/115‑1 (MQ=255) cGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATc > 8:244682/1‑115 (MQ=255) gTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAAAATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGAttgttc > 6:139738/1‑131 (MQ=255) ggcgATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGTGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTcg > 2:19665/1‑149 (MQ=255) ggcgATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTcg > 5:173196/1‑149 (MQ=255) gATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCgg < 4:255481/149‑1 (MQ=255) gATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCgg < 2:48471/149‑1 (MQ=255) gATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCgg < 8:287001/149‑1 (MQ=255) tATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCcg < 6:173196/149‑1 (MQ=255) cAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTGTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCcgc > 1:72673/1‑148 (MQ=255) aaTGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTcgcg > 5:7606/1‑101 (MQ=255) aaTGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTcgcg > 1:333209/1‑101 (MQ=255) aaTGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTcgcg < 6:7606/101‑1 (MQ=255) aaTGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTcgcg < 2:333209/101‑1 (MQ=255) aaTGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGAttgttg < 7:75478/111‑1 (MQ=255) aaTGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGAttgttg > 8:75478/1‑111 (MQ=255) aTGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCg < 5:93019/123‑1 (MQ=255) aTGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCg > 6:93019/1‑123 (MQ=255) aTGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCcgcg > 8:99179/1‑146 (MQ=255) aTGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑ATGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAag > 3:263765/1‑149 (MQ=255) tGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCgg < 6:294133/134‑1 (MQ=255) tGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCgg > 5:294133/1‑134 (MQ=255) tGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAaga < 7:99179/149‑1 (MQ=255) aGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCTTGCCCGCGAaaag < 8:65556/148‑1 (MQ=255) aGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAagag < 8:82088/148‑1 (MQ=255) aGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGCCGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAaaag < 4:153965/148‑1 (MQ=38) aGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTAGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTc > 6:217344/1‑110 (MQ=255) aaCATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCAg > 2:16478/1‑148 (MQ=255) cATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCAGca > 4:139336/1‑148 (MQ=255) aTTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCAGca > 2:326326/1‑147 (MQ=255) gCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTcgc < 7:207472/118‑1 (MQ=255) gCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTcgc > 8:207472/1‑118 (MQ=255) cATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑ATGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAggcggc < 4:263765/149‑1 (MQ=255) cTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCGGCCGATCa > 1:183573/1‑149 (MQ=255) | CTGAAGAGCTCAAGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGT‑TTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAGGCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCGGCCGATCA > NC_002947/1637065‑1637359 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |