Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,657,941 | G→C | 5.5% | P185A (CCA→GCA) | PP_1450 ← | TPS family activation/secretion protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,657,941 | 0 | G | C | 5.5% | 236.8 / 3.0 | 72 | P185A (CCA→GCA) | PP_1450 | TPS family activation/secretion protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/36); new base C (2/2); total (34/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 |
GTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAATGACGATGTCCAACGGCATGCCCTCTGCTGGGGGCTGGCGCAGGTAGGGGCGG > NC_002947/1657795‑1658083 | gTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGATCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCt > 4:209783/1‑149 (MQ=255) gTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGc < 7:103377/149‑1 (MQ=255) gAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGCCTTCCCAGGcct > 4:47787/1‑147 (MQ=255) aaGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAgg > 8:116477/1‑149 (MQ=255) gCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGcc < 4:112058/149‑1 (MQ=255) ttGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGCCACTGTACCTGcccgaccttg < 2:251151/141‑8 (MQ=255) ttGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGCCACTGTACCTGcccgaccttg > 1:251151/1‑134 (MQ=255) gcaaggttGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAgg < 3:44971/142‑1 (MQ=255) gCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGaa < 7:116477/147‑1 (MQ=255) cccGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCGGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAgg < 7:122843/148‑1 (MQ=255) ccGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCa > 3:88333/1‑149 (MQ=255) gCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTg < 1:51710/149‑1 (MQ=255) gCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGATCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTg < 3:209783/149‑1 (MQ=255) cTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGCCTTCCCAGGCCTGCTTGGGCAGCCACTgt < 3:47787/149‑2 (MQ=38) cACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGgaga < 3:47235/149‑1 (MQ=255) cACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGga < 4:88333/147‑1 (MQ=255) cACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGga > 8:151977/1‑147 (MQ=255) aCGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGga > 3:79350/1‑146 (MQ=255) gACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGCGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGgaga > 7:312699/1‑146 (MQ=255) gACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGgagagag < 4:80193/149‑1 (MQ=255) aCGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAg < 4:333478/149‑1 (MQ=255) aCGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAg > 5:233511/1‑149 (MQ=255) aCGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAg < 6:233511/149‑1 (MQ=255) cgcgGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAgg < 7:151977/149‑1 (MQ=255) gcgGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAggg > 2:75619/1‑149 (MQ=255) gTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAg > 6:195415/1‑149 (MQ=255) ccgccCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCTGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTc > 7:185610/1‑149 (MQ=255) cgccCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGgaga > 6:222748/1‑132 (MQ=255) cgccCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGgaga > 6:4588/1‑132 (MQ=255) cgccCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGgaga < 5:4588/132‑1 (MQ=255) cgccCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGgaga < 5:222748/132‑1 (MQ=255) cgccCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCg > 4:138621/1‑149 (MQ=255) cccTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCggg < 3:138621/149‑1 (MQ=255) cTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGgc < 8:185610/149‑1 (MQ=255) tGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAgg < 2:237143/135‑1 (MQ=255) tGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAgg > 1:237143/1‑135 (MQ=255) gCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGtt < 5:195415/149‑1 (MQ=255) ggCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGAt < 4:79350/149‑1 (MQ=255) gcaAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGgagagaga > 3:275054/1‑115 (MQ=255) gcaAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGgagagaga < 4:275054/115‑1 (MQ=255) ggTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGa > 8:172148/1‑149 (MQ=255) gcgcCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACaaa < 1:75619/149‑1 (MQ=255) gcgcCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACaaa < 7:325985/149‑1 (MQ=255) gcgcCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACa > 6:150219/1‑147 (MQ=255) gcCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCaa > 8:278988/1‑77 (MQ=255) gcCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCaa < 7:278988/77‑1 (MQ=255) cccAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGTCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGcc > 8:220655/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCt > 7:141152/1‑149 (MQ=255) aGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTc < 8:312699/149‑1 (MQ=255) cATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGTCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGa < 7:220655/147‑1 (MQ=255) aTAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGgccagcca > 5:261471/1‑119 (MQ=255) aTAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGgccagcca < 6:261471/119‑1 (MQ=255) tAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAAt < 5:150219/149‑1 (MQ=255) ggTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAATGACGAt > 4:238476/1‑142 (MQ=255) ggTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAATGACGAt < 3:238476/142‑1 (MQ=255) ggTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAATGACGATGTCCAAc > 3:173815/1‑149 (MQ=255) gCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGTCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCGAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAATGACGATGTCCAACGGc < 4:142208/146‑1 (MQ=255) gCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAATGACGAt < 6:148054/136‑1 (MQ=255) gCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAATGACGAt > 5:148054/1‑136 (MQ=255) gCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAATGACGATGTCCAACGGc > 3:142208/1‑146 (MQ=255) gCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAATGACGATGTCCAACGGCATGCCCTctgctg < 7:172148/149‑1 (MQ=255) tCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAATGACGATGTCCAACGGCATGCCCTCTGCTgggg < 1:11877/145‑1 (MQ=255) tCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAATGACGATGTCCAACGGCATGCCCTCTGCTgggg > 2:11877/1‑145 (MQ=255) tCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAATGACGATGTCCAACGGCATGCCCTCTGCTgg > 7:306828/1‑143 (MQ=255) tCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAATGACGATGTCCAACGGCATGCCCTCTGCTgg < 8:306828/143‑1 (MQ=255) tCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAATGACGATGTCCAACGGCATGCCCTCTGCTGGGGGCTg < 8:141152/149‑1 (MQ=255) cAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAATGACGATGTCCAACGGCATGCCCTCTGCTGGGGGCTgg > 5:138842/1‑149 (MQ=255) ggTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGAc < 3:192521/94‑1 (MQ=255) ggTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGAc > 4:192521/1‑94 (MQ=255) gggCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAATGACGATGTCCAACGGCATGCCCTCTGCTGGGGGCTGGCGCAgg > 1:61104/1‑148 (MQ=255) gTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAACGCACTCGACAGACACAGGGGTAGCTCGGGGCCAGCCAGTACGATGGTGTCGACAAAGCCTTCGACAATGCCGATGTCAACCGGCATGCCCTCTGCTTGGGGCTGGCGCAGGTAGGggc > 2:268767/1‑149 (MQ=255) aCAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAATGACGATGTCCAACGGCATACCCTCTGCTGGGGGCTGGCGCAGGTAGGggcgg > 1:3807/1‑149 (MQ=255) | GTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAAGGCACTGGAGAGAGACAGGGGTAGGTCGGGGCCAGCCAGTTCGATGGTTTCGACAAAGCCTTCGACAATGACGATGTCCAACGGCATGCCCTCTGCTGGGGGCTGGCGCAGGTAGGGGCGG > NC_002947/1657795‑1658083 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |