| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,685,781 | C→A | 5.6% | G333V (GGG→GTG) | patD ← | medium chain aldehyde dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,685,781 | 0 | C | A | 5.6% | 231.1 / 3.5 | 72 | G333V (GGG→GTG) | patD | medium chain aldehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/39); new base A (2/2); total (31/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.21e-01 | |||||||||||
CCAAACACTTCGTTGCGCACGATCTCGTCGTCCTGCAGGGCGTCGGCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTACGGCTTTACCCAGGCGTTCGACAAAGCGCTCGTAGATCCCGTCCTGCACATACAG > NC_002947/1685637‑1685923 | ccAAACACTTCGTTGCGCACGATCTCGTCGTCCTGCAGGGCGTCGGCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGc < 3:288379/149‑1 (MQ=255) aaaCACTTCGTTGCGCACGATCTCGTCGTCCTGCAGGGCGTCGGCCAGCATGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGa > 5:191150/1‑149 (MQ=255) ttCGTTGCGCACGATCTCGTCGTCCTGCAGGGCGTCGGCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGcccagct > 1:286862/1‑145 (MQ=255) ttCGTTGCGCACGATCTCGTCGTCCTGCAGGGCGTCGGCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGAc < 2:286862/144‑1 (MQ=255) cGTTGCGCACGATCTCGTCGTCCTGCAGGGCGTCGGCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCGGCCCGGCGACCTTGt < 5:324608/147‑1 (MQ=255) ttGCGCACGATCTCGTCGTCCTGCAGGGCGTCGGCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTcgcg < 5:208115/149‑1 (MQ=255) gtGCTCACGATCTCGTCGTCCTGCAGGGCGTCGGCGAGGACGGTAGGCTCGAAGAAAACGCCATGGCGCGCTATTGGCTTGGCAGCGGTTAGCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCTCCAGCCCGGCGACCTTTTcggg < 8:144894/148‑3 (MQ=255) gcgcACGATCTCGTCGTCCTGCAGGGCGTCGGCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCgg < 6:333354/148‑1 (MQ=255) cACGATCTCGTCGTCCTGCAGGGCGTCGGCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCt > 4:295229/1‑149 (MQ=255) gtcgtcCTGCAGGGCGTCGGCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGa > 7:81743/1‑149 (MQ=255) tcgtcCTGCAGGGCGTCGGCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGAt > 5:362618/1‑149 (MQ=255) tcCTGCAGGGCGTCGGCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGATTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAg > 8:192466/1‑149 (MQ=255) cTGCAGGGCGTCGGCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTg > 3:260074/1‑149 (MQ=255) gCAGGGCGTCGGCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGc > 3:23481/1‑149 (MQ=255) aGGGCGTCGGCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGccc > 6:194552/1‑149 (MQ=255) gTCGGCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGAc > 8:161600/1‑111 (MQ=255) gTCGGCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGAc < 7:161600/111‑1 (MQ=255) tCGGCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATCTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTc < 1:112877/149‑1 (MQ=255) ggCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCgg < 3:212031/149‑1 (MQ=255) gCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTgg < 6:88726/123‑1 (MQ=255) gCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCAACAGCCCGGCGAACTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGt < 1:103146/149‑1 (MQ=255) ccAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCgg < 6:106600/147‑1 (MQ=255) ccAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGta > 5:106600/1‑148 (MQ=255) cAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGtt > 8:179407/1‑148 (MQ=255) cACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTttctt < 7:179407/149‑1 (MQ=255) cACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGATTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTttctt < 7:192466/149‑1 (MQ=255) aCGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTttcttc < 2:100898/149‑1 (MQ=255) cGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCa < 3:295229/149‑1 (MQ=255) cGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCa < 7:2478/149‑1 (MQ=255) ggTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTttctt > 1:343942/1‑146 (MQ=255) cTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCt < 6:362618/149‑1 (MQ=255) aaaaGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTttc > 4:312173/1‑130 (MQ=255) aaaaGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTttc < 3:312173/130‑1 (MQ=255) aaaGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCg > 5:68463/1‑149 (MQ=255) ccATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCtt > 3:206786/1‑149 (MQ=255) aTCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCTCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGa < 4:260074/149‑1 (MQ=255) aTCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCtt > 1:300699/1‑147 (MQ=255) aTCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGa < 5:194552/149‑1 (MQ=255) aTCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGa < 6:191150/149‑1 (MQ=255) cccGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCa > 7:78405/1‑123 (MQ=255) ccGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAggctg < 7:225559/149‑1 (MQ=255) cGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTttcttc < 4:34053/120‑1 (MQ=255) cGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTttcttc > 3:34053/1‑120 (MQ=255) tATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGa < 3:201545/140‑1 (MQ=255) tATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTa > 4:194783/1‑149 (MQ=255) tATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGACCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGa > 4:201545/1‑140 (MQ=255) ttGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTAc < 8:81743/148‑1 (MQ=255) ttGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTACg > 4:327282/1‑149 (MQ=255) gCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTACGGCt < 3:249411/149‑1 (MQ=255) ttGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTACGGCtt > 3:278480/1‑148 (MQ=255) ccACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCg < 1:225834/99‑1 (MQ=255) ccACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCg > 2:225834/1‑99 (MQ=255) ccACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCg > 8:116721/1‑99 (MQ=255) ccACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCg < 7:116721/99‑1 (MQ=255) aCCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTg < 2:63948/114‑1 (MQ=255) aCCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTACGGCTTTACCCa < 6:68463/149‑1 (MQ=255) aCCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTACGGCTTTACCCa < 3:327282/149‑1 (MQ=255) ggTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTACGGCTTTACCCAGGc > 4:7180/1‑149 (MQ=255) ccAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTACGGCTTTACCCAGGCGTTc < 2:343942/148‑1 (MQ=255) cAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTACGGCTTTACCCAGGCGTTCGa < 3:194783/149‑1 (MQ=255) gATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTACGGCTTTACCCAGGCGTTCGACAAAGCGCTCGTAGATCCCGt > 1:114340/1‑149 (MQ=255) gCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTACGGCTTTACCCAGGCGTTCGACAAAGCGCTCGTAGATCCCGTCCt < 2:300699/148‑1 (MQ=255) cccGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGGTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTACGGCTTTACCCAGGCGTTCGACAAAGCGCTCGTAGATCCCGTCCTg > 7:88186/1‑148 (MQ=255) ccGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTACGGCTTTACCCAGGCGTTCGACAAAGCGCTCGTAGATCCCGTCCTGca > 5:138323/1‑149 (MQ=255) gcgcccAGCACCGCGACAAGGTCGCCGGGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGTTGGCTACGGCTTTACCCAGGCGTTCGACAAAGCGCTCGTa < 3:339426/127‑1 (MQ=38) gcgcccAGCACCGCGACAAGGTCGCCGGGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGTTGGCTACGGCTTTACCCAGGCGTTCGACAAAGCGCTCGTa < 3:344881/127‑1 (MQ=38) gcgcccAGCACCGCGACAAGGTCGCCGGGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGTTGGCTACGGCTTTACCCAGGCGTTCGACAAAGCGCTCGTa > 4:339426/5‑131 (MQ=38) gcgcccAGCACCGCGACAAGGTCGCCGGGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGTTGGCTACGGCTTTACCCAGGCGTTCGACAAAGCGCTCGTa > 4:344881/5‑131 (MQ=38) cACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTACGGCTTTACCCAGGCGTTCGACAAAGCGCTCGTAGATCCCGTCCTGCACATACa < 4:206786/149‑1 (MQ=255) aCCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTACGGCTTTACCCAGGCGTTCGACAAAGCGCTCGTAGATCCCGTCCTGCACATACAg < 4:278480/149‑1 (MQ=255) aCCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTACGGCTTTACCCAGGCGTTCGACAAAGCGCTCGTAGATCCCGTCCTGCACATACAg < 6:138323/149‑1 (MQ=255) cgaGCCCGGCGACCTTGTGGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTACGGCTTTACCCAGGCGTTCGAc < 1:102354/113‑1 (MQ=255) | CCAAACACTTCGTTGCGCACGATCTCGTCGTCCTGCAGGGCGTCGGCCAGCACGGTAGGCTCGAAGAAAAAGCCATCGCCCGCTATTGGCTTGCCACCGGTTACCAGACGAATGTGCGGCTGGGCGATGGCCCGCTGCACCAGCCCGGCGACCTTGTCGCGGTGCTGGGCGCTGATCAGTGGCCCCAGTTCGGTTTCTTCAGACTCCTGCAGGCCCGGCTTGAGGCTGGCTACGGCTTTACCCAGGCGTTCGACAAAGCGCTCGTAGATCCCGTCCTGCACATACAG > NC_002947/1685637‑1685923 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |