| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 198,284 | C→G | 5.3% | L1264V (CTG→GTG) | PP_0168 → | putative surface adhesion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 198,284 | 0 | C | G | 5.3% | 247.5 / 3.9 | 75 | L1264V (CTG→GTG) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/37); new base G (2/2); total (36/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.85e-01 | |||||||||||
TAACGGCGACACCGTGACGATCGAAGCCGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGG > NC_002947/198139‑198417 | tAACGGCGACACCGTGACGATCGAAGCCGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTgg > 3:331775/1‑149 (MQ=255) aaCGGCGACACCGTGACGATCGAAGCCGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGc > 6:140361/1‑149 (MQ=255) aCGGCGACACCGTGACGATCGAAGCCGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGc < 3:123638/148‑1 (MQ=255) aCGGCGACACCGTGACGATCGAAGCCGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGc < 3:118516/148‑1 (MQ=255) gACACCGTGACGATCGAAGCCGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTggg < 3:197866/149‑1 (MQ=255) cacCGTGACGATCGAAGCCGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGt < 6:191074/148‑1 (MQ=255) gTGACGATCGAAGCCGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTgg < 8:242709/142‑1 (MQ=255) gTGACGATCGAAGCCGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTgg > 7:242709/1‑142 (MQ=255) tGACGATCGAAGCCGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTg > 8:56605/1‑144 (MQ=255) tGACGATCGAAGCCGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTg < 7:56605/144‑1 (MQ=255) gATCGAAGCCGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTa > 6:151147/1‑149 (MQ=255) gATCGAAGCCGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTa < 5:151147/149‑1 (MQ=255) aTCGAAGCCGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTAc < 7:28743/149‑1 (MQ=255) aTCGAAGCCGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTAc < 7:23456/149‑1 (MQ=255) tCGAAGCCGGTTAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTAcc < 8:145071/149‑1 (MQ=255) gCCGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTga < 5:140361/149‑1 (MQ=255) ccGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGtt > 5:27638/1‑146 (MQ=255) ccGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTgag < 4:141825/149‑1 (MQ=255) ccGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTgag < 4:331775/149‑1 (MQ=255) tCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGAt < 7:165361/136‑1 (MQ=255) tCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGAt > 8:165361/1‑136 (MQ=255) aGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGt > 4:160273/1‑149 (MQ=255) cAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTgag < 2:126607/127‑1 (MQ=255) cAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTgag > 1:126607/1‑127 (MQ=255) cAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGaa < 6:27638/148‑1 (MQ=255) cAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAg > 3:329705/1‑149 (MQ=255) aaGACCTCGGTTCATGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAgt > 6:66064/1‑149 (MQ=255) cTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATGAGTGAAgtggtg > 2:293490/1‑148 (MQ=255) cTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATGAGTGAAgtggtg < 1:293490/148‑1 (MQ=255) cTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGATCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGTACACTATCAGTGAAGtgttgg > 5:41038/1‑149 (MQ=255) tCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGc > 6:249272/1‑149 (MQ=255) aGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGTGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGAtctc < 5:70303/118‑1 (MQ=255) aGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGAtctc > 6:70303/1‑118 (MQ=255) tggCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGTCCAAactga < 5:66064/148‑1 (MQ=255) cGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCAcc‑c > 7:126109/1‑149 (MQ=255) gTCTATCTTGATGCGGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGtggtgg > 7:300389/1‑130 (MQ=255) gTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGtggtgg < 8:300389/130‑1 (MQ=255) tCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCg < 3:45563/148‑1 (MQ=255) tCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCg < 7:274429/148‑1 (MQ=255) tCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCg > 8:274429/1‑148 (MQ=255) gATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGt < 8:126109/146‑1 (MQ=255) aTGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGGTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGAc < 6:41038/148‑1 (MQ=255) gCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGc > 4:333332/1‑149 (MQ=255) tCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACCGCCTTCGGTCACCGAAgggg < 1:68055/149‑3 (MQ=255) tCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGt > 6:357905/1‑146 (MQ=255) cGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATc < 5:249272/149‑1 (MQ=255) cTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGt < 8:109230/128‑1 (MQ=255) cTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGt > 7:109230/1‑128 (MQ=255) tCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAcc > 7:301807/1‑149 (MQ=255) gtgtTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTac < 4:329705/149‑1 (MQ=255) aCGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc > 4:13855/1‑136 (MQ=255) aCGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc < 3:13855/136‑1 (MQ=255) aCGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCAcc < 8:301807/149‑1 (MQ=255) gCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCt > 2:223532/1‑149 (MQ=255) tACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGt < 8:238499/124‑1 (MQ=255) tACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGt > 7:238499/1‑124 (MQ=255) tACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGa > 1:240007/1‑149 (MQ=255) tACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGa > 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aaggCCAGCTTCTCGAAGGTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGa > 4:199126/4‑149 (MQ=21) gTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACcaac < 7:206173/143‑1 (MQ=255) gTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACcaac > 8:206173/1‑143 (MQ=255) gTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCAAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGAc > 2:84145/1‑149 (MQ=255) tGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGACTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGAc > 1:53752/1‑149 (MQ=255) tGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACg < 3:160273/149‑1 (MQ=255) ggCCAGCTTCTCGAAGGTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACg < 3:199126/148‑1 (MQ=255) gCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACgg < 4:215580/149‑1 (MQ=255) ccAGCTTCTCGAAGGTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGAt > 6:271899/1‑115 (MQ=37) ccAGCTTCTCGAAGGTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGAt < 5:271899/115‑1 (MQ=37) cTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAcc > 6:305058/1‑115 (MQ=255) cTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAcc < 5:305058/115‑1 (MQ=255) | TAACGGCGACACCGTGACGATCGAAGCCGGTAAGACCGAAGTCGAGTACAAGACCTCGGTTCAGGGCGATGACGTCTATCTTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGG‑CTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGG > NC_002947/198139‑198417 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |