Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 2,290,396 | C→T | 7.0% | intergenic (+21/‑254) | pepN → / → PP_2018 | aminopeptidase N/BNR domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 2,290,396 | 0 | C | T | 7.0% | 294.0 / 6.7 | 100 | intergenic (+21/‑254) | pepN/PP_2018 | aminopeptidase N/BNR domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (45/47); new base T (4/3); total (50/50) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.15e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.58e-01 |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GCTGACACGCTGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGA > NC_002947/2290249‑2290535 | gcTGACACGCTGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTCTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAAATGCGgccgcc > 7:4833/1‑148 (MQ=255) gCTGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGccc < 2:102627/149‑1 (MQ=255) tGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCg > 3:45042/1‑149 (MQ=255) tGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCg < 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gcgTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGacaaca < 8:224037/149‑1 (MQ=255) gcgTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGacaac > 7:224037/1‑148 (MQ=255) gcgTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGacaac > 4:135548/1‑148 (MQ=255) gcgTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTATGGTGAATTGGGGCCTACCAGAGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGacaac > 3:242126/1‑148 (MQ=255) cgTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCATGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCACCGGCCCCGGCTTTACCCGGCGGacaaca > 7:235600/1‑148 (MQ=255) 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tgatgaAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAacac > 6:302509/1‑149 (MQ=255) tgaAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACAcccc > 5:288769/1‑149 (MQ=255) gggTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACcccgccc > 2:159091/1‑149 (MQ=255) tGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGtt > 5:245089/1‑149 (MQ=255) tgctgtcgcgcATTGTGGTTTGGGGTGTTTTGCCCTGTTTTGTTTTTTTGTTTGTGAGAAATAGTGTGGCTAAATTTTGGTTATTTGGGGCCGCCCCGCGCCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTg < 6:245089/141‑1 (MQ=255) 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cTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGc < 4:89548/148‑1 (MQ=255) tGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCaa > 5:188999/1‑149 (MQ=255) tGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCaa > 8:147548/1‑149 (MQ=255) ggTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAAt > 3:214142/1‑149 (MQ=255) gTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCa > 8:267658/1‑79 (MQ=255) gTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCa < 7:267658/79‑1 (MQ=255) gTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCctc > 7:79568/1‑119 (MQ=255) gTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTGCAGAAAGCCTgat < 7:45509/146‑3 (MQ=255) gTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGc < 1:54314/145‑1 (MQ=255) gTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGc > 2:54314/1‑145 (MQ=255) gAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCa > 5:217474/1‑149 (MQ=255) aaTTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTa > 3:245684/1‑89 (MQ=255) aaTTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTa < 4:245684/89‑1 (MQ=255) aTTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCAtt < 3:200652/149‑1 (MQ=255) ccggggCCGCTGGGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCAtt > 2:215413/3‑148 (MQ=255) ccggggCCGCTGGGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCAtt > 2:183877/3‑148 (MQ=255) cggggCCGCTGGGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGa < 1:215413/148‑1 (MQ=255) cggggCCGCTGGGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGa < 1:183877/148‑1 (MQ=255) cggggCCGCTGGGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGa > 7:129079/2‑149 (MQ=255) | GCTGACACGCTGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGA > NC_002947/2290249‑2290535 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |