| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,296,101 | T→G | 7.5% | E129A (GAG→GCG) ‡ | PP_2023 ← | glutathione S‑transferase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,296,101 | 0 | T | G | 7.5% | 351.7 / 12.9 | 116 | E129A (GAG→GCG) ‡ | PP_2023 | glutathione S‑transferase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (57/50); new base G (4/5); total (61/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.34e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCAGCCGCAGGGTTGGCCTGTAGCCTCC > NC_002947/2295960‑2296248 | ccgccTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCct‑gc > 3:292479/1‑149 (MQ=255) ccgccTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCct < 3:294627/147‑1 (MQ=255) ccgccTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCct > 4:294627/1‑147 (MQ=255) cgccTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGGCAGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCGCGGCct‑gct < 3:301244/149‑1 (MQ=255) gccTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCct‑gctg > 5:198964/1‑149 (MQ=255) ccTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTgg > 7:105778/1‑149 (MQ=255) cTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGc > 4:288940/1‑149 (MQ=255) tcGAACCGCAGTGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGt > 1:219316/2‑148 (MQ=255) cGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTaa < 6:146732/149‑1 (MQ=255) aCCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGc < 6:198964/149‑1 (MQ=255) cACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTc > 1:305263/1‑149 (MQ=255) cACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTc > 4:311408/1‑149 (MQ=255) tGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTcgcg > 3:239211/1‑149 (MQ=255) gtggTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCgg < 2:219316/147‑1 (MQ=255) cGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCggg < 7:172817/149‑1 (MQ=255) gTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCg < 3:45111/133‑1 (MQ=255) gTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCg > 4:45111/1‑133 (MQ=255) gTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGaa < 3:311408/149‑1 (MQ=255) ccccGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTcc < 8:105778/149‑1 (MQ=255) cccGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCg > 2:108233/1‑149 (MQ=255) cccGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCg > 1:64465/1‑149 (MQ=255) ccGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCgg < 2:305263/149‑1 (MQ=255) ggCCAACTGGCGCATCATGGGGATGAACGCGGGATGGGCCATGGTCGGGGGGTCGGCCAGGATGTAACGCCGCCCCGCCAGGAATGCTTCGTTCTCCGCCATGCAGGGCTCGGCCT‑TGTGGGGGTAATGGTCGCGGGAATGCTCCGGGt < 4:239211/149‑1 (MQ=255) ggCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCggg > 7:74560/1‑148 (MQ=255) gCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCg < 8:39179/145‑1 (MQ=255) aCTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGt > 8:101658/1‑149 (MQ=255) tGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTc > 6:211658/1‑149 (MQ=255) gcgcATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCg < 7:36752/148‑1 (MQ=255) cgcATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGc < 5:70279/149‑1 (MQ=255) cATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCa > 4:312870/1‑148 (MQ=255) gggCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGt < 2:64465/149‑1 (MQ=255) gggCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAG‑CAGGCCGAGGCCtggctggc < 1:207508/104‑1 (MQ=38) gcagcaACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTAc < 5:150018/149‑1 (MQ=255) aaCGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAG‑CAGGCCGAGGCCTGGCTGGCggag < 1:212451/101‑3 (MQ=37) aaCGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAG‑CAGGCCGAGGCCTGGCTGGCggag > 2:212451/1‑99 (MQ=37) gcgGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCAc < 6:312790/149‑1 (MQ=255) gcgGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCAc > 2:100734/1‑149 (MQ=255) aTCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGTCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTaa < 1:312371/118‑1 (MQ=255) aTCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGTCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTaa > 2:312371/1‑118 (MQ=255) tCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTgcgc > 1:144899/1‑149 (MQ=255) gCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAg > 4:332111/1‑134 (MQ=255) tGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCgg < 3:206674/106‑1 (MQ=255) tGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAAAGCTCCgg > 4:206674/1‑106 (MQ=255) tCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACgtg > 1:49797/1‑149 (MQ=255) gggTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCt > 2:343927/1‑139 (MQ=255) gggTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCt < 1:343927/139‑1 (MQ=255) gggTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACgtgg < 3:312870/148‑1 (MQ=255) gggTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACgtg < 5:340354/147‑1 (MQ=255) gtggtCGGGCAGCTGGTAAGCGCGGCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCGGCGAGCCAGGCCTGGGTCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACgtgg < 5:209611/146‑1 (MQ=255) ggtCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCa > 7:289757/1‑149 (MQ=255) gtCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACgtggt > 7:271777/1‑144 (MQ=255) gtCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACgtggt < 8:271777/144‑1 (MQ=255) ccAGGAGGGAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCGCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTgcgc < 2:59861/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTgcgc > 7:143319/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTgcgc < 3:288940/149‑1 (MQ=255) cagcagGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTgc < 7:63136/146‑1 (MQ=255) cagcagGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTgc > 8:63136/1‑146 (MQ=255) cagGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACgtg > 4:61521/1‑133 (MQ=255) gTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACtt < 5:150684/102‑1 (MQ=255) gTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACtt > 6:150684/1‑102 (MQ=255) gTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCa < 7:101658/149‑1 (MQ=255) gcccgcccCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAg > 1:13573/1‑104 (MQ=255) gcccgcccCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAg < 2:13573/104‑1 (MQ=255) cccgccccgcCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGtt > 7:226117/1‑149 (MQ=255) cccgccccgcCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGtt > 2:72724/1‑149 (MQ=255) cccgccccgcCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGtt > 6:359273/1‑149 (MQ=255) ccgccccgccAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGttt > 8:315997/1‑149 (MQ=255) gccccgccAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCTCGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCa < 1:72724/149‑1 (MQ=255) gccccgccAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACgtggt > 6:265810/1‑124 (MQ=255) gccccgccAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCACAATCAGCGttt > 1:93619/1‑147 (MQ=255) cccgccAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTc < 7:294352/146‑1 (MQ=255) cccgccAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTACGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTc > 8:294352/1‑146 (MQ=255) ccgccAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGTCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCg < 6:108018/72‑1 (MQ=255) cgccAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGt > 5:140342/1‑104 (MQ=255) cgccAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGt < 6:140342/104‑1 (MQ=255) gCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTAc < 8:184307/89‑1 (MQ=255) gCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTAc > 7:184307/1‑89 (MQ=255) gCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGtt < 6:56777/137‑1 (MQ=255) gCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGtt > 5:56777/1‑137 (MQ=255) ccTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCAGc > 3:106918/1‑149 (MQ=255) cTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCAGcc > 6:106592/1‑149 (MQ=255) attaccGCCAG‑CAGGCCGAGGCCTGGCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCa < 1:250547/137‑1 (MQ=255) attaccGCCAG‑CAGGCCGAGGCCTGGCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCa > 2:250547/5‑141 (MQ=255) gCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCAGCCGCAggg < 2:58349/149‑1 (MQ=255) gCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCAGCCGCAggg > 1:58349/1‑149 (MQ=255) cTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCAGCCGCAGGGt < 8:143319/149‑1 (MQ=255) cGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCACAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCAGCCGCAGGGTTg < 2:93619/148‑1 (MQ=255) ccagccagGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCAGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTGGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCAGCCGAAGGGTTGGcc > 6:277706/1‑149 (MQ=255) ccagcagGCCGAGGCCTGGCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCAGCCGCAGGGTTGGcc > 3:196738/5‑149 (MQ=255) cagccagGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCAGCCGCAGGGTTGGCCt > 4:180969/1‑149 (MQ=255) agccagGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCAGCCGCAGGGTTGGCCTg > 3:154423/1‑149 (MQ=255) gccagGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCAGCCGCAGGGTTGGCCTg > 1:57661/1‑148 (MQ=255) ccagGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCAGCCGCAGGGTTGGCCTGTa < 7:197365/149‑1 (MQ=255) ccagGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCAGCCGCAGGGTTGGCCTGTa < 4:154423/149‑1 (MQ=255) agGGCTGGGGCT‑GCTGGGGGTAATGCTGGGGGGAATGCTGCGGGGAACGTTGGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCAGCCGCAGGGTTGGCCTGTAGc < 3:24946/149‑1 (MQ=255) agGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCTGCCTGCTGCGCAGCCGCAGGGTTGGCCTGTAGc > 4:33567/1‑149 (MQ=255) gCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCtgctgc < 4:127767/123‑1 (MQ=255) ccTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTCCGCAGCCGCAGGGTTGGCCTGTAGCCTc < 8:289757/149‑1 (MQ=255) cTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCAGCCGCAGGGTTGGCCTGTAGCCTcc < 2:57661/149‑1 (MQ=255) cTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCAAACTTGTACAGGTTCACGGGCGCCTTGAACGTGGTGATCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCAGCCGCAGGGTTGGCCTGTAGCCTc < 1:100734/149‑1 (MQ=255) | GCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCT‑GCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTG‑TCATTGCGCGCAATCAGCGTTTCAGCCTGCTGCGCAGCCGCAGGGTTGGCCTGTAGCCTCC > NC_002947/2295960‑2296248 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |