| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,338,796 | C→T | 7.6% | P197S (CCG→TCG) | PP_2055 → | isomerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,338,796 | 0 | C | T | 7.6% | 229.8 / 6.1 | 79 | P197S (CCG→TCG) | PP_2055 | isomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/39); new base T (3/3); total (37/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.48e-01 | |||||||||||
GGCGATCGATGGGGTACCGGGCACTGCCGCCCCGGTGCATCTGACCTTCCTCGACGCGGTCGGCAGCAAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTG > NC_002947/2338648‑2338940 | ggCGATCGATGGGGTACCGGGCACTGCCGCCCCGGTGCATCTGACCTTCCTCGACGCGGTCGGCAGCAAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGc < 5:276234/149‑1 (MQ=255) gatGGGGTACCGGGCACTGCCGCCCCGGTGCATCTGACCTTCCTCGACGCGGTCGGCAGCAAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCgatgat > 2:302686/1‑149 (MQ=255) ccGGGCACTGCCGCCCCGGTGCATCTGACCTTCCTCGACGCGGTCGGCAGCAAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGa < 3:264359/149‑1 (MQ=255) ccGGGCACTGCCGCCCCGGTGCATATGACCTTCCTCGACGCGGTCGGCAGCAAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGTCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCTTGCCGGTGACCTGCATCTACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGa < 3:62798/149‑1 (MQ=255) cccGGTGCATCTGACCTTCCTCGACGCGGTCGGCAGCAAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTgg < 1:302686/149‑1 (MQ=255) cGGTGCATCTGACCTTCCTCGACGCGGTCGGCAGCAAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGgt < 8:190419/149‑1 (MQ=255) cGGTGCATCTGACCTTCCTCGACGCGGTCGGCAGCAAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGgt < 1:335578/149‑1 (MQ=255) cGGTGCATCTGACCTTCCTCGACGCGGTCGGCAGCAAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGATGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGgt < 6:109647/149‑1 (MQ=255) gTGCATCTGACCTTCCTCGACGCGGTCGGCAGCAAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGgtgt < 5:192052/149‑1 (MQ=255) aCCTTCCTCGACGCGGTCGGCAGCAAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTc < 3:61221/149‑1 (MQ=255) cTTCCTCGACGCGGTCGGCAGCAAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGa > 4:133400/1‑120 (MQ=255) cTTCCTCGACGCGGTCGGCAGCAAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGa < 3:133400/120‑1 (MQ=255) cTTCCTCGACGCGGTCGGCAGCAAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCg > 4:164880/1‑148 (MQ=255) tCGACGCGGTCGGCAGCAAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAAcc > 3:55129/1‑149 (MQ=255) tCGACGCGGTCGGCAGCAAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAAcc > 7:138761/1‑149 (MQ=255) cagcaAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTg > 6:221453/1‑148 (MQ=255) caAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACg > 5:235898/1‑149 (MQ=255) ggCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAg > 4:116463/1‑149 (MQ=255) gCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAgc > 7:262573/1‑149 (MQ=255) aaGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAg < 8:79102/132‑1 (MQ=255) aaGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAg > 7:79102/1‑132 (MQ=255) gCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGACCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAgcgcgc > 7:324537/1‑149 (MQ=255) ttCCCCTCGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGgccagc < 4:141442/90‑1 (MQ=255) ttCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCgctg < 8:138761/147‑1 (MQ=255) ccccACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCgg > 3:242814/1‑105 (MQ=255) ccccACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCgg < 4:242814/105‑1 (MQ=255) ccccACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTc < 4:55129/148‑1 (MQ=255) cccACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAgcgcg < 5:332329/141‑1 (MQ=255) cccACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAgcgcg > 6:332329/1‑141 (MQ=255) cccACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCg > 6:309004/1‑148 (MQ=255) ccACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCgctgc < 2:290358/144‑1 (MQ=255) ccACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCgctgc > 1:290358/1‑144 (MQ=255) ccACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGaa > 1:185687/1‑149 (MQ=255) ccACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGaa > 5:204428/1‑149 (MQ=255) gCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTg > 3:205711/1‑149 (MQ=255) cAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCTAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACACCGGCTCAGCTGGACGCCGACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTg > 5:238772/1‑148 (MQ=255) cAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTgg < 5:221453/149‑1 (MQ=255) aaGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTgg > 8:103512/1‑148 (MQ=255) gCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGc > 3:336420/1‑149 (MQ=255) ccAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCTAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCGACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGt < 6:238772/149‑1 (MQ=255) ccAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGt > 5:34088/1‑149 (MQ=255) gACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAgc < 2:120117/120‑1 (MQ=255) cGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGc < 8:262573/149‑1 (MQ=255) gTGATTGATGGCGTGCCGGTGATCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTc < 7:186723/126‑1 (MQ=255) gTGATTGATGGCGTGCCGGTGATCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTc > 8:186723/1‑126 (MQ=255) gTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCt < 3:164880/149‑1 (MQ=255) gTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCACGCTGCTCg > 1:79368/1‑127 (MQ=255) gTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCACGCTGCTCg < 2:79368/127‑1 (MQ=255) gatGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAgg < 2:185687/148‑1 (MQ=255) gatGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAgg < 6:204428/148‑1 (MQ=255) gTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGaaa < 6:235898/149‑1 (MQ=255) ggTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGc > 4:74168/1‑131 (MQ=255) aCCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATgg < 7:103512/148‑1 (MQ=255) aCCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATgg < 3:116463/148‑1 (MQ=255) ccTGCATCGACATGACCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGc < 8:324537/149‑1 (MQ=255) cTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGcc > 2:224871/1‑149 (MQ=255) tGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCt > 1:34645/1‑149 (MQ=255) tcATCGGCATGGCCATGTCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAAc < 7:334227/104‑1 (MQ=255) tcATCGGCATGGCCATGTCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAAc > 8:334227/2‑105 (MQ=255) tcATCGGCATGGCCATGTCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTg > 5:224707/2‑149 (MQ=255) cATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGaa > 3:28984/1‑103 (MQ=255) cATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGaa < 4:28984/103‑1 (MQ=255) aTCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTggg < 2:34645/149‑1 (MQ=255) tCGGCATGGCCATGTCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGcc < 6:217933/128‑1 (MQ=255) tCGGCATGGCCATGTCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGcc > 5:217933/1‑128 (MQ=255) ggcATGGCCATGTCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGa < 6:224707/147‑1 (MQ=255) aCATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCgg < 5:54137/116‑1 (MQ=255) aCATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCgg > 6:54137/1‑116 (MQ=255) aCATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGAt < 5:30237/149‑1 (MQ=255) aCATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGAt < 4:336420/149‑1 (MQ=255) cATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATg > 1:229892/1‑149 (MQ=255) ccATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAgcgcg < 3:223746/83‑1 (MQ=255) ccATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAgcgcg > 4:223746/1‑83 (MQ=255) cATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGc > 7:237122/1‑117 (MQ=255) cATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGc < 8:237122/117‑1 (MQ=255) cATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGa < 3:247119/121‑1 (MQ=255) cATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGa > 4:247119/1‑121 (MQ=255) cATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAgg < 7:165471/125‑1 (MQ=255) cATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAgg > 8:165471/1‑125 (MQ=255) cATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTg < 6:34088/149‑1 (MQ=255) ccGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGAt < 2:301301/138‑1 (MQ=255) ccGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGAt > 1:301301/1‑138 (MQ=255) | GGCGATCGATGGGGTACCGGGCACTGCCGCCCCGGTGCATCTGACCTTCCTCGACGCGGTCGGCAGCAAGACCGGCAAGCTGTTCCCCACGGGCAAGGCCCAGGACGTGATTGATGGCGTGCCGGTGACCTGCATCGACATGGCCATGCCGATGATGGTTGTGGAGGCCAGCCAGTTGGGTGTCAGCGGCTCGGAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTG > NC_002947/2338648‑2338940 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |