| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,396,286 | T→C | 5.4% | D1124G (GAC→GGC) | PP_2100 ← | two‑component system sensor protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,396,286 | 0 | T | C | 5.4% | 378.1 / 8.0 | 130 | D1124G (GAC→GGC) | PP_2100 | two‑component system sensor protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (61/61); new base C (2/5); total (63/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.41e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.25e-01 | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
GGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGC > NC_002947/2396142‑2396433 | ggCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGc < 6:118678/149‑1 (MQ=255)ggCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGGCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCACCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGc < 6:194735/149‑1 (MQ=255) gCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGcc > 2:254141/1‑149 (MQ=255) gCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGcc > 5:174483/1‑149 (MQ=255) gTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGaa < 6:268741/149‑1 (MQ=255) gTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGGGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGGCGGCCTGaa < 3:59954/149‑1 (MQ=255) tccgatcTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCC‑GGCCAGGTCGGCCTGAAg < 1:317049/141‑1 (MQ=255) gCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCTT‑CAGGCC‑GACCTGGCCAGCCTGATGGc < 3:117613/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGaa > 5:278975/1‑146 (MQ=255) gCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGaa < 6:278975/146‑1 (MQ=255) gCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGc > 3:210313/1‑149 (MQ=255) gCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCTTCCAGGCC‑GACCTGGCCAGCCTGATGGcgc < 1:15669/148‑3 (MQ=255) gCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTg < 8:210742/149‑1 (MQ=255) ccTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCTT‑CAGGCC‑GACCTGGCCAGCCTGATGGcgcttc < 5:38600/149‑3 (MQ=38) cTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGaa < 3:35531/140‑1 (MQ=255) tCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTg > 5:97811/1‑149 (MQ=255) cGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTg > 8:132351/1‑148 (MQ=255) gAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGc > 4:243064/1‑148 (MQ=255) aGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGaa > 3:321842/1‑136 (MQ=255) gCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGt > 6:83081/1‑149 (MQ=255) cacaGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCgg > 6:264736/1‑123 (MQ=255) acaGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTcc < 3:243064/148‑1 (MQ=255) gccATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAgcg < 7:138505/149‑1 (MQ=255) aTCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAgc < 6:36173/145‑1 (MQ=255) tcaggtcaggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAA‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGa < 1:270894/149‑1 (MQ=255) ggtcaggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACgg < 4:299665/149‑1 (MQ=255) gtcaggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGt > 6:296013/1‑149 (MQ=255) gtcaggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGt > 4:85088/1‑149 (MQ=255) tcaggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTg > 2:254082/1‑119 (MQ=255) tcaggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTg < 1:254082/119‑1 (MQ=255) aggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGAc < 8:321288/143‑1 (MQ=255) aggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGAc < 2:66229/143‑1 (MQ=255) aggGGCTTCCAGCATGCGCGCGACGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCG‑CAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAAc < 2:277892/149‑1 (MQ=255) gggCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGt < 1:160951/117‑1 (MQ=255) gggCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGt > 2:160951/1‑117 (MQ=255) gggCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAAcc > 3:284599/1‑149 (MQ=255) cTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCggg < 1:207007/149‑1 (MQ=255) ttCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGt > 5:81282/1‑149 (MQ=255) aGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAgg > 8:160592/1‑149 (MQ=255) aGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAgg < 4:210313/149‑1 (MQ=255) cgcgcgGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGAc < 4:284599/149‑1 (MQ=255) cgcgGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCGGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCa < 2:212201/149‑1 (MQ=255) gcggcgCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGTCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGccc < 8:285171/143‑1 (MQ=255) gcggcgCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGTCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGccc > 7:285171/1‑143 (MQ=255) ggcgCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCAcgg < 4:81318/149‑1 (MQ=255) gcTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCAcggcgg > 7:192349/1‑149 (MQ=255) tGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAg < 3:326743/110‑1 (MQ=255) tGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAg > 4:326743/1‑110 (MQ=255) tGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACggcggc > 3:202186/1‑148 (MQ=255) aGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAg > 6:23829/1‑149 (MQ=255) gCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAgg < 5:23829/149‑1 (MQ=255) cACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGc < 6:97811/149‑1 (MQ=255) aCCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGcc > 6:294786/1‑149 (MQ=255) gCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTg < 4:271971/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTg > 3:271971/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTgg > 1:334781/1‑149 (MQ=255) 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gCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCtt < 5:165311/149‑1 (MQ=255) gCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCtt < 4:226064/149‑1 (MQ=255) cAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTg > 4:41172/1‑149 (MQ=255) cgccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCgg < 5:296013/149‑1 (MQ=255) gccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTgg > 5:33811/1‑133 (MQ=255) gccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCggg > 2:278535/1‑149 (MQ=255) gccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCggg < 2:334781/149‑1 (MQ=255) tGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCg > 1:37314/1‑149 (MQ=255) tGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGt > 2:115017/1‑149 (MQ=255) cGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGc < 3:41172/149‑1 (MQ=255) tgtTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTg > 4:229349/1‑149 (MQ=255) gCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTgg > 6:62985/1‑119 (MQ=255) gCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTgg < 5:62985/119‑1 (MQ=255) gCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTggcg < 5:285782/148‑1 (MQ=255) cGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCgg > 2:271419/1‑81 (MQ=255) cGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTggcggc < 7:316468/149‑1 (MQ=255) 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cctt‑CAGGCC‑GACCTGGCCAGCCTGATGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAAt < 4:341109/145‑1 (MQ=255) cAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACggcggc < 1:68165/90‑1 (MQ=255) cAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACggcggc > 2:68165/1‑90 (MQ=255) aT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATgcc > 8:312584/1‑149 (MQ=255) t‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATgcca < 5:149521/149‑1 (MQ=255) t‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATgcca < 6:325856/149‑1 (MQ=255) 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GGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCT‑GGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGC > NC_002947/2396142‑2396433 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |