Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,396,288 | G→A | 5.4% | A1123A (GCC→GCT) | PP_2100 ← | two‑component system sensor protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,396,288 | 0 | G | A | 5.4% | 405.7 / 6.8 | 129 | A1123A (GCC→GCT) | PP_2100 | two‑component system sensor protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (60/62); new base A (2/5); total (62/67) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.43e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.60e-01 |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
GGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGA > NC_002947/2396142‑2396436 | ggCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGc < 2:208300/149‑1 (MQ=255) ggCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGc < 6:118678/149‑1 (MQ=255) ggCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGGCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCACCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGc < 6:194735/149‑1 (MQ=255) gCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGcc > 5:174483/1‑149 (MQ=255) gTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTg > 2:270894/1‑147 (MQ=255) gTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGaa < 6:268741/149‑1 (MQ=255) gTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGGGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGGCGGCCTGaa < 3:59954/149‑1 (MQ=255) tccgatcTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCCGGCCAGGTCGGCCTGAAg < 1:317049/141‑1 (MQ=255) gCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCTT‑CAGGCCGACCTGGCCAGCCTGATGGc < 3:117613/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGaa > 5:278975/1‑146 (MQ=255) gCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGaa < 6:278975/146‑1 (MQ=255) gCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGc > 3:210313/1‑149 (MQ=255) gCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCTTCCAGGCCGACCTGGCCAGCCTGATGGcgc < 1:15669/148‑3 (MQ=255) gCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGctc < 6:174483/147‑1 (MQ=255) gCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTg < 8:210742/149‑1 (MQ=255) cTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGaa > 4:35531/1‑140 (MQ=255) cTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGaa < 3:35531/140‑1 (MQ=255) cGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTg > 8:132351/1‑148 (MQ=255) gAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGc > 4:243064/1‑148 (MQ=255) gAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCCGGCCAGGTCGGCCTGAAg > 2:317049/1‑138 (MQ=255) aGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGaa < 4:321842/136‑1 (MQ=255) aGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGaa > 3:321842/1‑136 (MQ=255) gCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGt > 6:83081/1‑149 (MQ=255) acaGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTcc < 3:243064/148‑1 (MQ=255) acaGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTc > 3:226064/1‑147 (MQ=255) acaGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCa < 5:277330/149‑1 (MQ=255) gccATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAgcg < 7:138505/149‑1 (MQ=255) aTCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAgc > 5:36173/1‑145 (MQ=255) ggtcaggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACgg < 4:299665/149‑1 (MQ=255) gtcaggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGt > 4:85088/1‑149 (MQ=255) gtcaggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGt > 6:296013/1‑149 (MQ=255) tcaggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTg > 2:254082/1‑119 (MQ=255) tcaggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTg < 1:254082/119‑1 (MQ=255) aggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGAc > 1:66229/1‑143 (MQ=255) aggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGAc < 2:66229/143‑1 (MQ=255) aggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGAc > 7:321288/1‑143 (MQ=255) aggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGAc < 8:321288/143‑1 (MQ=255) aggGGCTTCCAGCATGCGCGCGACGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCG‑CAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAAc < 2:277892/149‑1 (MQ=255) gggCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGt < 1:160951/117‑1 (MQ=255) gggCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGt > 2:160951/1‑117 (MQ=255) cTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCggg < 1:207007/149‑1 (MQ=255) cTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCggg > 6:285782/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGt > 5:81282/1‑149 (MQ=255) cAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAg > 3:81318/1‑149 (MQ=255) cAGCATGCGCGCGGCGCTGAACACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAg > 5:155824/1‑149 (MQ=255) aGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAgg > 8:160592/1‑149 (MQ=255) aGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAgg < 4:210313/149‑1 (MQ=255) cgcgGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCGGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCa < 2:212201/149‑1 (MQ=255) gcggcgCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGTCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGccc < 8:285171/143‑1 (MQ=255) gcggcgCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGTCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGccc > 7:285171/1‑143 (MQ=255) cggcgCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCAcg > 6:252690/1‑149 (MQ=255) tGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAg > 4:326743/1‑110 (MQ=255) tGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAg < 3:326743/110‑1 (MQ=255) aGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAg > 6:23829/1‑149 (MQ=255) aGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAg < 3:290498/149‑1 (MQ=255) cACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGc < 6:97811/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTg < 4:271971/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTg > 3:271971/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTgg > 1:334781/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCGGCAATGGCGCCACTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGcc < 6:227501/139‑1 (MQ=255) ccTGCTCGGCAATGGCGCCACTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGcc > 5:227501/1‑139 (MQ=255) cTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGc < 3:137360/118‑1 (MQ=255) cTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGc > 4:137360/1‑118 (MQ=255) cTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTgg > 3:132226/1‑148 (MQ=255) tGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTc < 1:122310/140‑1 (MQ=255) gCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTgtac > 3:337882/1‑145 (MQ=255) cTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTa > 6:165311/1‑147 (MQ=255) cTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCAAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTa > 8:316468/1‑147 (MQ=255) ggCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCt < 7:160592/149‑1 (MQ=255) cAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTg > 4:41172/1‑149 (MQ=255) cgccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCgg < 5:296013/149‑1 (MQ=255) gccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTgg < 6:33811/133‑1 (MQ=255) gccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTgg > 5:33811/1‑133 (MQ=255) gccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCggg < 5:83081/149‑1 (MQ=255) gccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCggg < 2:334781/149‑1 (MQ=255) tGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGt > 2:115017/1‑149 (MQ=255) tgtTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTg > 4:229349/1‑149 (MQ=255) gCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTgg < 5:62985/119‑1 (MQ=255) gCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTgg > 6:62985/1‑119 (MQ=255) cGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCgg > 2:271419/1‑81 (MQ=255) cGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCgg < 1:271419/81‑1 (MQ=255) cGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTggcggc < 7:316468/149‑1 (MQ=255) gAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCggg > 1:267753/1‑149 (MQ=255) aaGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCggg < 3:85088/148‑1 (MQ=255) aaGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGc < 4:25401/149‑1 (MQ=255) agagcCTT‑CAGGCCGACCTGGCCAGCCTGATGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTAAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGc > 5:170609/4‑148 (MQ=255) gcgcCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTcc > 7:121445/1‑104 (MQ=255) gcgcCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTcc < 8:121445/104‑1 (MQ=255) gagcCTT‑CAGGCCGACCTGGCCAGCCTGATGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCg > 3:341109/3‑148 (MQ=255) gcCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAAt < 4:202186/149‑1 (MQ=255) gcCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAAt < 7:132351/149‑1 (MQ=255) cctt‑CAGGCCGACCTGGCCAGCCTGATGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAAt < 4:341109/145‑1 (MQ=255) cAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACggcggc < 1:68165/90‑1 (MQ=255) aT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATgcc > 8:312584/1‑149 (MQ=255) t‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATgcca < 5:149521/149‑1 (MQ=255) t‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATgcca < 6:325856/149‑1 (MQ=255) aGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATgccagc > 5:191444/1‑149 (MQ=255) gCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAgg < 5:252690/147‑1 (MQ=255) gTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCgctggc > 8:128270/1‑149 (MQ=255) ggCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGa < 1:254141/149‑1 (MQ=255) | GGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCAT‑CAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGA > NC_002947/2396142‑2396436 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |