| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,456,991 | T→A | 5.7% | L21Q (CTG→CAG) | PP_2150 → | thiamine biosynthesis lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,456,991 | 0 | T | A | 5.7% | 326.0 / 6.3 | 105 | L21Q (CTG→CAG) | PP_2150 | thiamine biosynthesis lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (50/49); new base A (4/2); total (54/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.70e-01 | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
AACCCGCTCCTACAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGC > NC_002947/2456844‑2457133 | aaCCCGCTCCTACAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTg > 7:135918/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCTACAGGGGCAGCGATAATCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAg > 5:258136/1‑149 (MQ=37) ccGCTCCTACAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTg < 5:264374/146‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTg > 6:264374/1‑146 (MQ=255) aCAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTggg > 8:142231/1‑149 (MQ=255) aCAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTggg > 2:159448/1‑149 (MQ=255) aCAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTggg > 7:38934/1‑149 (MQ=255) cAGGATTTACGCTGCCCCTGTAGGAGCTGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTgg < 5:189237/147‑1 (MQ=255) cAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTggg < 8:38934/148‑1 (MQ=255) ggATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCAGGCGCTCCAGggtgg < 1:91108/149‑1 (MQ=255) gATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGa > 5:20812/1‑136 (MQ=255) gATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGa < 6:20812/136‑1 (MQ=255) gATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCAGGCGCTCCAGggtg > 6:288463/1‑147 (MQ=255) gATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCAGGCGCTCCAGggtg < 5:288463/147‑1 (MQ=255) gATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGCTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGggtggt < 3:294619/149‑1 (MQ=255) aTCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGa > 4:38520/1‑149 (MQ=255) tCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGAc < 8:135918/149‑1 (MQ=255) tCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGAc > 8:246213/1‑149 (MQ=255) taatccTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATg < 6:258136/145‑1 (MQ=255) ccccTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATggg < 1:159448/149‑1 (MQ=255) ccccTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATggg < 3:38520/149‑1 (MQ=255) ccccTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATggg > 6:87516/1‑149 (MQ=255) ccccTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTACAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATg < 5:140707/147‑1 (MQ=255) ccTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATggg > 4:53694/1‑147 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTg > 3:271595/1‑120 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGa < 5:346464/139‑1 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGa > 6:346464/1‑139 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGgcag > 5:84492/1‑149 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGgcag < 7:142231/149‑1 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGgcag < 8:83676/149‑1 (MQ=255) tcggAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGgcagca < 1:80400/146‑1 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGgcagca < 5:145450/148‑1 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGgcagca < 3:53694/148‑1 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGgcagca < 3:168010/148‑1 (MQ=255) tcggcggggTTTACCCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGgcagca < 5:54266/142‑1 (MQ=255) aGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGggtg > 8:304147/1‑126 (MQ=255) cGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCGCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACa < 1:73039/149‑1 (MQ=255) cGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTggg > 2:49887/1‑122 (MQ=255) cGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTggg < 1:49887/122‑1 (MQ=255) cGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAg > 6:355892/1‑149 (MQ=255) gTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGTGTGGTCCGACCAt < 8:200986/131‑1 (MQ=255) gTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCAt > 7:200986/1‑131 (MQ=255) tttA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATc > 4:67314/1‑149 (MQ=255) tttA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATc < 7:246213/149‑1 (MQ=255) a‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCa < 6:84492/148‑1 (MQ=255) cccGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAg < 3:67314/148‑1 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTa > 8:3921/1‑149 (MQ=255) gcgAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTAGTGTTCTTTCTGCTGGTAATCCCCGCGTGCACCCACGGCC‑CCCCCCTGGCGCGCCTGGGTGGTCCGCCAATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACg > 6:341757/1‑149 (MQ=255) gcgAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGAc < 2:191551/120‑1 (MQ=255) agGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTa > 5:135745/1‑141 (MQ=255) agGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTa < 6:135745/141‑1 (MQ=255) gCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGcagcag > 1:216419/1‑124 (MQ=255) gCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGcagcag < 2:216419/124‑1 (MQ=255) cAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACa < 1:121391/127‑1 (MQ=255) cAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACa > 2:121391/1‑127 (MQ=255) aGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCt > 1:136489/1‑149 (MQ=255) gCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCtg < 8:224047/149‑1 (MQ=255) gCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCtg > 2:178055/1‑149 (MQ=255) cGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCtggt < 8:200452/147‑1 (MQ=255) cGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCtggt > 7:200452/1‑147 (MQ=255) cGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCACCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGACCCtggtcg > 7:262886/1‑147 (MQ=255) agaAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGcc < 7:9099/149‑1 (MQ=255) agaAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGcc < 7:3921/149‑1 (MQ=255) gaAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCg < 5:362967/149‑1 (MQ=255) cgcACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGa < 5:355892/148‑1 (MQ=255) catcccTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCg < 5:341757/146‑1 (MQ=255) gCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGt < 4:104637/149‑1 (MQ=255) gTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGt > 1:33717/1‑129 (MQ=255) ttCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCtggt < 1:341691/108‑1 (MQ=255) ttCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGCGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCtggt > 2:341691/1‑108 (MQ=255) cATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATc < 1:178055/148‑1 (MQ=255) gctgctACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTCGAGCGCCTGCGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCAACAGCAACCAGTAAGTCCCCGAGCCTGGTCGCCCGCTCCCGCCCCACGAGCAGATCGCGGTGTAACCCAACCTGCAc > 5:148767/1‑148 (MQ=255) tACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATc > 5:201346/1‑149 (MQ=255) aCTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATc > 4:251055/1‑136 (MQ=255) aCTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATc < 3:251055/136‑1 (MQ=255) cTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGa > 3:76182/1‑149 (MQ=255) tCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTcc > 3:270272/1‑81 (MQ=255) tCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTcc < 4:270272/81‑1 (MQ=255) tCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGac > 7:302998/1‑149 (MQ=255) tCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGac > 6:169151/1‑149 (MQ=255) aCCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACGGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGacca > 1:119025/1‑149 (MQ=255) aCCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGacca > 6:56720/1‑149 (MQ=255) aCCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGac < 8:302998/147‑1 (MQ=255) ccGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGACCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAAc < 7:43355/127‑1 (MQ=255) ccGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGACCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAAc > 8:43355/1‑127 (MQ=255) cGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGG‑CCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGAccacca > 3:307981/1‑149 (MQ=255) tGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGa < 7:306519/109‑1 (MQ=255) tGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGa > 8:306519/1‑109 (MQ=255) gCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATc > 2:121132/1‑125 (MQ=255) aaCCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGaccac > 4:221581/1‑141 (MQ=255) aaCCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGaccac < 3:221581/141‑1 (MQ=255) cAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGAc > 7:275646/1‑149 (MQ=255) cAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGAc > 4:37639/1‑149 (MQ=255) aaGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGAcc > 1:333603/1‑149 (MQ=255) ggaccACCCAGGCGCTCCAGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTAc > 3:153641/4‑149 (MQ=255) gaccACCCAGGCGCTCCAGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTAcc > 8:187622/3‑149 (MQ=255) gaccACCCAGGCGCTCCAGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTAcc > 8:184897/3‑149 (MQ=255) c‑ccACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAAGCATCCTGCACGAc > 3:227824/1‑123 (MQ=255) c‑ccACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGAc < 4:227824/123‑1 (MQ=255) ccACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACcgc > 2:296194/1‑149 (MQ=255) | AACCCGCTCCTACAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGC > NC_002947/2456844‑2457133 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |