| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 2,457,000 | T→A | 5.7% | L24Q (CTG→CAG) | PP_2150 → | thiamine biosynthesis lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 2,457,000 | 0 | T | A | 5.7% | 311.8 / 6.9 | 105 | L24Q (CTG→CAG) | PP_2150 | thiamine biosynthesis lipoprotein |
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Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
ACAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCG > NC_002947/2456855‑2457146 | aCAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTggg > 7:38934/1‑149 (MQ=255)aCAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTggg > 2:159448/1‑149 (MQ=255)aCAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTggg > 8:142231/1‑149 (MQ=255) 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1:333603/1‑149 (MQ=255) ggaccACCCAGGCGCTCCAGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTAc > 3:153641/4‑149 (MQ=255) gaccACCCAGGCGCTCCAGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTAcc > 8:187622/3‑149 (MQ=255) gaccACCCAGGCGCTCCAGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTAcc > 8:184897/3‑149 (MQ=255) c‑ccACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAAGCATCCTGCACGAc > 3:227824/1‑123 (MQ=255) c‑ccACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGAc < 4:227824/123‑1 (MQ=255) ccACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACcgc > 2:296194/1‑149 (MQ=255) ggAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGAtt > 7:251553/1‑149 (MQ=255) gAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACGGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGAtt < 2:119025/148‑1 (MQ=255) gAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTc > 3:271412/1‑149 (MQ=255) gcgcCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCa < 8:275646/149‑1 (MQ=255) cgcCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCAt < 5:56720/149‑1 (MQ=255) cTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCg > 5:56291/1‑148 (MQ=255) cTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCg > 5:51116/1‑148 (MQ=255) cTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCg > 1:271749/1‑148 (MQ=255) | ACAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCC‑CCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCG > NC_002947/2456855‑2457146 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |