Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,479,148 | C→A | 7.8% | intergenic (+401/+44) | PP_2172 → / ← PP_2173 | hypothetical protein/AraC family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,479,148 | 0 | C | A | 7.8% | 308.8 / 10.2 | 98 | intergenic (+401/+44) | PP_2172/PP_2173 | hypothetical protein/AraC family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (46/44); new base A (3/5); total (49/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.15e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.26e-01 |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
ACAGAGTGGGCAATTGATCGCCAGCGGATCCATTTATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCCAGTGGTGTTTCCGGATAGACGCTCAGGTAATGAAAGAACAACGGATGATCACGCAGTTCTTCGTT > NC_002947/2479000‑2479296 | acaGAGTGGGCAATTGATCGCCAGCGGATCCATTTATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATgcgc > 6:252971/1‑149 (MQ=255) agagTGGGCAATTGATCGCCAGCGGATCCATTTATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCt > 2:199342/1‑149 (MQ=255) ggCAATTGATCGCCAGCGGATCCATTTATGCAACTAGCGATGGGCCTGGTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATATGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGcc > 1:57409/1‑149 (MQ=255) ggCAATTGATCGCCAGCGGATCCATTTATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCg > 4:178770/1‑149 (MQ=255) gCAATTGATCGCCAGCGGATCCATTTATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCTCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTGTCTGATCCCCGGCCCAGGCGCATGGCCAGGCAACCGGGCCgg < 8:27289/149‑1 (MQ=255) aaTTGATCGCCAGCGGATCCATTTATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCAGGCGCATGGCCAGGCAACCGGGCCgggg < 5:336111/149‑3 (MQ=38) aaTTGATCGCCAGCGGATCCATTTATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCAGGCGCATGGCCAGGCAACCGGGCCggg < 2:19615/148‑2 (MQ=38) aaTTGATCGCCAGCGGATCCATTTATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCAGGCGCATGGCCAGGCAACCGGGCCggg > 1:19615/1‑147 (MQ=38) tttGATCGCCAGCGGATCCATTTATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCACCGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCAGGCGCATGGCCAGGCAACCGGGCCggg < 1:43241/146‑2 (MQ=38) tGATCGCCAGCGGATCCATTTATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCAGGCGCATGGCCAGGCAACCGGGCCggg > 2:43241/1‑144 (MQ=38) gATCGCCAGCGGATCCATTTATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGt > 6:195447/1‑149 (MQ=255) aTCGCCAGCGGATCCATTTATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGtt > 1:99441/1‑149 (MQ=255) cctatctgATCCATTTATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGACATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTgg < 3:331758/141‑1 (MQ=255) ccAGCGGATCCATTTATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGG‑CATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTa > 5:186255/1‑149 (MQ=255) cAGCGGATCCATTTATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCAGGCGCATGGCCAGGCAACCGGGCCggg < 7:80213/138‑2 (MQ=38) cAGCGGATCCATTTATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCAGGCGCATGGCCAGGCAACCGGGCCggg > 8:80213/1‑137 (MQ=38) aTCCATTTATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAAACAACGCTGGCCCTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCAAGGGTACGTATCTGATCCCCGCACCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTgg > 4:331758/1‑140 (MQ=255) aTTTATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTgg < 4:142769/136‑1 (MQ=255) ttATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATgcgc > 5:317996/1‑116 (MQ=255) ttATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATgcgc < 6:317996/116‑1 (MQ=255) tATGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGTCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTAccc < 5:246720/148‑1 (MQ=255) aTGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCAt > 7:21412/1‑149 (MQ=255) tGCAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATg > 4:102036/1‑149 (MQ=255) cAACTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCACGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATgg < 8:19475/148‑1 (MQ=255) aaCTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGcc < 2:179129/149‑1 (MQ=255) aaCTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGcc < 2:57409/149‑1 (MQ=255) cTA‑CGATGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCa < 5:252971/149‑1 (MQ=255) tGGGCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTAc < 3:102036/149‑1 (MQ=255) ggCCTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGG‑CATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACtt < 6:186255/148‑1 (MQ=255) ccTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACtt > 7:103521/1‑147 (MQ=255) ccTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACtt > 6:344829/1‑147 (MQ=255) ccTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCa < 7:304855/149‑1 (MQ=255) cTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCTGCCCGGTTGCCTGGCCATTCGCCTGGGACGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAg > 4:6025/1‑149 (MQ=255) cTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCg < 7:196818/105‑1 (MQ=255) cTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCg > 8:196818/1‑105 (MQ=255) cTGCTCATCAACCAACGCTGGCCGTCTCCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTCATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTCGCTACGCCCGATAACCATGGCCCAGCCTACTTCAg > 6:216379/1‑149 (MQ=255) 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gCTGGCCGTCTCCTATGCAAGGGCATGTCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTcc < 3:253711/149‑1 (MQ=255) ctcCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGc > 7:321900/1‑125 (MQ=255) ctcCTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGc < 8:321900/125‑1 (MQ=255) ccTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGACCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTa > 2:325684/1‑131 (MQ=255) ccTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGACCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTa < 1:325684/131‑1 (MQ=255) cTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGc > 2:106522/1‑149 (MQ=255) cTATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGc > 8:331971/1‑149 (MQ=255) tATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCCTGCCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCGGTTTGCCATTGCt > 5:71797/1‑149 (MQ=255) tATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCt > 2:166409/1‑149 (MQ=255) tATGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCt > 6:46930/1‑149 (MQ=255) tGCAAGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTc < 2:135425/148‑1 (MQ=255) aaGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTgg < 4:330905/81‑1 (MQ=255) aaGCGCATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCCAgt > 6:170193/1‑149 (MQ=255) cATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCCAGTGgtgt > 1:326440/1‑149 (MQ=255) cATGGCGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCAAGTGgtgt > 1:321212/1‑149 (MQ=255) cGAGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCCAGTGGTGTTTCCg < 3:112773/149‑1 (MQ=255) aGGCATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCCAGTGGTGTTTCCGGa < 8:21412/149‑1 (MQ=255) cATCCAGGGTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCCAGTGGTGTTTCCGGATAg < 7:331971/149‑1 (MQ=255) gTACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCCAGTGGTGTTTCCGGATAGACGCTCAg < 5:46930/149‑1 (MQ=255) tACGTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCCAGTGGTGTTTCCGGATAGACGCTCAgg < 5:195447/149‑1 (MQ=255) gTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCCAGTGGTGTTTCCGGATAGACGCTCa > 4:266355/1‑144 (MQ=255) gTATCTGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCCAGTGGTGTTTCCGGATAGACGCTCa < 3:266355/144‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tGATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCCAGTGGTGTTTCCGGATAGACGCTCAGGTAATGa > 3:75609/1‑147 (MQ=255) gATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAg > 1:326397/1‑92 (MQ=255) gATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCCAGTGgtgt < 6:117352/121‑1 (MQ=255) gATCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCCAGTGGTGTTTCGGGATAGACGCTCAGGTAATGa > 5:66714/1‑146 (MQ=255) aTCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCCAGTGGTGTTTCCGGATAGACGCTCAGGTAATGaaa < 1:166409/147‑1 (MQ=255) aTCCCCGGCCCGGTTGCCTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCCAGTGGTGTTTCCGGATAGACGCTCAGGTAATGAAAGa < 3:178770/149‑1 (MQ=255) 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cTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCCAGTGGTGTTTCCGGATAGACGCTCAGGTAATGAAAGaacaa < 8:202991/136‑1 (MQ=255) cTGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCCAGTGGTGTTTCCGGATAGACGCTCAGGTAATGAAAGAACAACAgagcgggaa > 7:202991/1‑140 (MQ=255) tGGCCATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCAGTTTGCCATTGCTCCAGTGGTGTTTCCGGATAGACGCTCAGGTAATGAAAGAACAACGGATGATCACg > 4:336416/1‑147 (MQ=255) ccATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGGCGTTGCGCCAGTGGTGTTTCCGGATAGACGCTCAGGTAATGAAAGAACAACGGATGATCACGCAGtt > 1:285527/1‑149 (MQ=255) cATGCGCCTGGGCCGGCAAAGTTGGCTACGCCCGCTACCCATGGCCCAGCCTACTTCAGCGGCACGTAGATGTCCGTTTGCCATTGCTCCAGTGGTGTTTCCGGATAGACGCTCAGGTAATGAAAGAACAACGGATGATCACGCAGttc < 6:52526/149‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |