| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,711,994 | A→G | 5.9% | I1037T (ATC→ACC) | metH ← | cobalamin‑dependent methionine synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,711,994 | 0 | A | G | 5.9% | 198.0 / 2.1 | 67 | I1037T (ATC→ACC) | metH | cobalamin‑dependent methionine synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/29); new base G (2/2); total (36/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.53e-01 | |||||||||||
TCGTCGCCCTTGTCCTGGTAAGCCTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGATCAGCTTCTCATCGATCAGCTTGTC > NC_002947/2711847‑2712139 | tcgtcgCCCTTGTCCTGGTAAGCCTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGAt < 6:295015/149‑1 (MQ=255) gtcgCCCTTGTCCTGGTAAGCCTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATg < 8:68596/148‑1 (MQ=255) gtcgCCCTTGTCATGGTAAGCCTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATgg > 3:15415/1‑149 (MQ=255) ccTTGTCCTGGTAAGCCTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTctgc > 5:272963/1‑149 (MQ=255) tCCTGGTAAGCCTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGgcg > 3:229032/1‑149 (MQ=255) cTGGTAAGCCTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGgcg > 3:112425/1‑147 (MQ=255) cTGGTAAGCCTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCa < 6:272963/149‑1 (MQ=255) ggTAAGCCTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAgg > 2:10750/1‑149 (MQ=255) gTAAGCCTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAg < 4:112425/147‑1 (MQ=255) aaGCCTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCAGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGa > 8:40088/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATg > 8:194805/1‑148 (MQ=255) cTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATg > 5:347616/1‑147 (MQ=255) cTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATg > 1:202351/1‑147 (MQ=255) cACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTTATGGt < 1:310202/123‑1 (MQ=255) cACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTTATGGt > 2:310202/1‑123 (MQ=255) cTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGAt > 5:180882/1‑134 (MQ=255) cTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGAt < 6:180882/134‑1 (MQ=255) tCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTg > 8:127535/1‑131 (MQ=255) tCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTg < 7:127535/131‑1 (MQ=255) ggCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGc < 7:40088/147‑1 (MQ=255) ccGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCTGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGTCAGTGCCTGGcc < 4:229032/149‑1 (MQ=255) cGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGGCACTGGcca < 2:202351/149‑2 (MQ=255) ggtgATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGTGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGGTGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGcc > 1:82694/1‑135 (MQ=255) ggtgATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGTGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGGTGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGcc > 1:77878/1‑135 (MQ=255) ggtgATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGGTGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGcc < 2:82694/135‑1 (MQ=255) ggtgATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGGTGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGcc < 2:77878/135‑1 (MQ=255) aaaCCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGa < 4:15415/148‑1 (MQ=255) aaCCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACtt > 2:286777/1‑144 (MQ=255) aaCCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACtt < 1:286777/144‑1 (MQ=255) cTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATgtc < 6:192528/145‑1 (MQ=255) cTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATgtc > 5:192528/1‑145 (MQ=255) cTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTAGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGcc > 1:140582/1‑121 (MQ=255) cTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTAGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGcc < 2:140582/121‑1 (MQ=255) tAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTc > 5:350630/1‑149 (MQ=255) gTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAg < 3:94443/87‑1 (MQ=255) tCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCAc < 1:10750/149‑1 (MQ=255) tCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCAc > 5:196694/1‑149 (MQ=255) tCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCAc > 6:163233/1‑149 (MQ=255) aCGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGt < 7:194805/148‑1 (MQ=255) gCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTgg > 4:318211/1‑149 (MQ=255) cACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTggcc < 6:196694/149‑1 (MQ=255) gTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTggccggc > 7:134273/1‑148 (MQ=255) ttCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATTTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAg > 2:187687/1‑147 (MQ=255) ggTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGcc < 6:350630/149‑1 (MQ=255) cgacgaAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTc < 4:34102/121‑1 (MQ=255) cgacgaAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTc > 3:34102/1‑121 (MQ=255) cgacgaAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTggccggc > 5:333202/1‑137 (MQ=255) cgacgaAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTggccggc < 6:333202/137‑1 (MQ=255) gacgaAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATa > 3:288894/1‑149 (MQ=255) gacgaAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATa > 6:321362/1‑149 (MQ=255) gaAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACcg > 6:184744/1‑149 (MQ=255) ggCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTctg > 8:269652/1‑42 (MQ=255) gCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAgc > 2:232184/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAgc > 2:27232/1‑149 (MQ=255) aGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCt < 6:347616/149‑1 (MQ=255) cGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGa > 7:316143/1‑149 (MQ=255) gACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGAt < 8:316143/149‑1 (MQ=255) aCCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACtt < 2:207206/87‑1 (MQ=255) aCCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACtt > 1:207206/1‑87 (MQ=255) aGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGATCAGc < 1:232184/149‑1 (MQ=255) gggCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGATCAGCTtct > 8:47874/1‑149 (MQ=255) gCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGATCAGCTTCTCa < 3:318211/149‑1 (MQ=255) cTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCATGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCTGATCAGCGCGCGCGCGGTATTCGGCTtctggc < 7:243564/149‑4 (MQ=38) cTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGATCAGCTTCTCAt > 3:239438/1‑149 (MQ=255) cTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGATCAGCTTCTCAt < 5:321362/149‑1 (MQ=255) ccGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGATCAGCTTCTCATCGa < 8:134273/148‑1 (MQ=255) gATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGATCAGCTTCTCATCGATCAGCTTGTc > 2:180536/1‑147 (MQ=255) | TCGTCGCCCTTGTCCTGGTAAGCCTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGATCAGCTTCTCATCGATCAGCTTGTC > NC_002947/2711847‑2712139 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |