Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,551,996 | T→C | S409P (TCA→CCA) | PP_4882 → | iron ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,551,996 | 0 | T | C | 96.9% | 206.9 / ‑2.8 | 64 | S409P (TCA→CCA) | PP_4882 | iron ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (32/30); total (33/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.14e-01 |
GCCCTATCTGCTGCACGCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCAGCCTTTGCGCTG > NC_002947/5551854‑5552136 | gCCCTATCTGCTGCACGCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCgg > 8:224864/1‑149 (MQ=255) cccTATCTGCTGCACGCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGt < 3:300313/149‑1 (MQ=255) tgctgcACGCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCAcc > 6:297287/1‑149 (MQ=255) gcACGCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGGGGCCGGCGCTGTACCAGACCCCGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACcgcg > 1:304991/1‑149 (MQ=255) aCGCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCt > 5:12736/1‑148 (MQ=255) gCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGaa > 8:183549/1‑149 (MQ=255) gCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCCGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGaa < 6:126115/149‑1 (MQ=255) cccTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAAc < 5:297287/149‑1 (MQ=255) ccTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAAc > 8:63146/1‑148 (MQ=255) gCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTg > 7:214618/1‑142 (MQ=255) gCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTg < 8:214618/142‑1 (MQ=255) cccGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAgg < 6:12736/148‑1 (MQ=255) cccGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGc > 7:321594/1‑149 (MQ=255) cGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCtt < 7:183549/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAg > 5:329294/1‑144 (MQ=255) ggCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAg < 6:329294/144‑1 (MQ=255) gTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGAc > 5:121573/1‑149 (MQ=255) ttGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTg > 2:301729/1‑149 (MQ=255) cTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGgaaga < 7:63146/149‑1 (MQ=255) aCGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGgaagaa < 6:99823/147‑1 (MQ=255) aCGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGgaagaa < 8:321594/147‑1 (MQ=255) ggTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCcgcgc > 1:23220/1‑149 (MQ=255) gtTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCa > 2:334597/1‑149 (MQ=255) gtTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTgg < 3:339332/134‑1 (MQ=255) gtTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTgg > 4:339332/1‑134 (MQ=255) gtTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCa > 4:50067/1‑149 (MQ=255) ttcttcGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCAc > 5:243430/1‑149 (MQ=255) ttcttcGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCAc > 5:359695/1‑149 (MQ=255) ttcGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGCCGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCt > 2:30723/1‑149 (MQ=255) gCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCTCGCGCACCCTTgg > 8:263783/1‑149 (MQ=255) gCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTg < 6:243430/148‑1 (MQ=255) cccTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGgc < 8:358581/149‑1 (MQ=255) ccTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGgcg > 7:362134/1‑149 (MQ=255) cTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGagca < 3:245357/149‑1 (MQ=255) ggCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGgcgc < 3:5393/135‑1 (MQ=255) ggCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGgcgc > 4:5393/1‑135 (MQ=255) gcTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGaa > 3:281787/1‑87 (MQ=255) gcTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGaa < 4:281787/87‑1 (MQ=255) aCCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGc > 5:214896/1‑149 (MQ=255) ccAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGc < 4:266489/148‑1 (MQ=255) aGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCgg < 1:301729/149‑1 (MQ=255) gACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCggg < 6:214896/149‑1 (MQ=255) aCCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGt < 2:365009/149‑1 (MQ=255) aCCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGt > 6:329495/1‑149 (MQ=255) ccACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTg < 1:334597/149‑1 (MQ=255) cACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGt > 3:273347/1‑147 (MQ=255) cACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGt < 4:273347/147‑1 (MQ=255) cACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGa > 1:267431/1‑149 (MQ=255) aCGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGAc < 7:224864/149‑1 (MQ=255) ccTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTg < 6:121573/149‑1 (MQ=255) ctgctgTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGat > 6:327645/1‑149 (MQ=255) ttGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGatcatc < 8:352752/147‑1 (MQ=255) ggCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCg < 7:31888/126‑1 (MQ=255) ggCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCg > 8:31888/1‑126 (MQ=255) ggCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTc < 2:304991/148‑1 (MQ=255) cTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCgg > 6:23145/1‑149 (MQ=255) cgcTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCAt < 5:23145/148‑1 (MQ=255) ctgctgTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATggc > 8:295823/1‑149 (MQ=255) ctgctgTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGATGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATggc > 1:306381/1‑149 (MQ=255) tgctgTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATggcg > 5:72960/1‑149 (MQ=255) tgTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGATGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCa < 2:306381/149‑1 (MQ=255) ccGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCAGCCTTTgc < 7:263783/149‑1 (MQ=255) ccGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCAGCCTTTgc > 5:397587/1‑149 (MQ=255) ggCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCAGCCTTTGCGCTg < 8:362134/148‑1 (MQ=255) | GCCCTATCTGCTGCACGCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTAC‑GTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCAGCCTTTGCGCTG > NC_002947/5551854‑5552136 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |