Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 842,515 | Δ1 bp | 6.1% | coding (535/1722 nt) | PP_0725 ← | TPR repeat‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 842,515 | 0 | C | . | 6.1% | 214.6 / 6.3 | 66 | coding (535/1722 nt) | PP_0725 | TPR repeat‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (28/34); new base . (2/2); total (30/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGGGCGCGCAGCAGGATCGGGGCGACTTCGCCGTTTTGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTCCATGTAGGTCATGGACTCGTCATAGCGACCGGCG > NC_002947/842373‑842663 | cGGGCGCGCAGCAGGATCGGGGCGACTTCGCCGTTTTGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACcagcag < 1:253883/149‑1 (MQ=255) cGGGCGCGCAGCAGGATCGGGGCGACTTCGCCGTTTTGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACcagcag < 2:355911/149‑1 (MQ=255) gggCGCGCAGCAGGATCGGGGCGACTTCGCCGTTTTGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGGAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAgg > 8:135058/1‑149 (MQ=255) cgcAGCAGGCTCGGGGCGACTTCGCCGTTTTGGGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTc < 8:273792/149‑1 (MQ=255) cgcAGCAGGATCGGGGCGACTTCGCCGTTTTGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTc < 1:172830/149‑1 (MQ=255) cagcagGATCGGGGCGACTTCGCCGTTTTGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGa < 5:205603/149‑1 (MQ=255) gcagGATCGGGGCGACTTCGCCGTTTTGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGaaa < 1:182917/149‑1 (MQ=255) agGATCGGGGCGACTTCGCCGTTTTGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACt < 3:90651/149‑1 (MQ=255) gATCGGGGCGACTTCGCCGTTTTGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACtgt < 4:328056/149‑1 (MQ=255) tCGGGGCGACTTCGCCGTTTTGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTgtgt < 6:352688/149‑1 (MQ=255) cTTCGCCGTTTTGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCg > 4:233179/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGTTTTGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCA‑CAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTc > 7:36603/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGTTTTGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGACTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGACGGGGTATGTCA‑CAGCATGCGTTCGCAACTGAGTAGA‑AGGcagac > 7:177889/1‑145 (MQ=255) cGTTTTGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCgg < 4:305048/149‑1 (MQ=255) cGTTTTGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTCGCAGTAGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCgg > 4:295495/1‑149 (MQ=255) ttGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTg < 1:149167/148‑1 (MQ=255) ttGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGc > 5:178487/1‑149 (MQ=255) ttGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCGTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTg < 7:135058/148‑1 (MQ=255) gtgCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGctc > 5:368245/1‑149 (MQ=255) tgCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGctct > 8:257002/1‑149 (MQ=255) tGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGt < 5:317261/149‑1 (MQ=255) gACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTc > 3:127999/1‑149 (MQ=255) cTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCgg > 7:246205/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAgg > 6:160590/1‑149 (MQ=255) aGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGc > 5:341613/1‑149 (MQ=255) aGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGc > 4:42421/1‑149 (MQ=255) cttcttCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAgg < 3:233179/149‑1 (MQ=255) cttcGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGctc > 3:123551/1‑116 (MQ=255) cttcGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGctc < 4:123551/116‑1 (MQ=255) ttcGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCCGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGt > 5:318557/1‑149 (MQ=255) tcGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTc > 7:31895/1‑149 (MQ=255) gCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGa > 2:251856/1‑126 (MQ=255) gCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGa < 1:251856/126‑1 (MQ=255) gCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTgg < 6:341613/148‑1 (MQ=255) ccGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCA‑CAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGgt < 8:36603/148‑1 (MQ=255) ccGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGACGAATATCAGCTGGCCGGTGTCGTGGTCTTTCA‑CAGCAGGCGCTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTGCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGgt < 8:177889/148‑1 (MQ=255) cGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGgtg < 8:31895/149‑1 (MQ=255) tCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTATGGTCGGTTTCGGCTGCGGCCAGGGGGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTc > 3:227445/1‑149 (MQ=255) gTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCgccct > 8:138311/1‑149 (MQ=255) ttCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGaaa > 2:50841/1‑69 (MQ=255) ttCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGaaa < 1:50841/69‑1 (MQ=255) cagcagcagGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCgccctgg < 4:127999/148‑1 (MQ=255) gcagcagGGCCTTGCCGAATATCATCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCCGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGA‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGGGAGCAAGTCGATGTGGGTGTCgccctgtccg > 7:51313/1‑148 (MQ=255) gcagcagGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCgccctggccc > 3:9557/1‑149 (MQ=255) cagcagGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCgccctggccct < 6:178487/149‑1 (MQ=255) gcagGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGc < 3:295495/149‑1 (MQ=255) gCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTAc < 8:246205/149‑1 (MQ=255) gCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTAc < 6:318557/149‑1 (MQ=255) cGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTcc < 7:138311/149‑1 (MQ=255) atCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTCCATg > 3:27966/1‑147 (MQ=255) tCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTCCATGTAg > 5:83437/1‑149 (MQ=255) cAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTCCATGTAg < 6:368245/148‑1 (MQ=255) cAGCTGGCCGTTCGCGGGGTCTTTCACCAGCAGGCGGTCGAAACTGTGTAGC‑ACGCCGGCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTCCATGTAg < 4:227445/148‑1 (MQ=255) aGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGCGAGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTCCATGTAgg > 1:91917/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTCCATGTAGGTc < 4:9557/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTAcc < 3:245526/133‑1 (MQ=255) cTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTAcc > 4:245526/1‑133 (MQ=255) gCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTCCATGTAGGTCATgg < 7:257002/149‑1 (MQ=255) gCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTCCATGTAGGTCATg > 1:48641/1‑148 (MQ=255) cGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTCCATGTAGGTCATGGAc > 3:321666/1‑149 (MQ=255) ggggTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTCCATGTAGGTCATGGACTCGTCa < 6:83437/148‑1 (MQ=255) gggTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTCCATGTAGGTCATGGACTCGTCATa < 5:160590/149‑1 (MQ=255) tttCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTCCATGTAGGTCAt < 2:151735/132‑1 (MQ=255) tttCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTCCATGTAGGTCAt > 1:151735/1‑132 (MQ=255) tttCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTCCATGTAGGTCATGGACTCGTCATAGCGAc > 5:318401/1‑149 (MQ=255) aCCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTCCATGTAGGTCATGGACTCGTCATAGCGACCGgc < 3:42421/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTCCATGTAGGTCATGGACTCGTCATAGCGACCGgcg > 4:190328/1‑149 (MQ=255) | CGGGCGCGCAGCAGGATCGGGGCGACTTCGCCGTTTTGTGCCGGGTGCGACTCGAGCAGTTCCAGGGCTTCTTCGGTCTTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCAGGGCCTTGCCGAATATCAGCTGGCCGTTGTCGGGGTATTTCACCAGCAGGCGTTCGAAACTGTGTAGC‑AGGCCGTCGCGGGTGCTCTGGTCGGTTTCGGCTGCGGACAGGGCGAGGAAGTCGAAGTGGGTGTCGCCCTGGCCCTGCAGTACCTTTTCCATGTAGGTCATGGACTCGTCATAGCGACCGGCG > NC_002947/842373‑842663 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |