Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,451,800 | Δ1 bp | 5.5% | coding (3319/3450 nt) | mfd ← | transcription‑repair coupling factor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,451,800 | 0 | G | . | 5.5% | 240.6 / 6.6 | 73 | coding (3319/3450 nt) | mfd | transcription‑repair coupling factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/36); new base . (2/2); total (35/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.53e-01 |
CACGCATGAGTCTTCCTTAGGCAGGCTGT‑GGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTCTTGGTCG > NC_002947/2451653‑2451946 | cACGCATGAGTCTTCCTTAGGCAGGCTGTGGGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTg > 1:44415/1‑149 (MQ=255) cGCATGAGTCTTCCTTAGGCAGGCTGT‑GGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGAt < 2:301927/149‑1 (MQ=255) gCATGAGTCTTCCTTAGGCAGGCTGT‑GGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGATCTGGGTGGCCCGTTAGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTgatc > 6:222877/1‑145 (MQ=255) ttCCTTAGGCAGGCTGT‑GGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAt > 8:6851/1‑148 (MQ=255) ccTTAGGCAGGCTGT‑GGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑c < 3:234114/147‑1 (MQ=255) ccTTAGGCAGGCTGT‑GGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑Ca < 6:281828/148‑1 (MQ=255) ccTTACGCATGCTGT‑GGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGTTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAt < 6:257836/146‑1 (MQ=255) cTTAGGCAGGCTGT‑GGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAgc > 7:327399/1‑148 (MQ=255) caggcCGG‑GGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGATCTGGGGGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCT‑GATCAAGCTGATCCAGGGTCAgc < 5:222877/149‑2 (MQ=255) gcTGT‑GGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTggg < 2:19276/149‑1 (MQ=255) tCAGGCGCTCGAACAGCGACTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGTGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGTAGTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAAGGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGGCGACCGgt < 4:342020/149‑1 (MQ=255) aGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAgg > 4:320335/1‑129 (MQ=255) aGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAgg < 3:320335/129‑1 (MQ=255) gcgcTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑Gttt > 5:271785/1‑149 (MQ=255) cgcTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTc < 2:305079/149‑1 (MQ=255) gcTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCg < 6:80205/149‑1 (MQ=255) tCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGt > 4:135016/1‑129 (MQ=255) tCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGt < 3:135016/129‑1 (MQ=255) cGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑GAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCt > 2:136003/1‑149 (MQ=255) aaCAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTc < 5:31175/149‑1 (MQ=255) aaCAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTc < 7:295966/149‑1 (MQ=255) aaCAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTc < 3:165124/149‑1 (MQ=255) aaCAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTc > 1:87895/1‑149 (MQ=255) cTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTc > 5:25190/1‑147 (MQ=255) cTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGa < 7:6851/149‑1 (MQ=255) cTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGa < 4:337150/149‑1 (MQ=255) tCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCT‑GATCAAGCTGATCCAGGGTCAgc < 2:92450/117‑2 (MQ=38) tCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCT‑GATCAAGCTGATCCAGGGTCAgc > 1:92450/1‑116 (MQ=38) aGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCtt < 2:87895/149‑1 (MQ=255) ggTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCACTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGAACATGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGAACGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGc > 7:158393/1‑149 (MQ=255) gTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGc > 4:361383/1‑148 (MQ=255) gTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGc > 1:88660/1‑148 (MQ=255) gAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGt > 6:12159/1‑149 (MQ=255) aaccGTCCGGCGGGGCGTTCCCTCGGACCCCGCACGCGCAACGGGGTGCCCCCTTCCAACTTCTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGGGGGGCCCCCGGG‑GTTGCGCCTTCCAACTCGACCTTGCCACCGtt < 2:88660/146‑1 (MQ=255) aaaCGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGtt > 3:173244/1‑149 (MQ=255) aCGTTCGTCTGGGCGCGCCATCGGTACCAGCAAGCGGAACTGGGTGGCCTCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTgg < 8:327399/149‑1 (MQ=255) aCGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTgg < 4:173244/149‑1 (MQ=255) cGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTggg < 2:44415/149‑1 (MQ=255) cgtcgGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCAAGCTTGCCACCGTTGGGcccc > 6:349729/1‑149 (MQ=255) tcgGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAgg > 2:212611/1‑90 (MQ=255) tcgGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAgg < 1:212611/90‑1 (MQ=255) gggCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATc > 8:28127/1‑149 (MQ=255) gCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGa > 3:349283/1‑149 (MQ=255) ccATCTGAACCAGTAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGTACTAGTAACGTTTGCGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTc < 8:158393/149‑1 (MQ=255) ggTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGa < 6:271785/148‑1 (MQ=255) cAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGcc > 8:288925/1‑147 (MQ=255) cAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGcc > 2:216450/1‑147 (MQ=255) ggAAGCTGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGc < 5:12159/149‑1 (MQ=255) ggAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGtt > 1:169877/1‑118 (MQ=255) ggAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGtt < 2:169877/118‑1 (MQ=255) ggAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTcc > 8:121517/1‑149 (MQ=255) cTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGt < 7:28127/149‑1 (MQ=255) ggTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCAAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGc < 5:349729/148‑1 (MQ=255) gCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCtt > 2:299160/1‑149 (MQ=255) cccTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCtt > 4:302371/1‑147 (MQ=255) cccTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCtt > 3:237996/1‑147 (MQ=255) cTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGt < 4:237996/149‑1 (MQ=255) gAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGAc < 7:288925/148‑1 (MQ=255) aaCTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGt > 3:171857/1‑149 (MQ=255) aCTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGt > 3:71334/1‑148 (MQ=255) ttGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTc < 6:103838/108‑1 (MQ=255) ttGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAg > 3:29728/1‑140 (MQ=255) ttGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAg < 4:29728/140‑1 (MQ=255) ttGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAg > 8:104668/1‑149 (MQ=255) tAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGgc < 4:171857/148‑1 (MQ=255) aaCGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGgcg > 7:25906/1‑148 (MQ=255) gTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTggg < 3:39425/85‑1 (MQ=255) gTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTggg > 4:39425/1‑85 (MQ=255) gCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTc > 3:234047/1‑149 (MQ=255) gCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTc > 5:193626/1‑149 (MQ=255) acTGACCCT‑GATCAAGCTGATCCAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTc > 6:54664/2‑149 (MQ=255) cTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTCt < 7:121517/149‑1 (MQ=255) cTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTCt < 1:136003/149‑1 (MQ=255) aCCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTCtt < 8:25906/147‑1 (MQ=255) tGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGTAGTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTCTTGGTCg > 1:61019/1‑149 (MQ=255) | CACGCATGAGTCTTCCTTAGGCAGGCTGT‑GGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTCTTGGTCG > NC_002947/2451653‑2451946 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |