Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,985,847:1 | +C | 9.2% | coding (89/753 nt) | flgA → | flagella basal body P‑ring formation protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,985,847 | 1 | . | C | 9.2% | 237.3 / 21.0 | 65 | coding (89/753 nt) | flgA | flagella basal body P‑ring formation protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (31/28); new base C (2/4); total (33/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.27e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.87e-01 |
CCTTTCGTTGCAACTCAGGTAGCGAGTCGGCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCG > NC_002947/4985704‑4985994 | ccTTTCGTTGCAACTCAGGTAGCGAGTCGGCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACgg > 7:99646/1‑149 (MQ=255) ccTTTCGTTGCAACTCAGGTAGCGAGTCGGCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACgg > 6:299916/1‑149 (MQ=255) ccTTTCGTTGCAACTCAGGTAGCGAGTCGGCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACgg < 2:295057/149‑1 (MQ=255) cTTTCGTTGCAACTCCGGTAGCGAGGCGGCTCGGGCTTTGCGTGTTTGAGGGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGCCGATTGACCCGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGt < 5:64752/149‑1 (MQ=255) gTTGCAACTCAGGTAGCGAGTCGGCACGGGCTTTGCTGTTTTGAGTGTCCTGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACCCGCCTGCAGACTGGCCCCCTGGCCCCGCGGTGGCTGCTGATGACCGGCGTTCG‑CCAGGTGGCg > 4:244101/1‑148 (MQ=255) gCAACTCAGGTAGCGAGTCGGCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAAcg > 2:336122/1‑149 (MQ=255) cAACTCAGGTAGCGAGTCGGCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCGCCACCGT‑GCGAAcgc < 8:36084/149‑1 (MQ=255) aaCTCAGGTAGCGAGTCGGCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGGTGATGCCCGGCGTTCGCCACCGT‑GCGAAcgcc < 6:120697/149‑2 (MQ=255) aaCTCAGGTAGCGAGTCGGCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAAcgcg < 6:270225/149‑1 (MQ=255) aCTCAGGTAGCGAGTCGGCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGt > 4:239844/1‑149 (MQ=255) cTCAGGTAGCGAGTCGGCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCGCCACCGT‑GCGAAcgccgg < 6:331702/149‑4 (MQ=255) aGGTAGCGAGTCGGCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCGCCACCGT‑GCGAAcgccgg > 3:331379/1‑143 (MQ=255) aGGTAGCGAGTCGGCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCGCCACCGT‑GCGAAcgccgg < 4:331379/146‑4 (MQ=255) aGGTAGCGAGTCGGCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCAACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCAc > 6:342781/1‑149 (MQ=255) gTAGCGAGTCGGCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAAc > 5:378849/1‑139 (MQ=255) gTAGCGAGTCGGCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAAc < 6:378849/139‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGcc < 7:40777/149‑1 (MQ=255) ggCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACa < 5:224812/149‑1 (MQ=255) gCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGt > 6:215315/1‑132 (MQ=255) aCGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCt > 8:244980/1‑149 (MQ=255) tttgctttTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCgg > 7:115345/1‑149 (MQ=255) ttttttGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGgtg > 8:245439/1‑146 (MQ=255) ttttttGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGgtg < 7:245439/146‑1 (MQ=255) tCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGttt < 1:336122/149‑1 (MQ=255) aTGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCt < 8:216467/149‑1 (MQ=255) tGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCtt < 8:99646/149‑1 (MQ=255) tGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCtt < 3:239844/149‑1 (MQ=255) acacGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGaa > 1:251921/1‑149 (MQ=255) acacGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGaa > 8:225494/1‑149 (MQ=255) acacGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGaa < 7:244980/149‑1 (MQ=255) acGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAAtt > 5:248786/1‑149 (MQ=255) aaaaCGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTctc < 6:354423/149‑3 (MQ=255) aCGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGt > 8:62963/1‑149 (MQ=255) cGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGtt < 7:62963/149‑1 (MQ=255) aCATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGa < 5:299916/149‑1 (MQ=255) cATTTTCCCGACGATTGTCACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGGCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGaa < 3:244101/149‑1 (MQ=255) tttCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGACCAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGAt > 8:240992/1‑149 (MQ=255) cccGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTa < 6:32057/148‑1 (MQ=255) ccGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATc > 7:30743/1‑149 (MQ=255) ccGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTGCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATc > 2:232233/1‑149 (MQ=255) acgaTTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGt < 5:342781/149‑1 (MQ=255) acGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCaccacc > 6:25523/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGa < 7:142023/149‑1 (MQ=255) gctgACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTg > 3:197932/1‑149 (MQ=255) tgACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTAt > 1:223401/1‑128 (MQ=255) tgACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTAt < 2:223401/128‑1 (MQ=255) aCTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTgccgg > 2:7270/1‑149 (MQ=255) cTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTgccggc > 7:281762/1‑149 (MQ=255) tGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAGCAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCAGCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTgccggcc > 6:81169/1‑149 (MQ=255) cGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTAt < 4:121467/149‑1 (MQ=255) ccACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATc > 6:171646/1‑149 (MQ=255) cACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGATCGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATc > 8:177071/1‑148 (MQ=255) cGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAg < 6:248786/149‑1 (MQ=255) cGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAg < 8:115345/149‑1 (MQ=255) gctgATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGc > 2:14036/1‑149 (MQ=255) ctgATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGc < 8:281762/148‑1 (MQ=255) tgATGCCCGGCGTTCA‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTAt < 1:325040/98‑1 (MQ=255) tgATGCCCGGCGTTCA‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTAt > 2:325040/1‑98 (MQ=255) tGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGa < 7:225494/148‑1 (MQ=255) tGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGAc > 8:165414/1‑149 (MQ=255) ccGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCa > 8:226308/1‑149 (MQ=255) cGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGTCCCAc < 1:232233/149‑1 (MQ=255) cGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCAc < 5:25523/149‑1 (MQ=255) ggCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACg > 5:188831/1‑149 (MQ=255) gCGTTCGCCACCGT‑GCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCCCCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGc > 7:341909/1‑149 (MQ=255) g‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTgcg > 5:71588/1‑148 (MQ=255) | CCTTTCGTTGCAACTCAGGTAGCGAGTCGGCACGGGCTTTGCTTTTTTGAGTGTCATGCACACGAAAACGACATTTTCCCGACGATTGACACGCCTGCTGACTGGCCCGCTGGCCACGCTGTGCCTGCTGATGCCCGGCGTTCG‑CACGGTGGCGAACGCGTTCACCTTGCCTGAACAGCTTATCGGTGTCACCCAAGGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCG > NC_002947/4985704‑4985994 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |