| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,997,189:1 | +G | 11.5% | intergenic (‑158/+42) | PP_5252 ← / ← PP_5253 | hypothetical protein/arylesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,997,189 | 1 | . | G | 11.5% | 204.9 / 25.3 | 61 | intergenic (‑158/+42) | PP_5252/PP_5253 | hypothetical protein/arylesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (22/32); new base G (4/3); total (26/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.41e-01 | |||||||||||
ACTAGGGGCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAAT > NC_002947/5997043‑5997335 | aCTAGGGGCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑Ac < 3:211608/149‑1 (MQ=255)aCTAGGGGCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑Ac < 2:56162/149‑1 (MQ=255) gCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTa < 4:358988/149‑1 (MQ=255) cGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAgg > 4:84263/1‑149 (MQ=255) ggCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGAAGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCAGCTACA‑ACGTCTGTAg > 1:111292/1‑149 (MQ=39) ggCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAg > 2:62360/1‑147 (MQ=255) ggggACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑Cgg < 8:316133/148‑1 (MQ=255) gggACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTa < 1:199358/140‑1 (MQ=255) gggACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTa > 2:199358/1‑140 (MQ=255) gggACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGt < 3:272954/149‑1 (MQ=255) gggACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGt > 8:22747/1‑149 (MQ=255) ggACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGtt < 7:333945/149‑1 (MQ=255) cTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGt > 8:237413/1‑135 (MQ=255) cTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGt < 7:237413/135‑1 (MQ=255) cGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAG‑Cgg > 3:39459/1‑140 (MQ=255) cGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAG‑Cgg < 4:39459/140‑1 (MQ=255) cGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCACCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCcg > 3:364488/1‑149 (MQ=255) aTGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAG‑c > 2:264857/1‑132 (MQ=255) aTGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAG‑c < 1:264857/132‑1 (MQ=255) cGGTTTATGCATGGCCCGGGCTGTAACTGAGGTGCGGGGG‑‑TTTGATGAAGGTTCGCCCGGGTCAAGCTTTTTGCTGCGTGGGCGGGCGTCTTGGCTGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTTTAGGAG‑GGGGTTTACCCGCGAATGTTTc < 8:128232/149‑1 (MQ=255) tGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGCTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAAt < 7:19706/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCg < 3:84263/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTAc > 3:158866/1‑145 (MQ=255) ccTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTAc < 4:158866/145‑1 (MQ=255) cTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCt > 7:115354/1‑148 (MQ=255) ggCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGaa < 2:111292/148‑1 (MQ=255) tGAATGCCTGGGCGGGGG‑‑GTGGAAGACGGTAAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAAc < 6:279855/149‑1 (MQ=37) aaTGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGaa < 7:319927/142‑1 (MQ=255) gATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGGGCCTACA‑AGGGGGGTGGGGG‑CGGGGTTAGCCGCGAATGTTTCCCCCAATTACCGCGGAAGGAACGCCAGc > 2:4447/1‑149 (MQ=37) gTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAG‑c < 4:51411/92‑1 (MQ=37) gTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAG‑c > 3:51411/1‑92 (MQ=37) tGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCa < 8:115354/149‑1 (MQ=255) gTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTc < 7:22747/149‑1 (MQ=255) ttGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCAGCAAAA‑AAGTAGGTAGGAGCCGGGTTTACCGGCTAAT‑TTTACCACAAAAAACGCTGAAGTAACCCCACCAAATccacctta > 6:322320/1‑142 (MQ=255) gaagaaGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTGCGACA‑ACGTGTGTTGGAG‑CGGGGTTTCCCGCGAATGTTTGCCACAATTACCGCTGGAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTAAgc > 7:328257/1‑149 (MQ=38) aagaagGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTGCTACA‑ACGTGTGTAGGAG‑AGGGGTTACAAGGGAATGTTTACCACAATTTAAGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTAAgct > 7:319815/1‑149 (MQ=37) ttAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTgcgc < 1:331632/149‑1 (MQ=255) aGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCa < 4:364488/148‑1 (MQ=255) cccTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGa < 3:229383/149‑1 (MQ=255) cccTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGa < 1:62360/149‑1 (MQ=255) cccTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑AAGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGATTGTTTCCGAGAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGa < 5:256576/149‑1 (MQ=255) ccTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAg > 5:294258/1‑149 (MQ=255) gTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGATCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCa < 5:322320/148‑1 (MQ=255) aGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTTAAACCGCTCCTACA‑ACGTGTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGCATGTTTGCCACAATTTCCGCTGAAGGAACGCCCCCAAGTCCAAATTACCCAGCGGCGCATTAGTAACTgg > 6:122904/1‑147 (MQ=21) gCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTc < 7:6422/84‑1 (MQ=255) gctgcCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGt < 7:128187/148‑1 (MQ=255) gctgcCT‑GGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CCGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCGAATTCAGATGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTgc > 4:300040/1‑149 (MQ=38) ggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGc < 3:205135/149‑1 (MQ=255) ggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGc < 8:328257/149‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCCCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTTCCCGCGAATGTTTCACACAATTAACGCTGAAGGAAAGCCCGCCAGTCCTCATTCAGCTGCGGCGGATGAGTCAGTGGAAAACCGTGCGGCGCCCCGGGAt > 4:296334/1‑148 (MQ=255) aCCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAg < 3:17031/144‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAg > 4:17031/1‑144 (MQ=255) cccGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgc > 8:63550/1‑149 (MQ=255) cccGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgc > 7:218499/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcg > 6:346327/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcg < 6:294258/149‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcg > 4:318355/1‑149 (MQ=255) cTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCAc < 7:63550/147‑1 (MQ=255) cTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGa < 5:122904/149‑1 (MQ=255) tACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGaa > 8:266867/1‑149 (MQ=255) cA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAAt < 1:4447/148‑1 (MQ=255) | ACTAGGGGCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGG‑‑GTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑CGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAAT > NC_002947/5997043‑5997335 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |