| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,143,433:1 | +A | 5.9% | coding (357/1539 nt) | rbsA‑II → | ribose ABC transporter ‑ ATP‑binding subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,143,433 | 1 | . | A | 5.9% | 274.4 / 9.6 | 68 | coding (357/1539 nt) | rbsA‑II | ribose ABC transporter ‑ ATP‑binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (33/31); new base A (2/2); total (35/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.97e-01 | |||||||||||
GCATTTCAGCCCGCGCCAGGTGGAGCGCCTGGGCATTGGCTTCATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTGCAGATCGTCCGCGCGCTGCTGATCAAACCGCGTGTGCTGGTGTTCGACGAA > NC_002947/3143286‑3143580 | gCATTTCAGCCCGCGCCAGGTGGAGCGCCTGGGCATTGGCTTCATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCagcag‑c > 8:219929/1‑149 (MQ=255) gCCCGCGCCAGGTGGAGCGCCTGGGCATTGGCTTCATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGCTCTTCGGCGATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAGACGCGCGGc > 1:303233/1‑149 (MQ=255) cccGCGCCAGGTGGAGCGCCTGGGCATTGGCTTCATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGc > 5:201471/1‑147 (MQ=255) cccGCGCCAGGTGGAGCGCCTGGGCATTGGCTTCATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGc < 6:201471/147‑1 (MQ=255) cccGCGCCAGGTGGAGCGCCTGGGCATTGGCTTCATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCcg > 2:222489/1‑149 (MQ=255) tGGAGCGCCTGGGCATTGGCTTCATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTctgctg < 3:161018/149‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGGCATTGGCTTCATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGgac < 3:300350/149‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGGCATTGGCTTCATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGgac < 7:60210/149‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGGCATTGGCTTCATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGCTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAGACGCGCGGCCTCGCG‑ctgctgaga < 2:303233/149‑4 (MQ=255) gcCTGGGCATTGGCTTCATCCACCAGGAACGCCTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGgacg > 1:39958/1‑148 (MQ=255) gcCTGGGCATTGGCTTCATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGgacgac < 8:201286/149‑1 (MQ=255) gcCTGGGCATTGGCTTCATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGgacgac < 3:128276/149‑1 (MQ=255) cTGGGCATTGGCTTCATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGacta > 8:186423/1‑149 (MQ=255) aTTGGCTTCATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCgg > 7:306/1‑149 (MQ=255) ttGGCTTCATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGc < 5:141108/149‑1 (MQ=255) ttCATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAGACGCGCGGCCTCGCG‑ctgctgagag < 8:321883/133‑5 (MQ=255) ttCATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAGACGCGCGGCCTCGCG‑ctgctgagag > 7:321883/1‑129 (MQ=255) cATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGAc > 1:259859/1‑149 (MQ=255) aTCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACt < 5:188797/149‑1 (MQ=255) tCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTg > 8:340227/1‑149 (MQ=255) tCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTg > 8:345026/1‑149 (MQ=255) caccaGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGcc > 8:258771/1‑149 (MQ=255) caccaGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGcc > 8:784/1‑149 (MQ=255) caccaGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGcc < 2:39958/149‑1 (MQ=255) accaGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCg > 7:123100/1‑149 (MQ=255) g‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATgcg > 7:72765/1‑149 (MQ=255) ttgttgCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGc > 6:261650/1‑130 (MQ=255) ttgttgCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGc < 5:261650/130‑1 (MQ=255) tgCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATgcg < 3:227275/143‑1 (MQ=255) tgCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATgcg > 4:227275/1‑143 (MQ=255) gCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATc < 7:258771/148‑1 (MQ=255) gCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATc < 1:222489/148‑1 (MQ=255) gCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCg > 5:57100/1‑149 (MQ=255) ccGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCgg > 3:355163/1‑149 (MQ=255) cccGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGaa < 7:186423/149‑1 (MQ=255) ccGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAAc < 6:160028/149‑1 (MQ=255) gTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAAc < 5:9001/147‑1 (MQ=255) gTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAAc > 6:9001/1‑147 (MQ=255) gTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACt > 5:27065/1‑148 (MQ=255) gTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTg < 2:149584/149‑1 (MQ=255) cGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAgcg < 4:355163/149‑1 (MQ=255) gTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATg < 3:152699/124‑1 (MQ=255) gTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATg > 4:152699/1‑124 (MQ=255) ggTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGa < 5:200761/149‑1 (MQ=255) gTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGACGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAg > 8:4376/1‑149 (MQ=255) tGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAg > 8:238597/1‑148 (MQ=255) tGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAg > 7:66802/1‑148 (MQ=255) aaGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCaa > 5:20240/1‑149 (MQ=255) aGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAAc < 4:183442/149‑1 (MQ=255) ccTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGc > 6:143163/1‑109 (MQ=255) ccTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGc < 5:143163/109‑1 (MQ=255) ccTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCaa > 1:74164/1‑146 (MQ=255) ccTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCaa > 1:275704/1‑146 (MQ=255) gTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATgg > 6:142342/1‑149 (MQ=255) gTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATg < 2:275704/148‑1 (MQ=255) ttcGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTg > 8:148198/1‑147 (MQ=255) ggCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTg > 7:39851/1‑144 (MQ=255) ggCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTg > 7:45636/1‑144 (MQ=255) ggCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTGCAGa < 7:340227/148‑1 (MQ=255) ggCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTGCAGa < 7:345026/148‑1 (MQ=255) gCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGGACTGCGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTg > 4:286136/1‑143 (MQ=255) gCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGCCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTGCAGATc < 7:784/149‑1 (MQ=255) aTTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTGCAGATCGTCCGCGCgctgc < 7:219929/149‑1 (MQ=255) cTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTGCAGATCGTCCGCGCgctgct > 7:329495/1‑137 (MQ=255) cTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTGCAGATCGTCCGCGCgctgct < 8:329495/137‑1 (MQ=255) gATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTGCAGATCGTCCGCGCGCTGCTGATCAAACCGCgt < 8:72765/147‑1 (MQ=255) gATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTGCAGATCGTCCGCGCGCTGCTGATCAAACCGCgt < 6:20240/147‑1 (MQ=255) tCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTGCAGATCGTCCGCGCGCTGCTGATCAAACCGCGTGTGc < 6:27065/149‑1 (MQ=255) gccgcTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTGCAGATCGTCCGCGCGCTGCTGATCAAACCGCGTGTGCTg > 3:365418/1‑149 (MQ=255) agcag‑cGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTGCAGATCGTCCGCGCGCTGCTGATCAAACCGCGTGTGCTGGTGTTcga < 8:306/148‑1 (MQ=255) gcag‑cGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTGCAGATCGTCCGCGCGCTGCTGATCAAACCGCGTGTGCTGGTGTTcgac > 1:64881/1‑148 (MQ=255) cag‑cGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTGCAGATCGTCCGCGCGCTGCTGATCAAACCGCGTGTGCTGGTGTTcgacg > 6:254889/1‑148 (MQ=255) ag‑cGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTGCAGATCGTCCGCGCGCTGCTGATCAAACCGCGTGTGCTGGTGTTCGACGaa < 7:28981/149‑1 (MQ=255) | GCATTTCAGCCCGCGCCAGGTGGAGCGCCTGGGCATTGGCTTCATCCACCAGGAACG‑CTTGTTGCCGGCCCGTTTCACCGTGGGTGAAGCCTTGTTCTTCGGCCATGAACGGCGATTCGGGCCCTTGCTCGATCGCCGCTCTCAGCAG‑CGCGAGGCCGCGCGTCTGCTGGACGACTACTTCGGCCTGCGACTGCCGGCGAATGCGCTGATCGGTGAACTGAGCAGCGCCGAGCAACAGATGGTGCAGATCGTCCGCGCGCTGCTGATCAAACCGCGTGTGCTGGTGTTCGACGAA > NC_002947/3143286‑3143580 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |