New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 69470 = | 45 (0.760) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 6.0% | coding (377/528 nt) | gmhB | D‑glycero‑beta‑D‑manno‑heptose‑1,7‑bisphosphate 7‑phosphatase |
? | NC_002947 | 69519 = | 52 (0.930) | coding (328/528 nt) | gmhB | D‑glycero‑beta‑D‑manno‑heptose‑1,7‑bisphosphate 7‑phosphatase |
ATTAGTTCTCTGGCGATAGCTGCCAGATCGTCGAAAATCAGTGTAGTTTCCGGGACGCCTTTTTCCAGGGTCCGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAATCGCACCCTTCGTCCGGCCCATGCGGGCAATACACGATATGGCCCACCTCACCGCCCTGCTCG > NC_002947/69323‑69616 | cgctggcaacccttgaggccatgcatgcgcgcctgcgcgcgctggtggccgagcagggcggtgaggtgggccatatcgtgtattgcccgcatgggccggacgaagggtgcgattgccgcaagcccaagcccggcatgttgcgggcgaTc > 6:304834‑M1/148‑149 (MQ=255) ttAGTTCTCAGGCGATAGCTGCCAGATCGTCGAAAATCAGTGTAGTTACCGGGACGCCATTTTACAGCGTACGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCAACGACGGGCAGGGCGGCCTCCAGCACACCTAAGCTCTCg > 4:242072/1‑149 (MQ=255) gcaacccttgaggccatgcatgcgcgcctgcgcgcgctggtggccgagcagggcggtgaggtgggccatatcgtgtattgcccgcatgggccggacgaagggtgcgattgccgcaagcccaagcccggcatgttgcgggcgaTCGCcga > 6:362638‑M1/143‑149 (MQ=255) tctGGCGATAGCTGCCAGATCGTCGAAAATCAGTGTAGTTTCCGGGACGCCTTTTTCCAGGGTCCGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCcgacg > 3:27496/1‑148 (MQ=255) tGGCGATAGCTGCCAGATCGTCGAAAATCAGTGTAGTTTCCGGGACGCCTTTTTCCAGGGTCCGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCcgacga < 4:352342/147‑1 (MQ=255) gCGATAGCTGCCAGATCGTCGAAACTCAGTGTAGTTTCCGGGACGCCTTTTTCCAGGGTCCGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCa < 5:355686/149‑1 (MQ=255) gCGATAGCTGCCAGATCGTCGAAAATCAGTGTAGTTTCCGGGACGCCTTTTTCCAGGGTCCGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCa < 7:326590/149‑1 (MQ=255) gATCGTCGAAAATCAGTGTAGTTTCCGGGACGCCTTTTTCCAGGGTCCGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAgg < 6:83728/149‑1 (MQ=255) tcgtcgAAAATCAGTGTAGTTTCCGGGACGCCTTTTTCCAGGGTCCGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGc < 7:224685/148‑1 (MQ=255) tcgAAAATCAGTGTAGTTTCCGGGACGCCTTTTTCCAGGGTCCGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCcgac > 6:278837/1‑125 (MQ=255) tcgAAAATCAGTGTAGTTTCCGGGACGCCTTTTTCCAGGGTCCGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCcgac < 5:278837/125‑1 (MQ=255) aaaaTCAGTGTAGTTTCCGGGACGCCTTTTTCCAGGGTCCGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTg < 3:330983/149‑1 (MQ=255) tCAGTGTAGTTTCCGGGACGCCTTTTTCCAGGGTCCGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTaa > 4:12765/1‑149 (MQ=255) gTTTCCGGGACGCCTTTTTCCAGGGTCCGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGc < 8:170919/149‑1 (MQ=255) agcagggcggtgaggtgggccatatcgtgtattgcccgcatgggccggacgaagggtgcgattgccgcaagcccaagcccggcatgttgcgggcgaTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGc > 8:316992‑M1/97‑149 (MQ=255) cTTTTTCCAGGGTCCGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCaa > 3:16004/1‑148 (MQ=255) cTTTTTCCAGGGTCCGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAAc < 2:156426/149‑1 (MQ=255) tttttCCAGGGTCCGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCcaca > 8:206556/1‑149 (MQ=255) tttttCCAGGGTCCGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACa > 8:84212/1‑149 (MQ=255) aGGGTCCGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCggg > 7:219558/1‑149 (MQ=255) gCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCgggcttgggc < 6:327658/149‑1 (MQ=255) gCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGc > 8:116184/1‑149 (MQ=255) gCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCaa < 4:27496/148‑1 (MQ=255) ccGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAAt < 7:84212/148‑1 (MQ=255) ccGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAATc < 3:12765/149‑1 (MQ=255) ccGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAATc < 2:65945/149‑1 (MQ=255) ggTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAAt < 7:90171/146‑1 (MQ=255) ggTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAAt > 8:90171/1‑146 (MQ=255) ttCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAATCGCAccc > 3:50151/1‑149 (MQ=255) cACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCgggcttgg < 7:36214/128‑1 (MQ=255) cACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCgggcttgg > 8:36214/1‑128 (MQ=255) cACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCg < 2:212711/121‑1 (MQ=255) cACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCg > 1:212711/1‑121 (MQ=255) aCCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAGCCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAATCGCACCCTTc < 3:242072/149‑1 (MQ=255) ccAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGc > 2:370264/1‑100 (MQ=255) ccAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGc < 1:370264/100‑1 (MQ=255) gCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAATCGCACCCTTCGTcc > 4:110771/1‑149 (MQ=255) ttGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAATCGCACCCTTCGTCCGGCCCAt > 5:209210/1‑149 (MQ=255) cACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGc > 4:129830/1‑80 (MQ=255) cACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGc < 3:129830/80‑1 (MQ=255) attgccgcaagcccaagcccggcatgttgcgggcgaTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGa < 2:288349‑M1/49‑1 (MQ=255) attgccgcaagcccaagcccggcatgttgcgggcgaTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGa > 1:288349‑M1/37‑85 (MQ=255) gggCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAATCGCACCCTTCGTCCGGCCCATGCGGGCAATACACGata < 4:16004/149‑1 (MQ=255) cTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAATCGCACCCTTCGTCCGGCCCATGCGGGCAATACACGATATGGCCCa < 3:357301/149‑1 (MQ=255) tCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAATCGCACCCTTCGTCCGGCCCATGCGGGCAATACACGATATGGCCCAc > 1:169258/1‑149 (MQ=255) cACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAATCGCACCCTTCGTCCGGCCCATGCGGGCAATACACGATATGGCCCACCTCACCg > 1:200631/1‑149 (MQ=255) aCCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAATCGCACCCTTCGTCCGGCCCATGCGGGCAATa < 7:238675/126‑1 (MQ=255) aCCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAATCGCACCCTTCGTCCGGCCCATGCGGGCAATa > 8:238675/1‑126 (MQ=255) aCCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAATCGCACCCTTCGTCCGGCCCATGCGGGCAATACACGATATGGCCCACCTc < 6:159832/144‑1 (MQ=255) aCCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAATCGCACCCTTCGTCCGGCCCATGCGGGCAATACACGATATGGCCCACCTc > 5:159832/1‑144 (MQ=255) cTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAATCGCACCCTTCGTCCGGCCCATGCGGGCAATACACGATATGGCCCACCTCACCGccc < 6:209210/149‑1 (MQ=255) tGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAATCGCACCCTTCGTCCGGCCCATGCGGGCAATACACGATATGGCCCACCTCACCGCCCTGCTCg > 2:79037/1‑149 (MQ=255) | ATTAGTTCTCTGGCGATAGCTGCCAGATCGTCGAAAATCAGTGTAGTTTCCGGGACGCCTTTTTCCAGGGTCCGCTCGCCCTTGCCGGTCTTCACCAGCACGGGTTGTGCACCGACGGCCAGGGCGGCCTCCAGGTCACCTTTGCTGTCGCCGACGAACCAGACGCCTTCAAGGCCGATCTGGTAATGCTCGGCGATCGCCCGCAACATGCCGGGCTTGGGCTTGCGGCAATCGCACCCTTCGTCCGGCCCATGCGGGCAATACACGATATGGCCCACCTCACCGCCCTGCTCG > NC_002947/69323‑69616 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |