New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 357496 | 59 (1.000) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 6.7% | coding (841/1377 nt) | tdcG‑I | L‑serine dehydratase |
? | NC_002947 | = 357527 | 55 (0.970) | coding (872/1377 nt) | tdcG‑I | L‑serine dehydratase |
TACCCGGCGGGCTGAACGTGCGCCGCCGTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGCGTTGTCGATTACTTCCTGGCTGCCGCCGCTGTGGGCATCCTGT > NC_002947/357350‑357643 | tACCCGGCGGGCTGAACGTGCGCCGCCGTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑Cgccgcc > 3:44087/1‑149 (MQ=255) ccGGCGGGCTGAACGTGCGCCGCGGTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGt < 2:180294/149‑1 (MQ=255) gCTGAACGTGCGCCGCCGTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTGAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCa < 1:206018/149‑1 (MQ=255) gCTGAACGTGCGCCGCCGTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCa > 1:369344/1‑149 (MQ=255) gAACGTGCGCCGCCGTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATgg < 8:55667/149‑1 (MQ=255) aaCGTGCGCCGCCGTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTgg > 5:22914/1‑140 (MQ=255) aaCGTGCGCCGCCGTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGGCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTgg < 6:22914/140‑1 (MQ=255) tGCGCCGCCGTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGAcc < 1:342172/149‑1 (MQ=255) gccgccGTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACc‑‑gcg > 1:52884/1‑149 (MQ=255) gccgccGTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACc‑‑gcg < 7:92712/149‑1 (MQ=255) ccgccgTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATg < 2:309268/139‑1 (MQ=255) ccgccgTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATg > 1:309268/1‑139 (MQ=255) ccgccgTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑gcgc > 8:132407/1‑149 (MQ=255) ccgccgTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑gcgc < 2:64476/149‑1 (MQ=255) cgTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTAc < 2:54613/149‑1 (MQ=255) cgTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTAc < 4:91057/149‑1 (MQ=255) cgTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTAc < 2:59894/149‑1 (MQ=255) gccAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAAcgg > 3:12386‑M2/1‑146 (MQ=255) cAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAACGCCGCCGttggtaggcgcggtcaccatgcgcccaccggcg < 3:38602‑M1/149‑34 (MQ=255) cAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAAcggcg < 7:106898‑M2/149‑6 (MQ=255) cTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAAcggcgcggc > 7:47531/1‑149 (MQ=255) tGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATg > 7:318925/1‑122 (MQ=255) tGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATg < 8:318925/122‑1 (MQ=255) cGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGcat > 5:119850/1‑149 (MQ=255) gCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGTTGGTAGGCGC‑‑GGTCACCATGCGCCCACCGGcggcgttttcttcatt > 4:19586‑M2/1‑133 (MQ=255) gCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCgg > 4:182077/1‑149 (MQ=255) aaaTCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTGGGCGGTCAATGAACAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGtg < 6:212803/149‑1 (MQ=255) aTCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGtgct > 6:360076/1‑149 (MQ=255) gCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCAt > 2:98879/1‑149 (MQ=255) cAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCAt > 6:225329/1‑148 (MQ=255) aGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGGCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATtac < 8:148634/149‑1 (MQ=255) cAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGttggtaggcgcggtcaccatgcgcccaccggcggc < 5:180298‑M1/112‑36 (MQ=255) cAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGttggtaggcgcggtcaccatgcgcccaccggcggc > 6:180298‑M1/1‑77 (MQ=255) aaCGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACAt > 1:217982/1‑149 (MQ=255) aTCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCtt < 7:132407/149‑1 (MQ=255) gACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATg < 8:219935/149‑1 (MQ=255) aCCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCATACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGc > 8:210136/1‑149 (MQ=255) aTGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGt < 5:360076/149‑1 (MQ=255) gTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATTAACAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGa < 8:231120/148‑1 (MQ=255) gTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGACGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATTGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGAt < 6:207352/149‑1 (MQ=255) gTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGAt < 2:217982/149‑1 (MQ=255) cATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGc < 2:204027/133‑1 (MQ=255) cATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGc > 1:204027/1‑133 (MQ=255) cATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAAt > 6:6702/1‑149 (MQ=255) cATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAAt < 2:112716/149‑1 (MQ=255) cATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAAt > 1:161237/1‑149 (MQ=255) aTGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATc > 6:98249/1‑149 (MQ=255) aTGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATc < 5:225329/149‑1 (MQ=255) tGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAg < 8:95452/130‑1 (MQ=255) aaTGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGc < 1:98879/149‑1 (MQ=255) aaTGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGc > 2:105890/1‑149 (MQ=255) gggTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGc > 5:237686/1‑146 (MQ=255) gggTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGc < 6:237686/146‑1 (MQ=255) ggTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGCGtt < 5:98249/148‑1 (MQ=255) gTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATTGTGACC‑‑GCTCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGCGTTGt < 1:63651/149‑1 (MQ=255) gTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGCGTTGt < 6:72441/149‑1 (MQ=255) gTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGCGTTGt > 2:217675/1‑149 (MQ=255) aaCCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGCGTTGTCGa < 3:182077/149‑1 (MQ=255) ttCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGCGTTGTCGATTACtt > 8:348056/1‑149 (MQ=255) cGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGTCC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGCGTTGTCGATTACTTc < 4:44087/148‑1 (MQ=255) ccTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGCGTTGTCGATTACTTCCTg < 7:348056/149‑1 (MQ=255) cTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGCGTTGTCGATTACTTCCTgg < 2:369344/149‑1 (MQ=255) ttGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGCGTTGTCGATTACTTCCTGGc > 2:242336/1‑149 (MQ=255) ggTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGCGTTGTCGATTACTTCCTGGCTgccg > 2:84021/1‑149 (MQ=255) aaTGAAGAAAA‑‑‑CGCCGccggtgggcgcatggtgaccgcgcctaccaacggcgttttcttcattgaccgccaaggcgaacaggttgacccattccatggcactcatggtcgagccgatcacgttgggcttgccgatttcctgcaggctgc > 4:19586‑M1/1‑16 (MQ=255) aTGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGCGTTGTCGATTACTTCCTGGCTGCCGCCGCt > 2:252795/1‑149 (MQ=255) gaagaaAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGCGTTGTCGATTACTTCCTGGCTGCCGCCGCtgt > 2:81787/1‑149 (MQ=255) agaaAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGCGTTGTCGATTACTTCCTGGCTGCCGCCGCTGTgg < 1:242336/149‑1 (MQ=255) cGCCGttggtaggcgcggtcaccatgcgcccaccggcggcgttttcttcattgaccgccaaggcgaacaggttgacccattccatggcactcatggtcgagccgatcacgttgggcttgccgatttcctgcaggctgcggtgcagcttg < 7:106898‑M1/149‑145 (MQ=255) gccgccGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAAcggcgttttcttcattgaccgccaaggcgaacaggttgacccattccatggcactcatggtcgagccgatcacgttg > 6:180298‑M2/1‑35 (MQ=255) gccgccGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAAcggcgttttcttcattgaccgccaaggcgaacaggttgacccattccatggcactcatggtcgagccgatcacgttg < 5:180298‑M2/112‑78 (MQ=255) ccGttggtaggcgcggtcaccatgcgcccaccggcggcgttttcttcattgaccgccaaggcgaacaggttgacccattccatggcactcatggtcgagccgatcacgttgggcttgccgatttcctgcaggctgcggtgcagcttggc > 3:12386‑M1/1‑3 (MQ=255) cgccgGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAAcggcggcgttttcttcattgaccgccaaggcgaacaggttgacccattccatggcactcatggtcgagccgatcacgttgggcttgccgatttcctgcaggctgcggtgcagcttg < 3:38602‑M2/149‑117 (MQ=255) cgccgGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGCGTTGTCGATTACTTCCTGGCTGCCGCCGCTGTGGGCATCCtgt > 2:106309/1‑149 (MQ=255) | TACCCGGCGGGCTGAACGTGCGCCGCCGTGCCGCCAAGCTGCACCGCAGCCTGCAGGAAATCGGCAAGCCCAACGTGATCGGCTCGACCATGAGTGCCATGGAATGGGTCAACCTGTTCGCCTTGGCGGTCAATGAAGAAAA‑‑‑CGCCGCCGGTGGGCGCATGGTGACC‑‑GCGCCTACCAACGGCGCGGCGGGCATCATCCCGGCAGTGCTGCATTACTACATGCGCTTCAGCGATGCGGTGGATGAATCCAGCGTTGTCGATTACTTCCTGGCTGCCGCCGCTGTGGGCATCCTGT > NC_002947/357350‑357643 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |