New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1036521 = | 70 (1.190) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 5.9% | coding (226/591 nt) | PP_0895 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1036566 = | 62 (1.130) | coding (271/591 nt) | PP_0895 | hypothetical protein |
CCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAGCGCGAGTCCTACGCACA > NC_002947/1036373‑1036666 | gtcgctcgaccgcgcagaacgcgcagtaatcgaactcggccagtttgtgtgcgtaggactcgcgctcgatgaagaagcgaacccccaggccctgtccgcggtatgccggcaacaccagcgactcaccgaagtagtacacactggccggg < 8:330354‑M1/1‑1 (MQ=255) cgcgAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGt < 4:275818/149‑1 (MQ=255) gcgAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTc > 3:342821/1‑149 (MQ=255) gcgAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTc < 3:5815/149‑1 (MQ=255) gctcgaccgcgcagaacgcgcagtactcgaactcggccagtttgtgtgcgtaggactcgcgctcgatgaagaagcgaacccccaggccctgtccgcggtatgccggcaacaccagctactcaccgaagtagtacacattggccggGTc > 2:342442‑M1/146‑148 (MQ=255) tcgaccgcgcagaacgcgcagtaatcgaactcggccagtttgtgtgcgtaggactcgcgctcgatgaagaagcgaacccccaggccctgtccgcggtatgccggcaacaccagcgcctcaccgaagtagtacacactggccggGTcgcg < 5:191395‑M1/6‑1 (MQ=255) ccccTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGccc < 4:250156/148‑1 (MQ=255) cccTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGcccct > 2:83557/1‑147 (MQ=255) cTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAAt > 6:272689/1‑149 (MQ=255) aCCTTTACGACGGCATCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTc > 8:29433/1‑149 (MQ=255) aCCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGAGCAGCCTGGTAGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCAGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAAtt > 5:71197/1‑148 (MQ=255) cTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCca < 5:57349/149‑1 (MQ=255) tttACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCcag > 2:340676/1‑149 (MQ=255) gcgcagtaatcgaactcggccagtttgtgtgcgtaggactcgcgctcgatgaagaagcgaacccccaggccctgtccgcggtatgccggcaacaccagcgactcaccgaagtagtacacactggccggGTCgcgc < 8:134327‑M1/7‑1 (MQ=255) gcgcagtaatcgaactcggccagtttgtgtgcgtaggactcgcgctcgatgaagaagcgaacccccaggccctgtccgcggtatgccggcaacaccagcgactcaccgaagtagtacacactggccggGTCgcgc > 7:134327‑M1/129‑135 (MQ=255) acgacgGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGTTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCcagca < 8:319493/148‑1 (MQ=255) cgacgGCACACCGGAGGACGAGGACGACTACCTGGCCAACTTTGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCGTGACTCCGGGAAGGGGGGCGGCGCCTCTACCTGCCTGCCGCTTGGGGATGGCGCGCCCGAATTACagcagc < 2:370147/149‑1 (MQ=255) gacgGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCagcagc > 4:276396/1‑148 (MQ=255) 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cGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGGGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGgc < 7:172644/149‑1 (MQ=255) ggCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACTGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGgcgt > 2:20285/1‑147 (MQ=255) tttgtgtgcgtaggactcgcgctcgatgaagaagcgaacccccaggccctgtccgcggtatgccggcaacaccagcgactcacctaagtagtacacactggccggGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGa > 3:323842‑M1/106‑149 (MQ=255) gACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGAccc > 5:35809/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGGTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCa < 6:20204/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAggg < 5:266486/135‑1 (MQ=255) ccTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAggg > 6:266486/1‑135 (MQ=255) ccTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGc < 1:340676/147‑1 (MQ=255) ccTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGGCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGc < 2:152738/147‑1 (MQ=255) tGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAgt > 5:320100/1‑149 (MQ=255) gCCAAGTATGCCCGCCCCGGGCGCAGCCTGGTTGTCCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCGTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCGGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGCGCGCGACCCGGCCAgtgt < 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ctcgatgaagaagcgaacccccaggccctgtccgcggtatgccggcaacaccagcgactcaccgaagtagtacacactggccggGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCg > 4:104768‑M1/85‑132 (MQ=255) cccGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTc > 1:333357/1‑149 (MQ=255) gCTCCGGGCGCAGCCTGGTTTTGCTGGCGTTGGTCGACGCCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGTCTTGCCGCTGGTGTTTGTCGCTCCCTATTTCCTGCAGTTATTCTTGGTTTTGGGTTGTGATCCGGTCAGTGTGTACTACTTCGGt < 8:54638/149‑1 (MQ=255) gCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTACTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGt < 8:145115/149‑1 (MQ=255) tgaagaagcgaacccccaggccctgtccgcggtatgccggcaacaccagcgactcaccgaagtagtacacactggccggGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGAc < 5:268022‑M1/45‑1 (MQ=255) tgaagaagcgaacccccaggccctgtccgcggtatgccggcaacaccagcgactcaccgaagtagtacacactggccggGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGAc > 6:268022‑M1/80‑124 (MQ=255) gccGGGCGCAGCGGGGTTGGGCGGGGGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCTGCTGGTTTATGCCGCGCCCTAATTCCAGCAGCCATTCTTGGCCTAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGa < 8:231949/148‑1 (MQ=255) cGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGaa < 2:356475/88‑1 (MQ=255) cGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGaa > 1:356475/1‑88 (MQ=255) cGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAg < 4:342821/148‑1 (MQ=255) ccTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGgc < 3:64441/107‑1 (MQ=255) ccTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGgc > 4:64441/1‑107 (MQ=255) ggTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGAAAGGTGGGCGGCGCCTATACCGGCCTGCCGCGGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGCCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGc < 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CCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAGCGCGAGTCCTACGCACA > NC_002947/1036373‑1036666 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |