New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 253605 | 47 (0.800) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 8.4% | coding (1512/1731 nt) | PP_0203 | dipeptidase |
? | NC_002947 | = 253676 | 44 (0.800) | coding (1441/1731 nt) | PP_0203 | dipeptidase |
CGTTGGGAAGATCGTGCACCGAAGTCGCGCCGGCCGAGGTACCGAACTCATGCTTCATACCCAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTGGGAATGCGCAGATTCACCGCCAGTTTCACGCCTTTTTCATCCACCCCGACAAAAGTCAGCGAG > NC_002947/253529‑253824 | cGTTGGGAAGATCGTGCACCGAAGTCGCGCCGGCCGAGGTACCGAACTCATGCTTCATACCCAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAg < 1:179510‑M2/149‑2 (MQ=255) gggAAGATCGTGCACCGAAGTCGCGCCGGCCGAGGTACCGAACTCATGCTTCATACCCAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGCCCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAggcca < 3:92913‑M2/149‑6 (MQ=255) ggAAGATCGTGCACCGAAGTCGCGCCGGCCGAGGTACCGAACTCATGCTTCATACCCAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAggccac < 5:247104‑M2/149‑7 (MQ=255) ggAAGATCGTGCACCGAAGTCGCGCCGGCCGAGGTACCGAACTCATGCTTCATACCCAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAggccac < 1:251330‑M2/149‑7 (MQ=255) gATCGTGCACCGAAGTCGCGCCGGCCGAGGTACCGAACTCATGCTTCATACCCAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGaa < 1:269930/149‑1 (MQ=255) gTGCACCGAAGTCGCGCCGGCCGAGGTACCGAACTCATGCTTCATACCCAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAgtgt < 2:179510/149‑1 (MQ=255) cACCGAAGTCGCGCCGGCCGAGGTACCGAACTCATGCTTCATACCCAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTg < 7:212377/148‑1 (MQ=255) cgcgCCGGCCGAGGTACCGAACTCATGCTTCATACCCAGGTTATCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGAGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCggg > 3:295057/1‑149 (MQ=255) gcgcCGGCCGAGGTACCGAACTCATGCTTCATACCCAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGt > 5:222845/1‑149 (MQ=255) gccgAGGTACCGAACTCATGCTTCATACCCAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCAttt < 1:10090/149‑1 (MQ=255) ccGAACTCATGCTTCATACCCAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGttt > 3:305811/1‑149 (MQ=255) ccGAACTCATGCTTCATACCCAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGttt > 3:185889/1‑149 (MQ=255) cGAACTCATGCTTCATACCCAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTg > 7:278291/1‑149 (MQ=255) gAACTCATGCTTCATACCCAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGt < 8:25947/149‑1 (MQ=255) cTCATGCTTCATACCCAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGt < 5:337270/142‑1 (MQ=255) cTCATGCTTCATACCCAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGt > 6:337270/1‑142 (MQ=255) aCCCAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAggccaccgagaacctgggtatgaagcatgagttcggtacctcggccggcgcgacttcgg < 3:175366‑M2/149‑60 (MQ=255) cccAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCt < 4:272070/148‑1 (MQ=255) ccAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTg > 3:261247/1‑149 (MQ=255) ccAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCGCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTg < 2:251330/149‑1 (MQ=255) aGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGa > 7:163706/1‑148 (MQ=255) aGGTGCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGTGCCTTGACACACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTCCCTCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGACGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGa < 8:163706/148‑1 (MQ=255) gTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCg < 6:247104/149‑1 (MQ=255) ttCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGt > 4:259352/1‑149 (MQ=255) gTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGAt > 3:306920/1‑149 (MQ=255) ccACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGc < 4:185889/149‑1 (MQ=255) cacaGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCAGGGTCCATTTGCCCAGATTGTCGGCCAGATCATCCTTGATCCTGGCGATCGGCt > 8:138666/1‑149 (MQ=255) acaGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAggccaccgagaacctgggtatgaagcatgagttcggtacctcggccggcgcgacttcggtgcacgatcttcccaacgg < 7:219036‑M2/149‑79 (MQ=255) gCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAggccaccgagaacctgggtatgaagcatgagttcggtacctcggccggcgcgacttcggtgcacgatcttcccaacggtgt > 8:219036‑M2/1‑68 (MQ=255) cGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGGCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTcccc < 8:278291/149‑1 (MQ=255) cGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCa < 2:184717/97‑1 (MQ=255) cGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCa > 1:184717/1‑97 (MQ=255) gACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCt < 4:107400/137‑1 (MQ=255) gACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTGGGAATgcgc < 4:305811/148‑1 (MQ=255) aCCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTGGGAATGCGCAg < 1:221493/149‑1 (MQ=255) ccACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGCCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGGCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCAACCTTGATCCTGGCCATCGGCTTCCCCTTGGCAATGCCCaca > 4:78631/1‑146 (MQ=255) gaCTCGCCTTCAGTGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGa < 8:322459/111‑1 (MQ=255) aCTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTgg < 5:169863/135‑1 (MQ=255) aCTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTAGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTAGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGCCTTCCCCTTgc > 6:169863/1‑134 (MQ=255) gCCTTCAGGGTTGCGGTACCTCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGGTTTGCCGGGTCCATTTGGGCAGTGTGTAGGCCTGTTCATCCTTGATCGTGGGGATCGGCTTCCCCGTGGGAATGCGCTGAGTCAACg > 6:309334/1‑149 (MQ=255) gCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTGGGAATGCGCAGATTCAc > 1:297061/1‑147 (MQ=255) gCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTGGGAATGCGCAGATTCAc < 2:297061/147‑1 (MQ=255) cAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTAATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTGGGAATGCGCAGATTCACCGCCAGt > 3:233644/1‑149 (MQ=255) aGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTGGGAATGCGCAGATTCACCGCCAGt < 6:342257/148‑1 (MQ=255) aGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAACTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTGGGAATGCGCAGATTCACCGCCAGtt < 5:309334/149‑1 (MQ=255) gggTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAggccaccgagaacctgggtatgaagcatgagttcggtacctcggccggcgcgacttcggtgcacgatcttcccaacggtgtgcaatttggcctggccatgccggaggtgaa > 4:175366‑M2/1‑38 (MQ=255) ttGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTGGGAATGCGCAGATTCACCGCCAGTTTCAc < 4:92913/149‑1 (MQ=255) gTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCACAGTTTGTCGGCCAGTTAATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTGGGAATGCGCAGATTCACCGCCAGTTTCACGCCtt > 2:321205/1‑149 (MQ=255) aTCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTGGGAATGCGCAGATTCACCGCCAGTTTCACGCCTTTTTc < 6:222845/149‑1 (MQ=255) ggCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTGGGAATGCGCAGATTCACCGCCAGTTTCACGCCTTTTTCATc < 4:306920/149‑1 (MQ=255) ctagTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCGTTGATCGTGGCGAACGGCTTCCCCTTGGGAATGCGCAGATTCACCGCAAGTTTCACGCCTTTTTAATcaa > 2:130099/4‑147 (MQ=255) aGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTGGGAATGCGCAGATTCACCGCCAGTTTCACGCCTTTTTCATCCACCCCGa > 4:26464/1‑148 (MQ=255) tGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTGGGAATGCGCAGATTCACCGCCAGTTTCACGCCGTTTTCATCCACCCCGACaa > 5:287692/1‑147 (MQ=255) gTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTGGGAATGCGCAGATTCACCGCCAGTTTCACGCCTTTTTCATCCACCCCGACAAAAGt > 7:29067/1‑147 (MQ=255) tCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTGGGAATGCGCAGATTCACCGCCAGTTTCACGCCTTTTTCATCCACCCCGACAAAAGTCAg < 8:29067/149‑1 (MQ=255) aGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTGGGAATGCGCAGATTCACCGCCAGTTTCACGCCTTTATCATCCACCCCGACAAAAGTCAGCGAg < 7:138666/149‑1 (MQ=255) | CGTTGGGAAGATCGTGCACCGAAGTCGCGCCGGCCGAGGTACCGAACTCATGCTTCATACCCAGGTTCTCGGTGGCCACAGCGAGCAGGGCCTTGACCCACTCGCCTTCAGGGTTGCGGTACATCGGCTCGTCCAGGCTGAAGTCGAAGGCCACCGAAGTGTTGCTTTGCCGGGTCCATTTGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCATCCTTGATCGTGGCGATCGGCTTCCCCTTGGGAATGCGCAGATTCACCGCCAGTTTCACGCCTTTTTCATCCACCCCGACAAAAGTCAGCGAG > NC_002947/253529‑253824 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |