New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 797745 = | 72 (1.220) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 5.3% | coding (193/390 nt) | PP_0683 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 797806 = | 76 (1.360) | coding (254/390 nt) | PP_0683 | hypothetical protein |
CGAGGCCAGGGCTGGCCATGTCGACGAACTGAACCTGATCGCCATCGAAGGCGGTGACTACCTGCTCGAGGCCCGGGTCAAAGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCACCCGGAAGAAGACCTGAAGGTGCCGATTTCCCAGCGTTCGGCCTGGTAGCTGC > NC_002947/797660‑797946 | gtacccatgccgcacatttcgtcctgcaccgaccagtgcaccaggttcatcgagaccatggggatggtttgcagcaacttgcgcgCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATgcgc > 8:307614‑M1/86‑149 (MQ=255) gAGGCCAGGGCTGGCCATGTCGACGAACTGAACCTGATCGCCATCGAAGGCGGTGACTACCTGCTCGAGGCCCGGGTCAAAGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATgcgcg > 4:145767/1‑149 (MQ=255) aGGCCCGGGCTGGCCATGTCGACGAACTGAACCTGATCGCCATCGAAGGCGGTGACTACCTGCTCGAGGCCCGGGTCAAAGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATgcgcgc < 1:144989/149‑1 (MQ=255) aGGCCAGGGCTGGCCATGTCGACGAACTGAACCTGATCGCCATCGAAGGCGGTGACTACCTGCTCGAGGCCCGGGTCAAAGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATgcgcg > 7:14872/1‑148 (MQ=255) aGGCCAGGGCTGGCCATGTCGACGAACTGAACCAGATCGCCATCGAAGGCGGTGACTACCTGCTCGAGGCCCGGGACAAAGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATgcgcgc < 1:149327/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCATGTCGACGAACTGAACCTGATCGCCATCGAAGGCGGTGACTACCTGCTCGAGGCCCGGGTCAAAGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTtgct < 7:11878/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCATGTCGACGAACTGAACCTGATCGCCATCGAAGGCGGTGACTACCTGCTCGAGGCCCGGGTCAAAGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTtgct < 1:346733/149‑1 (MQ=255) ccATGTCGACGAACTGAACCTGATCGCCATCGAAGGCGGTGACTACCTGCTCGAGGCCCGGGTCAAAGGCCATCCTCACGCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCaaa < 2:277280/149‑1 (MQ=255) ccATGTCGACGAACTGAACCTGATCGCCATCGAAGGCGGTGACTACCTGCTCGAGGCCCGGGTCAAAGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCaaa > 3:140897/1‑149 (MQ=255) cATGTCGACGAACTGAACCTGATCGCCATCGAAGGCGGTGACTACCTGCTCGAGGCCCGGGTCAAAGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAAc > 8:51801/1‑149 (MQ=255) aTGTCGACGAACTGAACCTGATCGCCATCGAAGGCGGTGACTACCTGCTCGAGGCCCGGGTCAAAGGCCAACAACACCCCCTGGCCGAAACCCGTGGTCAACGATTCCGCGTGCCCACGGTGCAGGATGCCCGCAAGTTCATGCAAAc > 5:285213/1‑148 (MQ=255) gTCGACGAACTGAACCTGATCGCCATCGAAGGCGGTGACTACCTGCTCGAGGCCCGGGTCAAAGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCAt > 7:281680/1‑149 (MQ=255) tCGACGAACTGAACCTGATCGCCATCGAAGGCGGTGACTACCTGCTCGAGGCCCGGGTCAAAGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATc > 5:62031/1‑149 (MQ=255) gacgaACTGAACCTGATCGCCATCGAAGGCGGTGACTACCTGCTCGAGGCCCGGGTCAAAGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATccc > 6:133212/1‑149 (MQ=255) cgaACTGAACCTGATCGCCATCGAAGGCGGTGACTACCTGCTCGAGGCCCGGGTCAAAGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCa > 1:318992/1‑149 (MQ=255) taCTGAACCCGCTCGCCATCGAATGCGGTGACTTCCTGCTCGCGGCCCGGGTCAAAGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATg < 6:285213/148‑1 (MQ=255) cTGAACCTGATCGCCATCGAAGGCGGTGACTACCTGCTCGAGGCCCGGGTCAAAGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGt < 4:140897/149‑1 (MQ=255) aaCCTGATCGCCATCGAAGGCGGTGACTACCTGCTCGAGGCCCGGGTCAAAGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGtct < 3:184378/148‑1 (MQ=255) ccTGATCGCCATCGAATGTGGTGACTACCTGCTCGAGGACCGGGTCAAAGGCCATCCTCACCCCCTTTCCGATACCGGTGGTGAACGCTTGCGCGTTCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAATTTGCTTCATACCATcc < 2:318782/137‑1 (MQ=255) 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cAAAGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATgg > 3:355070/1‑149 (MQ=255) aaaGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATggg < 7:11634/149‑1 (MQ=255) gcgcatcctccaccgagtgcacgcgcaagcgttcaccacgggtatcggacagggggtgaggatgCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTAc > 8:307614‑M2/65‑149 (MQ=255) CATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATg < 5:221397‑M1/90‑1 (MQ=255) CATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATg > 6:221397‑M1/1‑90 (MQ=255) CATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCa < 7:328316‑M1/149‑1 (MQ=255) 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cGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCACCCGGAAGAAGACCTGAAGGTGCCGATTTCCCa < 5:367903/149‑1 (MQ=255) ttGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCACCCGGAAGAAGACCTGAAGGTGCCGATTTCCCAGCg > 3:221260/1‑149 (MQ=255) gcgTGCACTCGGTGGAGGAGGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCACCCGGAAGAAGACCTGAAGGTGCCGATTTCCCAGCGTTCg < 4:221260/149‑1 (MQ=255) gTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCACCCGGAAGAAGACCTGAAGGTGCCGATTTCCCAGCGTTCGGc < 7:51801/149‑1 (MQ=255) cACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCACCCGGAAGAAGACCTGAAGGTGCCGATTTCCCAGCGTTCGGCCTg > 4:333832/1‑149 (MQ=255) aCTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCACCCGGAAGAAGACCTGAAGGTGCCGATTTCCCAGCGTTCGGCCt > 8:164691/1‑147 (MQ=255) aCTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCACCCGGAAGAAGACCTGAAGGTGCCGATTTCCCAGCGTTCGGCCt < 7:164691/147‑1 (MQ=255) aCTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCACCCGGAAGAAGACCTGAAGGTGCCGATTTCCCAGCGTTCGGCCTgg < 4:355070/149‑1 (MQ=255) cTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCACCCGGAAGAAGACCTGAAGGTACCGATTTCCCAGCGTTCGGCCTGGt < 5:253211/149‑1 (MQ=255) tCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCACCCGGAAGAAGACCTGAAGGTGCCGATTTCCCAGCGTTCGGCCTgg > 5:167938/1‑147 (MQ=255) ggTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCACCCGGAAGAAGACCTGAAGGTGCCGATTTCCCAGCGTTCGGCCTGGTa < 6:167938/147‑1 (MQ=255) ggTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCACCCGGAAGAAGACCTGAAGGTGCCGATTTCCCAGCGTTCGGCCTGGTAg < 7:52023/148‑1 (MQ=255) gTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCACCCGGAAGAAGACCTGAAGGTGCCGATTTCCCAGCGTTCGGCCTGGTAgct < 8:350305/149‑1 (MQ=255) gaggatgCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCACCCGGAAGAAGACCTGAAGGTGCCGATTTCCCAGCGTTCGGCCTGGTAgctgc < 3:148023‑M2/141‑1 (MQ=255) atgCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCACCCGgaag > 2:3134‑M2/4‑99 (MQ=255) atgCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCACCCGgaag < 1:3134‑M2/96‑1 (MQ=255) | CGAGGCCAGGGCTGGCCATGTCGACGAACTGAACCTGATCGCCATCGAAGGCGGTGACTACCTGCTCGAGGCCCGGGTCAAAGGCCATCCTCACCCCCTGTCCGATACCCGTGGTGAACGCTTGCGCGTGCACTCGGTGGAGGATGCGCGCAAGTTGCTGCAAACCATCCCCATGGTCTCGATGAACCTGGTGCACTGGTCGGTGCAGGACGAAATGTGCGGCATGGGTACGCACCCGGAAGAAGACCTGAAGGTGCCGATTTCCCAGCGTTCGGCCTGGTAGCTGC > NC_002947/797660‑797946 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |