New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 945822 | 50 (0.850) | 4 (0.070) | 3/248 | NT | 6.0% | coding (1547/1557 nt) | norR | DNA‑binding transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 945913 | 78 (1.400) | coding (1456/1557 nt) | norR | DNA‑binding transcriptional regulator |
GAAGCAACCAGATGGCTTTCTGGGTTAATCCTTTGGTAGAAAAGCCTCAGCGAAGCCCTAGCCTGCGGGCCAAACGGCTCAGGTTTGCGCGGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCT‑GGCGTGGTT‑GCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGG > NC_002947/945766‑946061 | gAAGCAACCAGATGGCTTTCTGGGTTAATCCTTTGGTAGAAAAGCCTCAGCGAAGCCCTAGCCTGCGGGCCAAACGGCTCAGGTTTGCGCGGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAg < 7:15842‑M2/149‑2 (MQ=255) aatcAACGAGATGGTTTTCTTGGTTATTCCTTTGTTAGAAAAGCCGCAGCGAAGCCCTAGCCTGCGGGCCAAACGGCTCAGGTTTTCGCGGTCCAGACCTAGTTCCCTGGCCGCTGCTGCCCAGTTTTCCTGATGCCGCTgcaggcag < 7:351408/145‑1 (MQ=255) cAACCAGATGGCTTTCTGGGTTAATCCTTTGGTAGAAAAGCCTCAGCGAAGCCCTAGCCTGCGGGCCAAACGGCTCAGGTTTGCGCGGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAggctt > 5:307354‑M2/1‑144 (MQ=255) aaCCAGATGGCTTTCTGGGTTAATCCTTTGGTAGAAAAGCCTCAGCGAAGCCCTAGCCTGCGGGCCAAACGGCTCAGGTTTGCGCGGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAggcttc < 4:65199‑M2/149‑7 (MQ=255) aaCCAGATGGCTTTCTGGGTTAATCCTTTGGTAGAAAAGCCTCAGCGAAGCCCTAGCCTGCGGGCCAAACGGCTCAGGTTTGCGCGGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAggcttc < 3:111936‑M2/149‑7 (MQ=255) ccAGATGGCTTTCTGGGTTAATCCTTTGGTAGAAAAGCCTCAGCGAAGCCCTAGCCTGCGGGCCAAACGGCTCAGGTTTGCGCGGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGa > 1:130635/1‑149 (MQ=255) tGGCTTTCTGGGTTAATCCTTTGGTAGAAAAGCCTCAGCGAAGCCCTAGCCTGCGGGCCAAACGGCTCAGGTTTGCGCGGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAgg < 6:329504‑M2/138‑3 (MQ=255) tGGCTTTCTGGGTTAATCCTTTGGTAGAAAAGCCTCAGCGAAGCCCTAGCCTGCGGGCCAAACGGCTCAGGTTTGCGCGGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAgg > 5:329504‑M2/1‑136 (MQ=255) 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tGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCT‑GGCGTGGTT‑GCCGACACCCGcaggtccag > 8:192559/1‑149 (MQ=255) gATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAggg < 2:360128/109‑1 (MQ=255) gATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAggg > 1:360128/1‑109 (MQ=255) aTGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCT‑GGCGTGGTT‑GCCGACACACGcaggtccaggt > 8:115579/1‑149 (MQ=255) aTGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCT‑GGCGTGGTT‑GCCGACACACGcaggtccagg < 2:130635/148‑1 (MQ=255) ccGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCT‑GGCGTGGTT‑GCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGa > 7:174489/1‑149 (MQ=255) cGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCT‑GGCGTGGTT‑GCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGAt < 8:240885/149‑1 (MQ=255) gCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCT‑GGCGTGGTTCGCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGAt < 1:4744/149‑1 (MQ=255) cTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCT‑GGCGTGGTT‑GCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATgg < 6:310026/149‑1 (MQ=255) tGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGCTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCT‑GGCGTGGTT‑GCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGc > 3:31549/1‑149 (MQ=255) gcaggcagGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCT‑GGCg < 4:320272/114‑1 (MQ=255) gcaggcagGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCT‑GGCg > 3:320272/1‑114 (MQ=255) ggcaggcTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCT‑GGCGTGGTT‑GCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTc > 7:215872/1‑148 (MQ=255) gcaggcTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCT‑GGCGTGGTT‑GCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTc > 7:124899/1‑147 (MQ=255) caggcTTCGATCACCTGTCGCTGGTTACTTTCGACGGCTTCACGCAAGCCGGCTTCAGGGGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGGATCGTGCCTCGGCGTGGTT‑GCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGa < 1:256648/149‑1 (MQ=255) aggcTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCT‑GGCGTGGTT‑GCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAgg < 2:211367/149‑1 (MQ=255) aggcTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCT‑GGCGTGGTT‑GCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAgg > 1:211367/1‑149 (MQ=255) | GAAGCAACCAGATGGCTTTCTGGGTTAATCCTTTGGTAGAAAAGCCTCAGCGAAGCCCTAGCCTGCGGGCCAAACGGCTCAGGTTTGCGCGGTCCAGACCGAGTTCCCGGGCCGCTGCTGCCCAGTTGTCCTGATGCCGCTGCAGGCAGGCTTCGATCACCTGTCGCTGGTAACTATCGACGGCTTCACGCAAGCCGCCTTCAGGCGGTGTGACCACTTGCAGCGGTGCAGCGGGGGAGGGCAGCGTGCCT‑GGCGTGGTT‑GCCGACACACGCAGGTCCAGGTCGATGGCTTCGAGG > NC_002947/945766‑946061 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |