New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1967141 | 58 (0.980) | 8 (0.140) | 7/254 | NT | 18.6% | intergenic (+11/+108) | PP_1762/yciK | hypothetical protein/putative oxidoreductase |
? | NC_002947 | = 1967243 | 14 (0.250) | intergenic (+113/+6) | PP_1762/yciK | hypothetical protein/putative oxidoreductase |
AAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGCCCGCATCGCCGTGCGC > NC_002947/1967096‑1967390 | aaGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTTCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATg > 6:263097/1‑148 (MQ=255) ggcggcgGGGGTTGGGGGCGGGCTGATCGCTTTCCTGCCCGGGCCTCTTCCCGGGCTGGCCCGCGCCCACCGGTTCCCCCCAACCCCCACGTATTCCGCCCCCCCGGGGGTCGGGGCCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTAt < 6:332499/147‑1 (MQ=255) ggccggcGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTggg < 7:251167/149‑1 (MQ=255) gggCTTATCGCTTGCATGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGTATCCCCTCAACCCTAACGTATTGCGCCCTGCCTGGGGGTGGGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGccc < 8:195708/149‑1 (MQ=25) tcccGGCCTCTTCGCGGGCTGGCCCGCTCCCACAGCACCACCCCAACCCTCACGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTc < 1:332103/147‑1 (MQ=38) tACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCACGGATTGCGCCCTGCCTGGGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTg < 5:128287/147‑1 (MQ=255) tACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTCCCTGTGGTAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTg < 5:134195/147‑1 (MQ=255) GCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATcagg < 2:94517‑M1/149‑1 (MQ=255) GCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATcagg > 5:278661‑M1/1‑149 (MQ=255) ctgtCCCGCTCCCACAGCAACACCGCAACCCTCACGTATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATcaggtacag > 8:160159‑M1/5‑149 (MQ=255) TTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATcaggtacagg < 3:40655‑M1/149‑1 (MQ=255) CCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTACACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATcaggtacaggta < 8:250471‑M1/148‑1 (MQ=255) CCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGCGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAggtacaggtaca < 3:343633‑M1/149‑1 (MQ=255) gctcccacaggcagggcgcaatccttgagggttgcggtgatcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACAcc > 5:166886‑M2/75‑149 (MQ=255) gCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTAcaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgca > 1:99941‑M2/1‑77 (MQ=255) gCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTAcaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatg < 2:99941‑M2/146‑70 (MQ=255) cTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGcaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgcagc < 3:85977‑M2/149‑74 (MQ=255) ccacaggcagggcgcaatccttgagggttgcggtgatcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCa > 8:32421‑M2/71‑149 (MQ=255) ccACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGcaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccgtccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgcagcgct < 5:123973‑M2/149‑77 (MQ=255) ccACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGcaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgccct > 4:44354‑M2/1‑73 (MQ=255) ccACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGcaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgccct < 3:44354‑M2/130‑58 (MQ=255) CCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCa < 2:42734‑M1/149‑1 (MQ=255) cacaggcagggcgcaatccttgagggttgcggtgatcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccgGTGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGTCAt > 5:285703‑M2/70‑149 (MQ=255) CACCGGATCACCCCATCCCTCACGGATGGCGCCCTGCCTGGGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCAt > 6:73958‑M1/1‑149 (MQ=255) aggcagggcgcaatccttgagggttgcggtgatcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGAt < 1:94517‑M2/83‑1 (MQ=255) GATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGAtct < 4:324833‑M1/149‑1 (MQ=255) GATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCACGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTCGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGATGACCTGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGAtc < 5:40273‑M1/148‑1 (MQ=255) aCCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTc < 5:263097/149‑1 (MQ=255) gcgcaatccttgagggttgcggtgatcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCg < 6:166886‑M2/90‑1 (MQ=255) cGCATCACTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCTCCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCTGGTACAGGTACACCGGCATGATGTCtt < 6:40273/146‑1 (MQ=255) cGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCgg > 3:195907/1‑149 (MQ=255) ccTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCg > 5:293337/1‑149 (MQ=255) cAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGgt > 2:263534/1‑149 (MQ=255) ctttGCGCCCTGCCTGGGGGTGGGGGCAAGCGCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGgttttt < 1:113263/147‑1 (MQ=255) aTTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGcaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccgtccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgcagcgctccaggaacaggaacatgcagtcgtaa > 6:123973‑M2/1‑47 (MQ=255) gcCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCgg > 3:169686/1‑149 (MQ=255) gcCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCgg > 4:274613/1‑149 (MQ=255) gcCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCgg < 4:195907/149‑1 (MQ=255) ggagcgggcaagcccgcgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCgg < 4:169686‑M2/121‑1 (MQ=255) gagcgggcaagcccgcgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCgggg > 4:184549‑M2/27‑149 (MQ=255) cgggcaagcccgcgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTa < 4:40655‑M2/125‑1 (MQ=255) gggcacgcccgcgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAgg > 5:257687‑M2/23‑149 (MQ=255) gcaagcccgcgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGcc > 7:134463‑M2/21‑149 (MQ=255) gcccgcgaagaggccgGTGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTggg < 6:285703‑M2/133‑1 (MQ=255) cccgcgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGc > 1:297‑M2/16‑149 (MQ=255) cccGCGAAGAGGCCGATGcaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgcagcgctccaggaacaggaacatgcagtcgtaactcttgcagatcgccctgcgcaactcggt > 4:85977‑M2/1‑18 (MQ=255) ccgcgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGcc > 5:112607‑M2/15‑149 (MQ=255) cgcgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGccc > 6:253036‑M2/14‑149 (MQ=255) cgcgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGccc < 4:343633‑M2/136‑1 (MQ=255) cgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGCCCg > 8:189304‑M2/12‑148 (MQ=255) cgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTCCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGCCCGc < 7:250471‑M2/138‑1 (MQ=255) agaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACACGTACACCGGCATGATCTCTTAGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGCCCGCATc > 5:99166‑M2/9‑149 (MQ=255) gccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGCCCGCATCGCCg > 2:139433‑M2/5‑149 (MQ=255) tGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACAGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGCCCGCATCGCCGTgcgc > 1:246345/1‑149 (MQ=255) gCAGGGTAAGTGCGCGCTGCACGCCTGCCCGGTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGCCCGCATCGCCGTgcgc < 6:257687/148‑1 (MQ=255) | AAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGCCCGCATCGCCGTGCGC > NC_002947/1967096‑1967390 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |