New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3016246 | 34 (0.580) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 8.6% | coding (169/2283 nt) | bcsB | cellulose synthase and translocator subunit |
? | NC_002947 | = 3016268 | 31 (0.550) | coding (191/2283 nt) | bcsB | cellulose synthase and translocator subunit |
TTTACCGCCTTGTCGCAGAGCGCCGCTGCTGCTTCCGTAGCTCCGCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGATGCCAGCTTGCAACTGGACTACACGCCTTCGCCAGCCTTGCTGCCGAACCTGTCGCACTTGCGCGTCTACCTCAACGACGAGCTGATGGGCGTA > NC_002947/3016123‑3016416 | tttACCGCCTTGTCGCAGAGCGCCGCTGCTGCTTCCGTAGCTCCGCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTac > 8:243970‑M2/1‑146 (MQ=255) cAGAGCGCCGCTGCTGCTTCCGTAGCTCCGCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCaa < 4:320881/137‑1 (MQ=255) cAGAGCGCCGCTGCTGCTTCCGTAGCTCCGCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCaa > 3:320881/1‑137 (MQ=255) agagCGCCGCTGCTGCTTCCGTAGCTCCGCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAg < 6:125402/143‑1 (MQ=255) agagCGCCGCTGCTGCTTCCGTAGCTCCGCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAg > 5:125402/1‑143 (MQ=255) cgccgcTGCTGCTTCCGTAGCTCCGCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGt > 7:333837/1‑149 (MQ=255) cgcTGCTGCTTCCGTAGCTCCGCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTg < 4:225635/149‑1 (MQ=255) gctgctgctTCCGTAGCTCCGCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTgg < 3:113402/149‑1 (MQ=255) ttCCGTAGCTCCGCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTc > 1:330682/1‑149 (MQ=255) ccGTAGCTCCGCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTcgc > 1:202005/1‑149 (MQ=255) gTAGCTCCGCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAACCTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGa > 5:158748/1‑149 (MQ=255) gTAGCTCCGCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGa < 8:52012/149‑1 (MQ=255) tAGCTCCGCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAATCTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGAt > 1:258667/1‑149 (MQ=255) tCCGCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGcc > 5:267849/1‑149 (MQ=255) cGCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTg < 2:258667/149‑1 (MQ=255) gCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGc < 3:196885/130‑1 (MQ=255) gCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGc > 4:196885/1‑130 (MQ=255) gAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGa > 3:56022/1‑149 (MQ=255) cGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGATGCCaac < 7:293704/149‑3 (MQ=255) ccacacccacGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGATGCCAGCTTGCaa > 7:48345/1‑149 (MQ=255) acacccacGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGATGCCAGCTTGCAACt > 3:52901/1‑149 (MQ=255) cccacGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGATGCCAGCTTGCAACTgg > 2:275596/1‑148 (MQ=255) ccacGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAACACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGATGCCAGCTTGCAACTGGAc < 8:333837/149‑1 (MQ=255) acGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGATGc > 2:48493/1‑131 (MQ=255) acGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGATGc < 1:48493/131‑1 (MQ=255) cAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGATGCCAGCTTGCAACTGGACTACACGCCt > 3:122313/1‑149 (MQ=255) cGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGATGCCAGCTTGCAACTGGACTACACGCCTTCGCCAGCCTtgct < 8:22023/148‑1 (MQ=255) aaCCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGATGCCAGCTTGCAACTGGACTACACGCCTTCGCCAGCCTTGCTGCCg > 7:20778/1‑148 (MQ=255) aCCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGATGCCAGCTTGCAACTGGACTACACGCCTTCGCCAGCCTTGCTGCCGaa < 2:202005/149‑1 (MQ=255) agcagcTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGATGCCAGCTTGCAACTGGACTACACGCCTTCGCCAGCCTTGCTGCCGAACCTGTCg > 2:307657/1‑149 (MQ=255) gggCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGATGCCAGCTTGCAACTGGACTACACGCCTTCGCCAGCCTTGCTGCCGAACCTGTCGCACTTgcg > 6:89286/1‑149 (MQ=255) ggCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTacgcatgcccaagctgctcgaaggttttcgcaacctgccagtttggtaccgtgggtgtgggtaccgcaggctcggcaagcggagctacggaagcagcagcggcgctctgcgacaaggc < 5:285455‑M2/149‑119 (MQ=255) gCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTacgcatgcccaagctgctcgaaggttttcgcaacctgccagtttggtaccgtgggtgtgggtaccgcaggctcggcaagcggagctacggaagcagcagcggcgctctgc < 7:307779‑M2/140‑111 (MQ=255) gCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTacgcatgcccaagctgctcgaaggttttcgcaacctgccagtttggtaccgtgggtgtgggtaccgcaggctcggcaagcggagctacggaagcagcagcggcgctctgc > 8:307779‑M2/1‑30 (MQ=255) aagctggtgGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGATGCCAGCTTGCAACTGGACTACACGCCTTCGCCAGCCTTGCTGCCGAACCTGTCGCACTTGCGAGTCTACCTCAAcgacga < 1:361553/147‑1 (MQ=255) ctgGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGATGCCAGCTTGCAACTGGACTACACGCCTTCGCCATCCTTGCTGCCGAACCTGTCGCACTTGCGCGTCTACCTCAACGACGAGCTGa < 1:275596/148‑1 (MQ=255) ctgGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGATGCCAGCTTGCAACTGGACTACACGCCTTCGCCAGCCTTGCTGCCGAACCTGTCGCACTTGCGCGTCTACCTCAACGACGAGCTGAt > 1:148570/1‑149 (MQ=255) tacgcatgcccaagctgctcgaaggttttcgcaacctgccagtttggtaccgtgggtgtgggtaccgcaggctcggcaagcggagctacggaagcagcagcggcgctctgcgacaaggcggtaaacagcgccatcgccaggccccaggt > 6:285455‑M2/1‑1 (MQ=255) | TTTACCGCCTTGTCGCAGAGCGCCGCTGCTGCTTCCGTAGCTCCGCTTGCCGAGCCTGCGGTACCCACACCCACGGTACCAAACTGGCAGGTTGCGAAAACCTTCGAGCAGCTTGGGCATGCGTCCGACAGCCTGCTGCTGGGGGTACGCAACAGTGAGCATATCGAGTTTGGCCTGCGTCGCGATCGCCTGGCCACCGATGCCAGCTTGCAACTGGACTACACGCCTTCGCCAGCCTTGCTGCCGAACCTGTCGCACTTGCGCGTCTACCTCAACGACGAGCTGATGGGCGTA > NC_002947/3016123‑3016416 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |