New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3693099 = | 51 (0.870) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 8.0% | coding (527/1044 nt) | PP_3259 | acyl‑CoA dehydrogenase‑related protein |
? | NC_002947 | 3693147 = | 43 (0.750) | coding (479/1044 nt) | PP_3259 | acyl‑CoA dehydrogenase‑related protein |
CGCCTTGCCAGAAGCCAGGGCGCGAGAGGTATTGGCCTGGCGTGCCGATGAGCGTGCCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCG > NC_002947/3693001‑3693295 | aaggcctggtgttccggtgccttgcagatcgatcgcgcgctgattactgcctgggatgaggccgagcagccgcaattggtggcaatcgagctgtcacaGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCtgt > 1:16242‑M1/99‑149 (MQ=255) ccTTGCCAGAAGCCAGGGCGCGAGAGGTATTGGCCTGGCGTGCCGATGAGCGTGCCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGa < 6:93796/149‑1 (MQ=255) gCCAGAAGCCAGGGCGCGAGAGGTATTGGCCTAGCGTGCCGATGAGCGTGCCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACa < 3:270510/147‑1 (MQ=255) cAGAAGCCAGGGCGCGAGAGGTATTGGCCTGGCGTGCCGATGAGCGTGCCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTc > 5:37762/1‑149 (MQ=255) aGCCAGGGCGCGAGAGGTATTGGCCTGGCGTGCCGATGAGCGTGCCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGAtt < 1:367683/149‑1 (MQ=255) aGCCAGGGCGCGAGAGGTATTGGCCTGGCGTGCCGATGAGCGTGCCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGAtt < 1:354433/149‑1 (MQ=255) ccAGGGCGCGAGAGGTATTGGCCTGGCGTGCCGATGAGCGTGCCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTga > 4:207306/1‑148 (MQ=255) cAGGGCGCGAGAGGTATTGGCCTGGCGTGCCGATGAGCGTGCCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGc > 3:67711/1‑148 (MQ=255) aGGGCGCGAGAGGTATTGGCCTGGCGTGCCGATGAGCGTGCCTGGGGTATCCTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGcca > 7:145552/1‑149 (MQ=255) ggCGCGAGAGGTATTGGCCTGGCGTGCCGATGAGCGTGCCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGccac < 8:145552/148‑1 (MQ=255) cttgcagatcgatcgcgcgctgattactgcctgggatgaggccgagcagccgcaattggtggcaatcgagctgtcacaGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCtg < 2:300550‑M1/50‑1 (MQ=255) cttgcagatcgatcgcgcgctgattactgcctgggatgaggccgagcagccgcaattggtggcaatcgagctgtcacaGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCtg > 1:300550‑M1/79‑128 (MQ=255) gcgAGAGGTATTGGCCTGGCGTGCCGATGAGCGTGCCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAAt < 7:299690/149‑1 (MQ=255) gagaGGTATTGGCCTGGCGTGCCGATGAGCGTGCCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTg > 7:268924/1‑149 (MQ=255) gTATTGGCCTGGCGTGCCGATGAGCGTGCCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGc > 4:35326/1‑145 (MQ=255) gTATTGGCCTGGCGTGCCGATGAGCGTGCCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGc < 3:35326/145‑1 (MQ=255) cGATGAGCGTGCCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATc < 6:47490/145‑1 (MQ=255) cGATGAGCGTGCCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATc > 5:47490/1‑145 (MQ=255) cGATGAGCGTGCCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAg < 8:268924/149‑1 (MQ=255) aGCGTGCCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGt < 6:36077/149‑1 (MQ=255) ccTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCa < 3:101102/148‑1 (MQ=255) tCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGcgatc < 4:67711/149‑1 (MQ=255) gTTGAACGCAACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGcgatcga > 5:53832/1‑149 (MQ=255) aaCGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCt < 6:37762/148‑1 (MQ=255) cACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAgg > 3:59796/1‑149 (MQ=255) tCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCAcc > 2:342957/1‑149 (MQ=255) tCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCAGCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCAcc > 8:49096/1‑149 (MQ=255) tGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAacac > 8:238015/1‑149 (MQ=255) tGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAacac > 7:331613/1‑149 (MQ=255) gTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACAcc < 7:265304/142‑1 (MQ=255) gTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACAcc > 8:265304/1‑142 (MQ=255) acagccaagccagggcctgaacattgagcactggcaggccgttggcatggcTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCtt > 1:16242‑M2/52‑149 (MQ=255) cagccaagccagggcctgaacattgagcactggcaggccgttggcatggcTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAg < 2:300550‑M2/78‑1 (MQ=255) cagccaagccagggcctgaacattgagcactggcaggccgttggcatggcTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAg > 1:300550‑M2/51‑128 (MQ=255) gccaagccagggcctgaacattgagcactggcaggccgttggcatggcTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGt < 2:16242‑M2/101‑1 (MQ=255) CCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTg < 5:102609‑M1/149‑1 (MQ=255) CCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTg < 1:108940‑M1/149‑1 (MQ=255) cAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGtt > 6:197280/1‑148 (MQ=255) aaCGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTga < 3:30538/149‑1 (MQ=255) gggCCTGCCAGTGCTAATTGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTTACTGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCGTCATCCCTGGCAGTAATCAGCGCCCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTgaga < 1:86376/148‑1 (MQ=255) ccAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCAc < 4:59796/147‑1 (MQ=255) caaGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTTACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCTATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTACCGTTGAGACGCAc < 1:215997/145‑1 (MQ=255) cAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTg > 8:99269/1‑149 (MQ=255) tCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAac > 4:184413/1‑112 (MQ=255) tCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAac < 3:184413/112‑1 (MQ=255) tCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGcc > 5:251870/1‑149 (MQ=255) cAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTg > 6:70506/1‑131 (MQ=255) cAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTg < 5:70506/131‑1 (MQ=255) aTGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTg > 3:289295/1‑120 (MQ=255) aTGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTg < 4:289295/120‑1 (MQ=255) aGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCgcgcgc > 5:99803/1‑149 (MQ=255) aGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCgcgcgc > 5:196682/1‑149 (MQ=255) cTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGa < 5:197280/149‑1 (MQ=255) gcTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGAc < 1:342957‑M2/146‑1 (MQ=255) cTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGAccc < 2:108940‑M2/148‑1 (MQ=255) tgtgACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCcg > 5:306802/1‑149 (MQ=255) tgtgACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCcg > 4:8170/1‑149 (MQ=255) | CGCCTTGCCAGAAGCCAGGGCGCGAGAGGTATTGGCCTGGCGTGCCGATGAGCGTGCCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCG > NC_002947/3693001‑3693295 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |