New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5907249 | 68 (1.150) | 5 (0.090) | 4/244 | NT | 7.0% | coding (718/1095 nt) | spuE | spermidine/putrescine ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | = 5907291 | 70 (1.280) | coding (676/1095 nt) | spuE | spermidine/putrescine ABC transporter substrate‑binding protein |
GCCAGCACGTCGAACCAGAGGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCGCTGGCAGCATTTCGTCCGCC > NC_002947/5907143‑5907436 | ccaagaaCGTCGAACCAGAGGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGTTGTCGCCATTGGCCAGGTc < 3:336031/143‑1 (MQ=255) gCACGTCGAACCAGAGGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCggtg > 4:350779‑M2/1‑145 (MQ=255) aaCCAGAGGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACtt > 3:126307/1‑149 (MQ=255) aCCAGAGGTTGCCGCCTACCTTGGGAAGGGCGTAGGCCAGGTTCACACCC‑TCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTgg < 7:99972/149‑1 (MQ=255) cAGAGGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGa > 8:10723/1‑149 (MQ=255) cAGAGGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGa > 2:205673/1‑149 (MQ=255) cAGAGGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGa < 2:217871/149‑1 (MQ=255) agagGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACt < 2:99246/144‑1 (MQ=255) agagGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACt > 1:99246/1‑144 (MQ=255) agagGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGAc < 1:205673/149‑1 (MQ=255) agagGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGAc > 2:187943/1‑149 (MQ=255) agagGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGAc < 1:335367/149‑1 (MQ=255) agagGTTGCCGACTTCCTTGGGAATGGAGTAGGCCAGGTTCACAACCTTCTTCTC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCAACCGAGAAAACTGCCGCGAAGCAGAGGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGAGGTACTGGGAc > 2:187940/1‑149 (MQ=255) gagGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGAc > 1:229573/1‑148 (MQ=255) gTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCggtgatgta > 1:100345‑M2/1‑129 (MQ=255) gTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCggtgatgta < 2:100345‑M2/138‑10 (MQ=255) gTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGt < 8:157044/149‑1 (MQ=255) gccgccTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTgg < 1:107209/148‑1 (MQ=255) gccgccTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTgg < 2:241538/148‑1 (MQ=255) ccgccTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGaa < 7:10723/149‑1 (MQ=255) cgttccttGGGAATGGGGATGGCAAGGTTAACACCCTCTTTCTCATTTTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGt < 1:308381/147‑1 (MQ=37) cttccttGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAg < 8:275330/149‑1 (MQ=255) ccttGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAgg < 1:208389/147‑1 (MQ=255) gAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTAc > 3:123941/1‑149 (MQ=255) aaTGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACg > 1:289668/1‑149 (MQ=255) aTGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACgg < 4:126307/149‑1 (MQ=255) tGGCGTAGGCCAGGTTCACACCATTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCGGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACggg < 1:203937/149‑1 (MQ=255) cGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGgcg > 8:37897/1‑148 (MQ=255) gCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGAGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGACGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACATGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGAGCGCAC‑gg > 5:70320/1‑148 (MQ=255) ccAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGc > 2:59932/1‑148 (MQ=255) gTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCcagca < 1:347244/149‑1 (MQ=255) tCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAg < 6:275499/119‑1 (MQ=255) tCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAg > 5:275499/1‑119 (MQ=255) acCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCt > 1:211886/1‑149 (MQ=255) ccTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTgg < 7:224294/110‑1 (MQ=255) ccTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTgg > 8:224294/1‑110 (MQ=255) catcGC‑TTCATCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGACACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCg < 8:257981/146‑1 (MQ=255) ttcGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGc > 5:65733/1‑149 (MQ=255) gC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCtt > 8:139044/1‑149 (MQ=255) gC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCtt > 6:239671/1‑149 (MQ=255) cttcAGCGCGGGGCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCTGATTTCGCGATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGGCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGc < 7:157538/148‑1 (MQ=255) cttcAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGc < 2:289668/148‑1 (MQ=255) cAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCg < 5:88562/146‑1 (MQ=255) gggCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTg < 4:123941/149‑1 (MQ=255) gggCATTGGCCTGGAATACATCACCCGAGATAGCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTg < 3:64598/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTg < 1:59932/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTgg < 2:229573/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTgg < 5:239671/149‑1 (MQ=255) cTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGt > 6:249639/1‑149 (MQ=255) ttGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGATTCTGCTCGGCCTTGGGGTAATCCTTGGGGTc > 8:252315/1‑149 (MQ=255) ccTGGAATACATCACACGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTg < 2:232280/149‑1 (MQ=255) cTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCggtgatgtattccaggccaaggcccgcgctgaagaagcgaagaagggtgtgaacctggcctacgccattcccaaggaaggcggcaacctctg < 7:97394‑M2/149‑93 (MQ=255) cTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCggtgatgtattccaggccaaggcccgcgctgaagaagcgaagaagggtgtgaacctggcctacgccattcccaaggaaggcggcaacctctg < 2:141756‑M2/149‑93 (MQ=255) gAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCggtgatgtattccaggccaaggcccgcgctgaagaagcgaagaagggtgtgaacctggcctacgccattcccaaggaaggcggc < 4:208707‑M2/138‑85 (MQ=255) gAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCggtgatgtattccaggccaaggcccgcgctgaagaagcgaagaagggtgtgaacctggcctacgccattcccaaggaaggcggc > 3:208707‑M2/1‑54 (MQ=255) cATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCggg < 4:367658/149‑1 (MQ=255) cATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCgg < 5:182745/148‑1 (MQ=255) cATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCgg < 6:65733/148‑1 (MQ=255) aCCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTACGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCACGGCCATGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGtt > 2:90112/1‑147 (MQ=255) cccGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAg < 7:139044/149‑1 (MQ=255) ccGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAgg < 7:37897/149‑1 (MQ=255) ccGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAgg > 6:205001/1‑149 (MQ=255) gagaAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTATTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGcc < 6:28487/90‑1 (MQ=255) gagaAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTATTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGcc > 5:28487/1‑90 (MQ=255) gagaAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGcc < 2:211886/149‑1 (MQ=255) ccTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTc < 2:148494/66‑1 (MQ=255) ccTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTc > 1:148494/1‑66 (MQ=255) cTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAg > 2:197088/1‑149 (MQ=255) tGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTg < 4:343655/115‑1 (MQ=255) tGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTg > 3:343655/1‑115 (MQ=255) ccGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCggtgatgtattccaggccaaggcccgcgctgaagaagcgaagaagggtgtgaacctggcctacgccattcccaaggaaggcggcaacctctggttcgacgtgctggcgatccccaa > 1:141756‑M2/1‑31 (MQ=255) cGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCAcc < 1:197088/149‑1 (MQ=255) gCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCg > 3:346341/1‑149 (MQ=255) aTGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTg < 7:257949/138‑1 (MQ=255) aTGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTg > 8:257949/1‑138 (MQ=255) gCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGtt > 1:12422/1‑132 (MQ=255) gCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGtt < 2:12422/132‑1 (MQ=255) ccATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGCTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCGCTGGCAGCAt > 5:7591/1‑149 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCGc < 8:240235/134‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCGCTGGCAGCATTTCGTc > 4:179990/1‑149 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCGCTGGCAGCATTTCGTc < 4:346341/149‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGACGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCGCTGGCAGCATTTCGTc > 7:304310/1‑149 (MQ=255) cccAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTACTCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCGc > 7:240235/2‑134 (MQ=255) gTCGGTGACGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCGCTGGCAGCATTTCGTccgcc < 8:304310/148‑1 (MQ=255) tCGGTGATGTACTGGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGGAGTTCAGCACCGCTGGCAGCATTTCGTccgcc > 8:313444/1‑147 (MQ=255) cGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCgg < 7:268834/100‑1 (MQ=255) cGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCgg > 8:268834/1‑100 (MQ=255) | GCCAGCACGTCGAACCAGAGGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGC‑TTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCAC‑GGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCGCTGGCAGCATTTCGTCCGCC > NC_002947/5907143‑5907436 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |