| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,733,446 | T→C | 100% | Y730C (TAT→TGT) | sucA ← | 2‑oxoglutarate dehydrogenase subunit E1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,733,446 | 0 | T | C | 100.0% | 258.4 / NA | 73 | Y730C (TAT→TGT) | sucA | 2‑oxoglutarate dehydrogenase subunit E1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (40/33); total (40/33) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
GCGCAGCGGGCGAATGACCTGGCGACGCAGCAGGTGGTAAATCTGTGCCGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCATAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAACTGGGCTTCCCAGATCACCAGCGCGTTCGGCATG > NC_002947/4733301‑4733589 | gcgcAGCGGGCGAATGACCTGGCGACGCAGCAGGTGGTAAATCTGTGCCGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAg < 6:96776/148‑1 (MQ=255) cGGGCGAATGACCTGGCGACGCAGCAGGTGGTAAATCTGTGCCGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGtgtg < 5:293343/149‑1 (MQ=255) gggCGAATGACCTGGCGACGCAGCAGGTGGTAAATCTGTGCCGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTgg < 2:370370/149‑1 (MQ=255) gCGAATGACCTGGCGACGCAGCAGGTGGTAAATCTGTGCCGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGgca < 1:43881/149‑1 (MQ=255) gAATGACCTGGCGACGCAGCAGGTGGTAAATCTGTGCCGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCATTCACAGCCGTGTGccag > 1:269553/1‑148 (MQ=255) aaTGACCTGGCGACGCAGCAGGTGGTAAATCTGTGCCGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGgcagca < 6:363633/149‑1 (MQ=255) cTGGCGACTCAGCAGGTGGTAAATCTGTGCCGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATgg > 8:258793/1‑149 (MQ=255) gACGCAGCAGGTGGTAAATCTGTGCCGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑a < 6:143773/149‑1 (MQ=255) ggtAAATCTGTGCCGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAggcgg > 8:98453/1‑149 (MQ=255) gtAAATCTGTGCCGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAggcggc > 6:157041/1‑149 (MQ=255) gtAAATCTGTGCCGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAggcggc > 5:155128/1‑149 (MQ=255) gtAAATCTGTGCCGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAggcggc < 7:333923/149‑1 (MQ=255) gtAAATCTGTGCCGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAggcggc > 1:249839/1‑149 (MQ=255) aaaTCTGTGCCGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGccc > 2:335844/1‑149 (MQ=255) aaTCTGTGCCGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGGAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGcccc > 5:312727/1‑149 (MQ=255) tgCCGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCAc < 7:236347/145‑1 (MQ=255) ccGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTtgtg < 7:98453/148‑1 (MQ=255) ccGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGc > 2:169149/1‑149 (MQ=255) cGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTtgtg > 1:185099/1‑147 (MQ=255) cGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTtgtg < 2:185099/147‑1 (MQ=255) cGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCt > 2:299125/1‑149 (MQ=255) gCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTca > 2:114553/1‑149 (MQ=255) cgtcgtCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTcac < 6:155128/149‑1 (MQ=255) ggTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCAc > 1:264439/1‑132 (MQ=255) ggTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCAc < 2:264439/132‑1 (MQ=255) gTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGTCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑CCCGCCCAGGCGGCCCCACTTCTGCTCACCACTgggg > 8:98079/1‑147 (MQ=255) gTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCAGTGGt > 1:54465/1‑148 (MQ=255) tACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGtga < 1:283436/149‑1 (MQ=255) tACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGtga < 5:157041/149‑1 (MQ=255) cGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGtgat < 8:128323/148‑1 (MQ=255) gCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGtgatg > 7:121748/1‑148 (MQ=255) cAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCTTTCACAGCCGTGTGCCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGaa < 2:269553/149‑1 (MQ=255) cAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCAGTGGtgagcac < 2:54465/149‑5 (MQ=255) aGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAAc > 5:330480/1‑149 (MQ=255) aGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAAc > 5:84924/1‑149 (MQ=255) cTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGt > 1:26197/1‑149 (MQ=255) cTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGt < 1:335844/149‑1 (MQ=255) aTGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGAt < 7:258793/149‑1 (MQ=255) tgttgtGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑CCCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGAt > 8:4296/1‑148 (MQ=255) tgttgtGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGtg > 6:47417/1‑134 (MQ=255) tgttgtGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGtg < 5:47417/134‑1 (MQ=255) gttgtGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATca > 5:369660/1‑149 (MQ=255) ttgtGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATcac < 2:26197/149‑1 (MQ=255) acaGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCg > 6:30588/1‑149 (MQ=255) cTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTgg > 4:167466/1‑149 (MQ=255) cTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTgg < 6:330480/149‑1 (MQ=255) gCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTAACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGc > 6:65645/1‑148 (MQ=255) cAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGTAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAGCTTTCCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTg < 1:299125/148‑1 (MQ=255) ggTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAg < 8:121748/149‑1 (MQ=255) aaCGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCg > 8:113089/1‑149 (MQ=255) gCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGcc > 7:13981/1‑148 (MQ=255) ccAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAAc > 4:315196/1‑149 (MQ=255) cAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAACt < 7:113089/149‑1 (MQ=255) cgcgGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAACTGGGCtt < 8:13981/149‑1 (MQ=255) cgGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAACTGGGCTTcc < 6:369660/149‑1 (MQ=255) gagTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAACTGGGCTTcc > 5:242553/1‑144 (MQ=255) gagTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAACTGGGCTTCCCAGAt < 6:84063/149‑1 (MQ=255) cTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTc < 6:185016/72‑1 (MQ=255) cTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTc > 5:185016/1‑72 (MQ=255) cTCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAACTGGGCTTCCCAGATCAc > 1:40271/1‑147 (MQ=255) tCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAACTGGGCTTCCCAGATCACCAg > 8:323950/1‑149 (MQ=255) tCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAACTGGGCTTCCCAGATCACCAg > 3:297005/1‑149 (MQ=255) tCCGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGAACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGATGATGAACTGGTCGAACACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAACTGGGCTTCCCAGATCACCAg > 7:56151/1‑149 (MQ=255) cGGCCCCTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAACTGGGCTTCCCAGATCACCAgcg > 7:135266/1‑149 (MQ=255) cccTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAACTGGGCTTCCCAGATCACCAGCGCGtt > 8:323888/1‑149 (MQ=255) cTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCTCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACAGTTGGCGAAGTCGCAGCACTGGGCTTCCGAGATCACCCGCGCGGTCg > 8:294347/1‑149 (MQ=255) cTGCCCTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAACTGGGCTTCCCAGATCACCAGCGCGTTCg < 2:249839/149‑1 (MQ=255) cccTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGc < 1:140270/105‑1 (MQ=255) cccTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGc > 2:140270/1‑105 (MQ=255) cTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACTACTGGTGATGAACTGGTCTATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAACTGGGCTTCCCAGATCACCAGCGCGTTCGGCAtg < 1:114553/149‑1 (MQ=255) cTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAACTggg < 8:352386/120‑1 (MQ=255) cTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAACTggg > 7:352386/1‑120 (MQ=255) cTTCACAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAACTGGGCTTCCCAGATCACCAGCGCGTTCGGCAtg > 3:107781/1‑149 (MQ=255) | GCGCAGCGGGCGAATGACCTGGCGACGCAGCAGGTGGTAAATCTGTGCCGGCGTCGTCGGTACGCAGACCTGGATGTTGTGCTCGGCGCACAGCTGCAGGTAACGCTCCAGACGCGCGGAGGAGTGCTCCGGCCCCTGCCCTTCATAGCCGTGTGGCAGCAGCATGGTCAG‑‑‑ACCGCACAGGCGGCCCCACTTGTGCTCACCACTGGTGATGAACTGGTCGATCACCACTTGCGCACCGTTGGCGAAGTCGCCGAACTGGGCTTCCCAGATCACCAGCGCGTTCGGCATG > NC_002947/4733301‑4733589 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |