| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,175,329 | C→G | 5.1% | Y44* (TAC→TAG) ‡ | PP_4551 → | alpha/beta family hydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,175,329 | 0 | C | G | 5.1% | 258.7 / 3.6 | 78 | Y44* (TAC→TAG) ‡ | PP_4551 | alpha/beta family hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/38); new base G (2/2); total (38/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.21e-01 | |||||||||||
ACAAGGACCCGCCATGCCTCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGG > NC_002947/5175185‑5175472 | acaAGGACCCGCCATGCCTCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAgc > 5:222294/1‑149 (MQ=255)acaAGGACCCGCCATGCCTCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAgc > 5:70298/1‑149 (MQ=255)acaAGGACCCGCCATGCCTCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAgc > 4:291389/1‑149 (MQ=255) aaGGACCCGCCATGCCTCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAgcgc < 6:224581/149‑1 (MQ=255) aaGGACCCGCCATGCCTCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAgcgc > 2:368745/1‑149 (MQ=255) gACCCGCCATGCCTCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑AGGCGCTGGTAGCGcccg > 7:52126/1‑147 (MQ=255) aCCCGCCATGCCTCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑AGGCGCTGGTAGCGCCCgg < 8:52126/149‑1 (MQ=255) ccGCCATGCCTCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGc > 1:240977/1‑149 (MQ=255) ccATGCCTCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAg > 3:28867/1‑149 (MQ=255) cATGCCTCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAgg < 6:136226/149‑1 (MQ=255) cATGCCTCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAgg < 6:70298/149‑1 (MQ=255) cATGCCTCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTAGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAgg < 8:295487/149‑1 (MQ=255) aTGCCTCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCAGACCGGGAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGc < 8:137858/149‑1 (MQ=255) ccTCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGTGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGctc < 2:304933/148‑1 (MQ=255) ccTCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGctc < 3:291389/148‑1 (MQ=255) tCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGctct > 5:113920/1‑147 (MQ=255) tCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGa > 4:353631/1‑149 (MQ=255) cgacgCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGc > 6:277969/1‑148 (MQ=255) gacgCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAg > 8:4420/1‑138 (MQ=255) gacgCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAg < 7:4420/138‑1 (MQ=255) gCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAggc < 2:168136‑M2/149‑4 (MQ=255) gCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTg > 6:178495/1‑149 (MQ=255) cGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTCCCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGt > 6:131974/1‑149 (MQ=255) cGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGt > 7:254965/1‑149 (MQ=255) gCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGtt > 2:60216/1‑149 (MQ=255) gCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGtt < 3:353631/149‑1 (MQ=255) gCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGATGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGtt < 7:311897/149‑1 (MQ=255) aGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGt > 6:215927/1‑145 (MQ=255) aGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGt < 5:215927/145‑1 (MQ=255) aGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCACCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGcc > 2:47774/1‑149 (MQ=255) gCAGCCTGTACGTACACCAATGACTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAg > 7:232655/1‑149 (MQ=255) ccTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCT‑GGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGt < 4:130786/130‑1 (MQ=255) ccTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCT‑GGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGt > 3:130786/1‑130 (MQ=255) tacgtacACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGc < 5:235257/147‑1 (MQ=255) gtacACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACgg < 2:240977/149‑1 (MQ=255) gtacACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACgg < 1:47774/149‑1 (MQ=255) acCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGgcg > 7:2242/1‑148 (MQ=255) ccAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCa > 1:275894/1‑149 (MQ=255) cAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCCCGGGCGCAc > 1:363291/1‑149 (MQ=255) cAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCAc > 8:253341/1‑149 (MQ=255) aTGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTg > 2:116398/1‑149 (MQ=255) ggCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑AGGCGCTGGTAGCGCCCggcat < 7:152479/84‑4 (MQ=37) ggCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑AGGCGCTGGTAGCGCCCggcat > 8:152479/1‑81 (MQ=37) gCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCCTGGGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTAGGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCCCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCCCTGc > 1:290488/1‑149 (MQ=255) gCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGcc > 8:54710/1‑148 (MQ=255) gCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAAc > 3:106716/1‑149 (MQ=255) ccGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGaa < 1:116398/147‑1 (MQ=255) cacaCCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGc > 8:292272/1‑148 (MQ=255) ggTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCg < 8:254965/149‑1 (MQ=255) ggCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGt < 5:178495/149‑1 (MQ=255) ggCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGt < 6:222294/149‑1 (MQ=255) gCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGtt > 3:62206/1‑149 (MQ=255) ccGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTc < 4:296076/149‑1 (MQ=255) ggtgCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTcgccc > 7:184349/1‑149 (MQ=255) gtgCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTcgccc < 2:290488/148‑1 (MQ=255) gctgctGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTcgcccgc > 8:254568/1‑148 (MQ=255) ggCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCTCCATCATg < 4:62206/149‑1 (MQ=255) cccATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGc < 8:184349/149‑1 (MQ=255) ccATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCt < 5:195790/149‑1 (MQ=255) ccATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCt > 6:98220/1‑149 (MQ=255) ggcatggcCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGa < 3:267785/148‑1 (MQ=255) ggcatggcCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGa > 4:267785/1‑148 (MQ=255) catggcCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAggccatgccatgggccagcagcaccacggcctttaccggtgtggccggcagccattggtgtacgtacaggctgcagtgctcactggcgggca < 1:194847‑M2/143‑93 (MQ=255) catggcCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAggccatgccatgggccagcagcaccacggcctttaccggtgtggccggcagccattggtgtacgtacaggctgcagtgctcactggcgggca > 2:194847‑M2/1‑51 (MQ=255) atggcCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGc > 1:180793/1‑120 (MQ=255) atggcCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGc < 2:180793/120‑1 (MQ=255) tggcCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGcc < 5:98220/149‑1 (MQ=255) tggcCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGcc < 1:60216/149‑1 (MQ=255) ccGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAggccatgccatgggccagcagcaccacggcctttaccggtgtggccggcagccattggtggacgtacaggctgcagtgctcactggcgggcagccagaaggcg < 7:143963‑M2/149‑104 (MQ=255) ccGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTg < 2:275894/149‑1 (MQ=255) cGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAAc < 4:241516/101‑1 (MQ=255) cGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAAc > 3:241516/1‑101 (MQ=255) gCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCATGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTc > 3:336717/1‑148 (MQ=255) aTGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTGCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAAt < 5:217071/149‑1 (MQ=255) cc‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGAc < 4:106716/149‑1 (MQ=255) gggCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCt < 5:277969/149‑1 (MQ=255) ggCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTg < 7:254568/149‑1 (MQ=255) cgcTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTggg < 8:232655/149‑1 (MQ=255) | ACAAGGACCCGCCATGCCTCACGACGCCTTCTGGCTGCCCGCCAGTGAGCACTGCAGCCTGTACGTACACCAATGGCTGCCGGCCACACCGGTAAAGGCCGTGGTGCTGCTGGCCCATGGCATGGCCGAGCATGCC‑‑GGGCGCTACCAGCGCCTGGGCCAGGCTCTGAGCGAGGCCGGCTTTGCCCTGTTCGCTGCCGATCAGCGTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGG > NC_002947/5175185‑5175472 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |