| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 427,540 | G→A | 5.2% | L87L (CTG→TTG) | PP_0350 ← | ferrichrome‑iron receptor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 427,540 | 0 | G | A | 5.2% | 237.0 / 2.0 | 76 | L87L (CTG→TTG) | PP_0350 | ferrichrome‑iron receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (40/32); new base A (2/2); total (42/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
ACCGGGCCCCAGGCGCTTTCGCTGGCGCTGGTGGCATTCACGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGAGGGTGGTGGCCAGTGGCGCGCTGGGCAGGTTGTAGGCGCGC > NC_002947/427392‑427688 | aCCGGGCCCCAGGCGCTTTCGCTGGCGCTGGTGGCATTCACGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAg > 5:128786/1‑149 (MQ=255)aCCGGGCCCCAGGCGCTTTCGCTGGCGCTGGTGGCATTCACGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAg < 3:36812/149‑1 (MQ=255) ccGGGCCCCAGGCGCTTTCGCTGGCGCTGGTGGCATTCACGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAgg > 6:217875/1‑149 (MQ=255) gcgcTTTCGCTGGCGCTGGTGGCATTCACGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGcc < 7:47266/149‑1 (MQ=255) cgcTTTCGCTGGCGCTGGTGGCATTCACGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTCTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGATAAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCcg > 6:223137/1‑149 (MQ=255) cTTTCGCTGGCGCTGGTGGCATTCACGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCcgtc < 3:334729/149‑1 (MQ=255) gctggcgctggTGGCATTCACGGTGGTTTCCGGCAAGGCCTGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCTCTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGTGCGCCCAGGCCGTCGTAtt < 5:223137/149‑1 (MQ=255) gcgctggTGGCATTCACGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGcc > 5:372018/1‑149 (MQ=255) gctggTGGCATTCACGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGc > 4:356814/1‑149 (MQ=255) cATTCACGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCggg < 7:213214/149‑1 (MQ=255) aTTCACGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTa > 1:162585/1‑132 (MQ=255) aTTCACGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTa < 2:162585/132‑1 (MQ=255) aTTCACGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTAt < 8:111799/133‑1 (MQ=255) aTTCACGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTAt > 7:111799/1‑133 (MQ=255) aTTCACGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCgggg > 8:59613/1‑149 (MQ=255) ttCACGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGc < 6:372018/149‑1 (MQ=255) aCGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGcc > 8:162012/1‑147 (MQ=255) aCGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGa < 1:168371/149‑1 (MQ=255) tggtTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTg > 3:137359/1‑149 (MQ=255) ggtTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGc < 7:162012/149‑1 (MQ=255) gtTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCg < 3:356814/149‑1 (MQ=255) gtTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCg < 5:217875/149‑1 (MQ=255) gCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCt > 5:71532/1‑148 (MQ=255) ggCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCa < 6:128786/149‑1 (MQ=255) ccAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGt > 3:279692/1‑149 (MQ=255) cAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTg > 3:235460/1‑149 (MQ=255) cAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTg > 4:247995/1‑149 (MQ=255) tgCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCgg < 4:235460/148‑1 (MQ=255) ccATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGGTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTc > 1:77118/1‑149 (MQ=255) ccATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGt < 6:71532/148‑1 (MQ=255) ccATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTc > 3:351465/1‑149 (MQ=255) cATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTc > 1:140439/1‑148 (MQ=255) cATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTc > 8:42222/1‑148 (MQ=255) ggCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGc > 6:37266/1‑149 (MQ=255) gCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCCGGCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGc > 1:192901/1‑149 (MQ=255) aCGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGc > 7:200050/1‑134 (MQ=255) aCGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGc < 8:200050/134‑1 (MQ=255) atgCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAg < 7:304649/147‑1 (MQ=255) ggCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTAt > 7:341340/1‑91 (MQ=255) ggCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTAt < 8:341340/91‑1 (MQ=255) accaGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAAt > 4:6708/1‑149 (MQ=255) caGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGc > 7:295293/1‑149 (MQ=255) gCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCctgg < 8:295293/148‑1 (MQ=255) gCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCACTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCctggc > 4:134846/1‑149 (MQ=255) cTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCctggct < 2:77118/149‑1 (MQ=255) cTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCctggct < 4:279692/149‑1 (MQ=255) gCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCctggctgg > 6:192957/1‑149 (MQ=255) ccc‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCctggctgg < 3:6708/148‑1 (MQ=255) ctgctctgctGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTg < 4:351465/149‑1 (MQ=255) tgctcagctGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTgg > 4:30756/1‑149 (MQ=255) ctctgctGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTgg < 7:42222/147‑1 (MQ=255) ctctgctGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGtt < 5:192957/149‑1 (MQ=255) tctgctGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCt > 8:119019/1‑144 (MQ=255) tctgctGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCt < 7:119019/144‑1 (MQ=255) tctgctGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGtt > 8:229957/1‑148 (MQ=255) tgctgcAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGAg > 8:179149/1‑149 (MQ=255) tgctgcAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGAg > 5:296866/1‑149 (MQ=255) tgctgcAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCACAGGCCGTCGTATTGGACGCTGACCGGGGACGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCTGGTCGATGGACAACGCAATGCAGGCCTGGCTCGCGATCTGGTTGAg > 4:51179/1‑149 (MQ=255) ctgcAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGa < 3:79619/146‑1 (MQ=255) ctgcAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGAggg > 8:296657/1‑149 (MQ=255) ctgcAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGAgg < 7:229957/148‑1 (MQ=255) gcAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGAGggtg > 6:165170/1‑149 (MQ=255) cAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGAggg > 1:133173/1‑146 (MQ=255) aaCTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGAGggtggt > 7:106705/1‑149 (MQ=255) tGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGCCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGAGGGTGGTGGc > 3:32358/1‑149 (MQ=255) aGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGAGGGTGGTGGCCAg > 6:146189/1‑149 (MQ=255) ggCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGAGGGTGGTGGCCAGt < 3:51179/149‑1 (MQ=255) cGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGAGGGTGGTGGCCAGTGgc > 7:47526/1‑149 (MQ=255) ggTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGGCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCctg > 1:205550/1‑114 (MQ=255) ggTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCctg < 2:205550/114‑1 (MQ=255) gcctgggCGCCCTGCAAGCCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGAGGgtggtg < 6:46299/128‑1 (MQ=255) gcctgggCGCCCTGCAAGCCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGAGGgtggtg > 5:46299/5‑132 (MQ=255) ctgggCGCCCTGCAAGCCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGa < 3:349086/120‑1 (MQ=255) ctgggCGCCCTGCAAGCCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGa > 4:349086/3‑122 (MQ=255) gcggcTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGa > 8:342657/1‑118 (MQ=255) gcggcTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGa < 7:342657/118‑1 (MQ=255) cggcTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCg < 3:77018/55‑1 (MQ=255) cggcTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCg > 4:77018/1‑55 (MQ=255) cTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATGTGGTTGAGGGTGGTGGCCAGTGGCGCGCTGGGCAGGTTGTAg < 4:136842/149‑1 (MQ=255) gggCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGAGGGTGGTGGCCAGTGGCGCGCTGGGCAGGTTGTAGgcgcgc > 8:213022/1‑149 (MQ=255) | ACCGGGCCCCAGGCGCTTTCGCTGGCGCTGGTGGCATTCACGGTGGTTTCCGGCAAGGCCAGTGTGCCATCCGGCACGGCCACCAGGCTGTAGCTGCCC‑GCACTGCTCTGCTGCAACTGCAGGCCGGTACCGCTCAGGGCGGCTTGCAGGGCGCCCAGGCCGTCGTATTGGCCGCTGACCGGGGCCGAGGTGCGGCCGCTGACCAGTGCCGGGTCGATGGCCAAGGCAATGCCGGCCTGGCTGGCGATCTGGTTGAGGGTGGTGGCCAGTGGCGCGCTGGGCAGGTTGTAGGCGCGC > NC_002947/427392‑427688 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |