Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,743,350 | C→T | 9.9% | intergenic (‑183/+64) | fbp ← / ← glgP | class 1 fructose‑1,6‑bisphosphatase/glycogen phosphorylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,743,350 | 0 | C | T | 9.9% | 171.1 / 6.2 | 60 | intergenic (‑183/+64) | fbp/glgP | class 1 fructose‑1,6‑bisphosphatase/glycogen phosphorylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/21); new base T (2/4); total (35/25) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.23e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.34e-01 |
ACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAA > NC_002947/5743204‑5743497 | aCGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAg > 8:157202/1‑149 (MQ=255) aCGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAg > 2:334642/1‑149 (MQ=255) gCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAgcg > 5:257736/1‑149 (MQ=255) gCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAgcg > 5:257741/1‑149 (MQ=255) gTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCaa < 2:232570/149‑1 (MQ=255) aGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCtt > 5:129047/1‑148 (MQ=255) gagaGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAg > 5:259818/1‑149 (MQ=255) agagTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGc < 4:167805/149‑1 (MQ=255) agTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCtt < 1:334642/149‑1 (MQ=255) aCGGGCTAGGGAGTGATGAGAGTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGTCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCTCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCg < 1:163810/148‑1 (MQ=255) aCGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCTTCAAGGCTTGCgc < 1:69064/149‑2 (MQ=255) cTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTGTCTCGCAAGCTTCAAGGCTTGCgctgtac > 4:292091/1‑143 (MQ=25) gAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCtgtg < 8:166313/149‑1 (MQ=255) aGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCGTTCGCGGGCACG‑‑CCCGCTCCCACAGGTGTCTCGCAAGCTTCAAGGCTTGCGCTGTACCTGTgg < 3:365565/149‑1 (MQ=18) aGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTGTCTCGCAAGCTTCAAGGCTTGCGCTGTACCTGTgg < 3:292091/149‑1 (MQ=21) tgatgaGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCACG‑‑CCCGCTCCCACAGGTGTCTCGCAAGCTTCAAGGCTTGCGCTGTACCTGTGGGa < 3:57614/149‑1 (MQ=18) atgaGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAg < 6:129047/148‑1 (MQ=255) atgaGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGc > 2:342238/1‑149 (MQ=255) tgaGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCGTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCg > 4:252593/1‑149 (MQ=255) agaCTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCgg < 6:10619/148‑1 (MQ=255) cGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCCCCCGCTCCCACAGGTGTCTCGCAAGCTTCAAGGCTTGCGCTGTACCTGTGGGagcgagcgc < 1:105725/149‑2 (MQ=17) ccACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGcac > 3:121427/1‑147 (MQ=255) cACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcg > 4:335220/1‑149 (MQ=255) cACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcg > 6:94651/1‑149 (MQ=255) tAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCaa > 4:99510/1‑86 (MQ=255) tAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCaa < 3:99510/86‑1 (MQ=255) gTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCGTTGAAGCTGGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCGCGGCCTCTCGTCAATCCAAt > 2:158704/1‑149 (MQ=38) gTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCt > 8:105267/1‑149 (MQ=255) gTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTc < 7:105267/148‑1 (MQ=255) cGCCTGGCGGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑AGCGCTCCCCAAGGTACAGCGCAAGCCTTTAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGGGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCgg < 1:342238/148‑1 (MQ=255) gCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGTAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTg < 3:335220/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCCGGTGGGCTGGTTGGGGGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTg < 6:259818/149‑1 (MQ=255) ggCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATCCCTTCCAGATCTCGGTGGCat > 5:62783/1‑149 (MQ=255) ggtggtCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTc < 7:157202/149‑1 (MQ=255) gtCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGGGAGGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCTTATTcgcg > 7:76998/1‑148 (MQ=255) gTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGt > 3:133239/1‑149 (MQ=255) gtgtCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGCCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGt > 8:116087/1‑149 (MQ=255) tCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTg > 3:26942/1‑142 (MQ=255) tCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTg < 4:26942/142‑1 (MQ=255) cATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCcgac < 5:94651/149‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCAGCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGGATATTCGCGAATGGTGCGGTCcgac > 5:123946/1‑148 (MQ=255) gcgGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGaa > 1:40275/1‑149 (MQ=255) gggCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATc < 3:261930/93‑1 (MQ=255) gggCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATc > 4:261930/1‑93 (MQ=255) gcggcg‑‑cTCCCTCCCACACGTACACCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCa < 8:76998/146‑1 (MQ=255) gcacg‑‑cccgctCCCACAGGTGTCTCGCAAGCTTCAAGGCTTGCGCTGTACCTGTGGGAGCGAGCGCGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAg > 6:161439/4‑149 (MQ=17) gcg‑‑cTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAAc > 5:66774/1‑144 (MQ=255) gcg‑‑cTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAAc < 6:66774/144‑1 (MQ=255) cgctcCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTCCGAGACACATGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATcc < 3:72106/149‑1 (MQ=255) gctcCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATccg > 3:107289/1‑149 (MQ=255) tcCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTcg > 6:320522/1‑112 (MQ=255) tcCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTcg < 5:320522/112‑1 (MQ=255) tcCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATccgtg > 3:170462/1‑149 (MQ=255) ccACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATccgtgcc > 5:379820/1‑149 (MQ=255) ccACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATccgtgcc > 8:186032/1‑149 (MQ=255) acaGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATccgtgccgt > 5:379083/1‑149 (MQ=255) acaGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCACATccgtgccgt > 4:83179/1‑149 (MQ=255) gTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGtt > 3:210430/1‑148 (MQ=255) tACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTc > 5:306867/1‑148 (MQ=255) aCAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGCGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCACTGCCGTGTTCaa > 5:47/1‑149 (MQ=255) | ACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCG‑‑CTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAA > NC_002947/5743204‑5743497 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |