Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,847,533 | T→C | 6.1% | K59E (AAG→GAG) | PP_5126 ← | HDOD domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,847,533 | 0 | T | C | 6.1% | 194.2 / 2.8 | 65 | K59E (AAG→GAG) | PP_5126 | HDOD domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/25); new base C (2/2); total (38/27) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.11e-01 |
AGGGTAACGATGGTCTCGTCACTCATCTCGCCCTTGATCGACTGGGCGTTGATCAGGTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGATCTGCGGTTGAGGCGGGATGGTGATGCCTTGCAAGGCTTGCTGGA > NC_002947/5847385‑5847679 | aGGGTAACGAT‑GTCTCGTCACTCATCTCGCCCTTGATCGACTGGGCGTTGATCAGGTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCtt > 2:102010/1‑148 (MQ=255) aaCGATGGTCTCGTCACTCATCTCGCCCTTGATCGACTGGGCGTTGATCAGGTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGc > 7:215338/1‑148 (MQ=255) aCGATGGTCTCGTCACTCATCTCGCCCTTGATCGACTGGGCGTTGATCAGGTAGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCCAACCCATCTAGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCATGAGc > 1:365638/1‑147 (MQ=255) gATGGTCTCGTCACTCATCTCGCCCTTGATCGACTGGGCGTTGATCAGGTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAgg > 6:64923/1‑149 (MQ=255) tCACTCATCTCGCCCTTGATCGACTGGGCGTTGATCAGGTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGCCAAGCCGAAGTGCGGAGAGTGGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGTagag > 8:72623/1‑149 (MQ=255) tCACTCATCTCGCCCTTGATCGACTGGGCGTTGATCAGGTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGagag > 4:346266/1‑149 (MQ=255) aCTCATCTCGCCCTTGATCGACTGGGCGTTGATCAGGTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGc > 7:46713/1‑149 (MQ=255) tCATCTCGCCCTTGATCGACTGGGCGTTGATCAGGTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGccc > 1:309656/1‑149 (MQ=255) tCATCTCGAACTTGATCGACTGGGCGTTGATCAGGTTGATGATCGAACGGCTACATAGCAGGTTCACAGCACGCTGGATCGAACAGATCTTGTTCGACAAGCCGAATTGCCGAGAGTTGACCAGCATGAGCAAGGCGACGGAGATGccc > 7:310763/1‑149 (MQ=255) aTCTCGCCCTTGATCGACTGGGCGTTGATCAGGTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGccc < 5:311/147‑1 (MQ=255) aTCTCGCCCTTGATCGACTGGGCGTTGATCAGGTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGccc < 4:357754/147‑1 (MQ=255) aTCTCGCCCTTGATCGACTGGGCGTTGATCAGGTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCgg < 7:72623/149‑1 (MQ=255) aTCTCGCCCTTGATCGACTGGGCGTTGATCAGGTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCgg > 4:95593/1‑149 (MQ=255) ttGATCGACTGGGCGTTGATCAGGTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTggg > 4:262784/1‑148 (MQ=255) ttGATCGACTGGGCGTTGATCAGGTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTggg > 3:86101/1‑148 (MQ=255) gACTGGGCGTTGATCAGGTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCa < 8:215338/148‑1 (MQ=255) gCGTTGATCAGGTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGc < 1:109739/149‑1 (MQ=255) gTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCtt < 6:330127/135‑1 (MQ=255) gTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCtt > 5:330127/1‑135 (MQ=255) gTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTc > 5:346475/1‑147 (MQ=255) gatCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCg > 4:255646/1‑149 (MQ=255) atCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCgg < 3:95593/149‑1 (MQ=255) tCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTCGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCggg > 3:146305/1‑149 (MQ=255) tCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTCGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCggg > 3:151821/1‑149 (MQ=255) cGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAAt < 8:81633/120‑1 (MQ=255) cGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAAt > 7:81633/1‑120 (MQ=255) gatcgtcTACCTTGCAGGTTCACCGCACGCTGGATAGATGCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGt < 7:332147/142‑1 (MQ=255) gAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGt > 2:100127/1‑148 (MQ=255) aCGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAg > 6:135327/1‑149 (MQ=255) ggCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGc < 8:46713/149‑1 (MQ=255) ggCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGc < 5:64923/149‑1 (MQ=255) cTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCAt < 4:86101/149‑1 (MQ=255) tACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATg > 6:39875/1‑149 (MQ=255) tACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATg > 5:47693/1‑149 (MQ=255) ccTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTCGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATg < 4:146305/147‑1 (MQ=255) ccTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTCGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATg < 4:151821/147‑1 (MQ=255) tAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACACGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGCCCCGGGTCCTGGGAAATCAGAATGGCGATGCTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCAAGTACt > 7:352154/1‑149 (MQ=255) cACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAAc < 2:309656/148‑1 (MQ=255) cACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAAc < 6:346475/148‑1 (MQ=255) aTCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCAt > 8:270098/1‑149 (MQ=255) tCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCggg < 5:147447/74‑1 (MQ=255) tCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCggg > 6:147447/1‑74 (MQ=255) gAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGa < 3:346266/148‑1 (MQ=255) gAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGAt > 7:347928/1‑149 (MQ=255) aTCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGTCCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGATCTGCgg > 5:70361/1‑149 (MQ=255) aTCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGATCTGCgg > 2:344921/1‑149 (MQ=255) gTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGATCTGc < 3:262784/142‑1 (MQ=255) gTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGATCTGCg < 3:255646/143‑1 (MQ=255) ttCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGACCGGGTCAGGCATGTACTGATCGAACTGCAGATCGACCATGATCTGCGGTTGAgg > 5:350947/1‑149 (MQ=255) aCAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGAt > 3:21877/1‑133 (MQ=255) aCAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGAt < 4:21877/133‑1 (MQ=255) aaGCCGAAGTGCGGAGAGTTGTCCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGATCTGCGGTTGAGGCGGGAt < 6:70361/149‑1 (MQ=255) ccGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGATCTGCGGTTGAGGCGGGATGGt < 5:135327/149‑1 (MQ=255) cGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGATCTGCGGTTGAGGCGGGATGGt > 1:363372/1‑148 (MQ=255) gTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGATCTGCGGTTGAGGCGGGATGGTGATGc < 5:39875/149‑1 (MQ=255) gCGGAGAGTTGACAAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACAATGATCTGCTGTTGAGGCGGGATGGTGATgaat > 8:340768/1‑146 (MQ=255) cGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGATCTGCGGTTGAGGCGGGATGGTGATGCCtt > 6:379240/1‑149 (MQ=255) agagTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGATCTGCGGTTGAGGCGGGATGGTGATGCCTTGc > 6:234563/1‑148 (MQ=255) ttGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGATCTGCGGTTGAGGCGGGATGGTGATGCCTTGCAAGGc > 5:14525/1‑149 (MQ=255) cAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCa > 2:154483/1‑104 (MQ=255) cAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCa < 1:154483/104‑1 (MQ=255) cAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGATCTGCGGTTGAGGCGGGATGGTGATGCCTTGCAAGGCTTGCt < 1:100127/149‑1 (MQ=255) cAGCTTGAGCAAGGCGCAGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGATCTGCGGTTGAGGCGGGATGGTGATGCCTTGCAAGGCTTGCt > 6:135357/1‑149 (MQ=255) gCTTGAGCAAGGGGCCGGAGAGGCCCGGTTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCTTGATCTGCGGTTGAGGCGGGATGTTGATGCCTTGCAAGGGTTGCTgg < 5:271707/149‑1 (MQ=255) cTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGATCTGCGGTTGAGGCGGGATGGTGATGCCTTGCAAGGCTTGCTGGa > 6:89039/1‑149 (MQ=255) cTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGATCTGCGGTTGAGGCGGGATGGTGATGCCTTGCAAGGCTTGCTGGa > 5:117429/1‑149 (MQ=255) | AGGGTAACGATGGTCTCGTCACTCATCTCGCCCTTGATCGACTGGGCGTTGATCAGGTTGATGATCGAACGGCTACCTAGCAGGTTCACCGCACGCTGGATCGAACCGATCTTGTTCGACAAGCCGAAGTGCGGAGAGTTGACCAGCTTGAGCAAGGCGCCGGAGAGGCCCGGGTCCTGGGAAATCAGCTTGGCGATGGTTTCCAGGTCCGGGTCAGGCATGTACTGCTCGAACTGCAGATCGACCATGATCTGCGGTTGAGGCGGGATGGTGATGCCTTGCAAGGCTTGCTGGA > NC_002947/5847385‑5847679 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |