| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,961,631 | C→G | 8.0% | A176G (GCC→GGC) | lysA‑II → | diaminopimelate decarboxylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,961,631 | 0 | C | G | 8.0% | 240.0 / 8.0 | 75 | A176G (GCC→GGC) | lysA‑II | diaminopimelate decarboxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/30); new base G (3/3); total (42/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACCGACGAGCTGGAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCTGCTGGTGCTGGTCGACCGCCTGGCC > NC_002947/5961483‑5961779 | aCCGACGAGCTGGAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATtgc > 5:149109/1‑149 (MQ=255)aCCGACGAGCTGGAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATtgc > 8:232535/1‑149 (MQ=255) acgaGCTGGAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATtgccgat < 5:361257/149‑1 (MQ=255) gaGCTGGAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGACGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATtgccgatgc > 4:152952/1‑149 (MQ=255) gCTGGAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGGGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCCCCCGTACATCTCCCCCGGCCATAAAGAAAACAAGTTCGGCCACGCCATtgccgatgcc > 5:75339/1‑148 (MQ=255) cgcCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCAt > 4:253501/1‑149 (MQ=255) gcCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATc > 4:339689/1‑149 (MQ=255) gcCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATc < 6:149109/149‑1 (MQ=255) tGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCtac > 6:55395/1‑149 (MQ=255) gCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCtacg > 2:117992/1‑149 (MQ=255) cAAGTAGTCGCCGCCGAACTGGGCAAGGTTGGCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCtac < 6:75339/147‑1 (MQ=255) cAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCtacg > 8:256584/1‑148 (MQ=255) aaGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCtacgta < 3:253501/149‑1 (MQ=255) 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gCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGAACGCGCCGCACAGCTACCGAAc < 7:232535/149‑1 (MQ=255) aaGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCt > 3:364926/1‑149 (MQ=255) aaGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCt < 1:117992/149‑1 (MQ=255) aGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTg < 7:256584/149‑1 (MQ=255) ttGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGaa < 3:152952/149‑1 (MQ=255) ccGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCTCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGt < 3:343122/149‑1 (MQ=255) ccGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGt > 5:164931/1‑149 (MQ=255) cGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTc < 6:329331/149‑1 (MQ=255) ggTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCg < 3:339689/149‑1 (MQ=255) ggTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCg < 6:230776/149‑1 (MQ=255) ggTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCg < 5:16393/149‑1 (MQ=255) gctgtCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCAACCCTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAACTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACCCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCg < 4:199526/147‑1 (MQ=255) tCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGgtg < 7:68667/148‑1 (MQ=255) gCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTc < 6:105765/148‑1 (MQ=255) gCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTc < 7:270997/148‑1 (MQ=255) tGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGAc > 8:30087/1‑149 (MQ=255) cGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACt < 4:364926/148‑1 (MQ=255) ccGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCCCAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCAACATCgg > 6:339094/1‑149 (MQ=255) gTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCAACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCg > 6:41799/1‑147 (MQ=255) tCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAg < 6:164931/149‑1 (MQ=255) cGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGccca > 3:288843/1‑149 (MQ=255) cGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGacca > 3:110105/1‑149 (MQ=255) gTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGaccacc > 3:302463/1‑149 (MQ=255) cccacccGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTc < 5:55395/149‑1 (MQ=255) acccGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGc > 2:226761/1‑128 (MQ=255) acccGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCGGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGc < 1:226761/128‑1 (MQ=255) ccGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGcc > 4:297847/1‑149 (MQ=255) cATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTcc > 3:113638/1‑149 (MQ=255) aTCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCt > 4:212997/1‑149 (MQ=255) tctcCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTc > 7:75358/1‑149 (MQ=255) ctcCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTc > 6:179810/1‑148 (MQ=255) tcCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGa > 6:250747/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGc > 4:106314/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGc > 3:43667/1‑149 (MQ=255) cGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGa < 2:122798/132‑1 (MQ=255) cGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGa > 1:122798/1‑132 (MQ=255) cTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCTACGCCCTCGa > 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aaaaCAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGAccagcac > 5:305055/1‑144 (MQ=255) aaaCAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCctgc < 1:55857/149‑1 (MQ=255) aaaCAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCctgc > 2:55857/1‑149 (MQ=255) cAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCtgctgg < 4:113638/149‑1 (MQ=255) ttCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGAc > 8:201913/1‑135 (MQ=255) ttCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGAc < 7:201913/135‑1 (MQ=255) ctcggcatcggcaATGGCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCtgctggtgct > 8:126478/2‑149 (MQ=255) tcggcatcggcaATGGCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCtgctggtgctg > 2:259146/1‑149 (MQ=255) tcggcatcggcaATGGCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCACTCGa < 5:258347/133‑1 (MQ=255) cGGCATCGGCAATGGCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCtgctggtgctgg < 7:126478/149‑1 (MQ=255) cGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCtgctggtgctg < 3:297847/148‑1 (MQ=255) ggCATCGGCAATGGCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCtgctggtgctg < 4:136220/147‑1 (MQ=255) ggCATCGGCAATGGCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCtgctggtgctg > 3:136220/1‑147 (MQ=255) aTCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCTGCTGGTGCTGGTCGa < 6:376168/149‑1 (MQ=255) gCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCTGCTGGTGCTGGTCGAcc < 3:212997/148‑1 (MQ=255) gCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCTGCTGGTGCTGGTCGACCg > 5:64360/1‑149 (MQ=255) ccATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCTGCTGGTGCTGGTCGACCGc > 5:29492/1‑149 (MQ=255) aTTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCctgc > 6:129556/1‑130 (MQ=255) aTTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCctgc < 5:129556/130‑1 (MQ=255) aTTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCTGCTGGTGCTGGTCGACCGCCt > 1:318810/1‑149 (MQ=255) ccgatgccgaGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCTGCTGGTGCTGGTCGACCGCCTGGcc < 4:302463/149‑1 (MQ=255) ccgatgccgaGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTAGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCTGCTGGTGCTGGTCGACCGCCTGGcc > 6:246350/1‑149 (MQ=255) | ACCGACGAGCTGGAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGGTACCCACCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCTGCTGGTGCTGGTCGACCGCCTGGCC > NC_002947/5961483‑5961779 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |