Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,073,443 | T→C | 7.8% | P271P (CCA→CCG) ‡ | PP_5327 ← | phosphate ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,073,443 | 0 | T | C | 7.8% | 215.9 / 6.3 | 76 | P271P (CCA→CCG) ‡ | PP_5327 | phosphate ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/36); new base C (4/2); total (38/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ACGGCCATGATCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGC > NC_002947/6073297‑6073589 | aCGGCCATTATCATGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGTGAAGATACCGCCCTCGTTGTTGTCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTATGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTgg < 7:166915/149‑1 (MQ=255) aTGATCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAAc > 1:349493/1‑149 (MQ=255) accctgatcatcatcaCGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGGGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGCACgg > 6:234499/8‑148 (MQ=255) aGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATg < 5:214554/149‑1 (MQ=255) gggTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGc < 8:209336/149‑1 (MQ=255) atcatcaCGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTa < 8:279679/148‑1 (MQ=255) tcatcaCGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTAcc > 1:365208/1‑149 (MQ=255) tcatcaCGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTAcc < 2:308268/149‑1 (MQ=255) aCGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCGCTACCTTGc > 7:33514/1‑148 (MQ=255) cGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCt > 7:339375/1‑148 (MQ=255) ccGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGt < 7:263348/148‑1 (MQ=255) gAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGa > 7:294272/1‑149 (MQ=255) gCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCa < 8:294272/148‑1 (MQ=255) gggAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCGCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTc < 3:60624/149‑1 (MQ=255) ccGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGt < 2:365208/148‑1 (MQ=255) cGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATcc > 5:263160/1‑149 (MQ=255) gCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGccac > 6:170877/1‑149 (MQ=255) cTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGTTAGGCATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGc > 1:114927/1‑149 (MQ=255) aCGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAgg < 3:330107/148‑1 (MQ=255) cgcgGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGGACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCt > 5:254501/1‑149 (MQ=255) gcgGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCggg < 3:15134/138‑1 (MQ=255) gcgGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCggg > 4:15134/1‑138 (MQ=255) gcgGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGc < 2:357728/139‑1 (MQ=255) gcgGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGc > 1:357728/1‑139 (MQ=255) gcgGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTg > 3:65016/1‑149 (MQ=255) cgGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGCTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGt < 6:108020/149‑1 (MQ=255) tcgtcgCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTT‑CTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCgg > 6:128243/1‑149 (MQ=255) cgtcgCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCGCTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCgg < 8:33514/149‑1 (MQ=255) gtcgCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCgg < 3:114723/148‑1 (MQ=255) cTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGaaaa < 3:121923/149‑1 (MQ=255) tGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGaaa > 2:43975/1‑147 (MQ=255) tGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGaaa > 7:155526/1‑147 (MQ=255) cTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGt < 5:170877/149‑1 (MQ=255) cTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGACGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGt > 8:13894/1‑149 (MQ=255) tCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTg < 6:177086/146‑1 (MQ=255) tCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCAGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTg > 5:177086/1‑146 (MQ=255) cccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTg > 2:241460/1‑148 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGGACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTg < 6:254501/147‑1 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTg > 4:222350/1‑147 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGc < 2:349493/148‑1 (MQ=255) cAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAg < 3:222350/149‑1 (MQ=255) ttGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGt > 6:57277/1‑149 (MQ=255) cGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTg > 3:214860/1‑133 (MQ=255) cGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTg < 4:214860/133‑1 (MQ=255) gAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCa > 3:176099/1‑80 (MQ=255) gAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCa < 4:176099/80‑1 (MQ=255) aGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCAc < 7:163257/79‑1 (MQ=255) aGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCAc > 8:163257/1‑79 (MQ=255) aGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCgg < 6:263160/149‑1 (MQ=255) tAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTc > 2:67991/1‑149 (MQ=255) ggTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCtt > 3:64482/1‑149 (MQ=255) ggTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGG‑AAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCtt < 8:339375/148‑1 (MQ=255) gTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTc < 1:43975/149‑1 (MQ=255) gCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGa > 2:141429/1‑149 (MQ=255) cccAACTTGTTGAACGCCC‑‑A‑‑CATGCCGTTTTGCTGATAGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCCCGGCCGTTGCAATCCCGGGCCACCAGTCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGTTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGAt < 8:324058/149‑1 (MQ=255) cccAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGa > 7:121343/1‑148 (MQ=255) cccAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGa > 4:359987/1‑148 (MQ=255) ccAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGa > 4:598/1‑147 (MQ=255) cAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAg > 6:143087/1‑149 (MQ=255) cTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCt > 8:311644/1‑149 (MQ=255) gTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCTGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTa < 7:311644/149‑1 (MQ=255) aaCGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGc < 2:114927/148‑1 (MQ=255) aCGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCgg < 5:57277/149‑1 (MQ=255) cG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGccac > 6:94953/1‑81 (MQ=255) cG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGccac < 5:94953/81‑1 (MQ=255) g‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt < 1:241460/149‑1 (MQ=255) g‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt < 3:359987/149‑1 (MQ=255) g‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt < 5:143087/149‑1 (MQ=255) agtgcATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCtt < 7:319772/135‑1 (MQ=255) agtgcATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCtt > 8:319772/5‑139 (MQ=255) gcATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGTACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCATGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt > 5:267069/2‑148 (MQ=255) gcATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt > 7:26261/2‑148 (MQ=255) aTGCCGTTCAGCCAAACGGCATGTACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCa < 6:267069/148‑1 (MQ=255) aTGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAg > 6:99195/1‑149 (MQ=255) gCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGtt > 2:99983/1‑149 (MQ=255) gTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTT‑CTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGc < 5:128243/149‑1 (MQ=255) | ACGGCCATGATCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGC > NC_002947/6073297‑6073589 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |