| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,073,447 | T→C | 8.0% | Q270R (CAG→CGG) ‡ | PP_5327 ← | phosphate ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,073,447 | 0 | T | C | 8.0% | 210.7 / 7.1 | 75 | Q270R (CAG→CGG) ‡ | PP_5327 | phosphate ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/35); new base C (4/2); total (38/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.44e-01 | |||||||||||
ATGATCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGT > NC_002947/6073303‑6073594 | aTGATCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAAc > 1:349493/1‑149 (MQ=255) accctgatcatcatcaCGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGGGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGCACgg > 6:234499/8‑148 (MQ=255) aGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATg < 5:214554/149‑1 (MQ=255) gggTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGc < 8:209336/149‑1 (MQ=255) atcatcaCGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTa < 8:279679/148‑1 (MQ=255) tcatcaCGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTAcc > 1:365208/1‑149 (MQ=255) tcatcaCGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTAcc < 2:308268/149‑1 (MQ=255) aCGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCGCTACCTTGc > 7:33514/1‑148 (MQ=255) cGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCt > 7:339375/1‑148 (MQ=255) ccGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGt < 7:263348/148‑1 (MQ=255) gAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGa > 7:294272/1‑149 (MQ=255) gCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCa < 8:294272/148‑1 (MQ=255) gggAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCGCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTc < 3:60624/149‑1 (MQ=255) ccGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGt < 2:365208/148‑1 (MQ=255) cGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATcc > 5:263160/1‑149 (MQ=255) gCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGccac > 6:170877/1‑149 (MQ=255) cTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGTTAGGCATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGc > 1:114927/1‑149 (MQ=255) aCGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAgg < 3:330107/148‑1 (MQ=255) cgcgGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGGACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCt > 5:254501/1‑149 (MQ=255) gcgGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCggg < 3:15134/138‑1 (MQ=255) gcgGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCggg > 4:15134/1‑138 (MQ=255) gcgGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGc > 1:357728/1‑139 (MQ=255) gcgGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGc < 2:357728/139‑1 (MQ=255) gcgGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTg > 3:65016/1‑149 (MQ=255) cgGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGCTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGt < 6:108020/149‑1 (MQ=255) tcgtcgCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTT‑CTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCgg > 6:128243/1‑149 (MQ=255) cgtcgCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCGCTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCgg < 8:33514/149‑1 (MQ=255) gtcgCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCgg < 3:114723/148‑1 (MQ=255) cTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGaaaa < 3:121923/149‑1 (MQ=255) tGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGaaa > 7:155526/1‑147 (MQ=255) tGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGaaa > 2:43975/1‑147 (MQ=255) cTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGt < 5:170877/149‑1 (MQ=255) cTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGACGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGt > 8:13894/1‑149 (MQ=255) tCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTg < 6:177086/146‑1 (MQ=255) tCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCAGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTg > 5:177086/1‑146 (MQ=255) cccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTg > 2:241460/1‑148 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGGACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTg < 6:254501/147‑1 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTg > 4:222350/1‑147 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGc < 2:349493/148‑1 (MQ=255) cAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAg < 3:222350/149‑1 (MQ=255) ttGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGt > 6:57277/1‑149 (MQ=255) cGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTg > 3:214860/1‑133 (MQ=255) cGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTg < 4:214860/133‑1 (MQ=255) gAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCa > 3:176099/1‑80 (MQ=255) gAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCa < 4:176099/80‑1 (MQ=255) aGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCAc > 8:163257/1‑79 (MQ=255) aGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCAc < 7:163257/79‑1 (MQ=255) aGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCgg < 6:263160/149‑1 (MQ=255) tAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTc > 2:67991/1‑149 (MQ=255) ggTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCtt > 3:64482/1‑149 (MQ=255) ggTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGG‑AAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCtt < 8:339375/148‑1 (MQ=255) gTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTc < 1:43975/149‑1 (MQ=255) gCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGa > 2:141429/1‑149 (MQ=255) cccAACTTGTTGAACGCCC‑‑A‑‑CATGCCGTTTTGCTGATAGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCCCGGCCGTTGCAATCCCGGGCCACCAGTCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGTTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGAt < 8:324058/149‑1 (MQ=255) cccAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGa > 7:121343/1‑148 (MQ=255) cccAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGa > 4:359987/1‑148 (MQ=255) ccAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGa > 4:598/1‑147 (MQ=255) cAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAg > 6:143087/1‑149 (MQ=255) cTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCt > 8:311644/1‑149 (MQ=255) gTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCTGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTa < 7:311644/149‑1 (MQ=255) aaCGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGc < 2:114927/148‑1 (MQ=255) aCGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCgg < 5:57277/149‑1 (MQ=255) cG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGccac < 5:94953/81‑1 (MQ=255) cG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGccac > 6:94953/1‑81 (MQ=255) g‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt < 5:143087/149‑1 (MQ=255) g‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt < 3:359987/149‑1 (MQ=255) g‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt < 1:241460/149‑1 (MQ=255) agtgcATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCtt < 7:319772/135‑1 (MQ=255) agtgcATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCtt > 8:319772/5‑139 (MQ=255) gcATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGTACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCATGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt > 5:267069/2‑148 (MQ=255) gcATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt > 7:26261/2‑148 (MQ=255) aTGCCGTTCAGCCAAACGGCATGTACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCa < 6:267069/148‑1 (MQ=255) aTGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAg > 6:99195/1‑149 (MQ=255) gCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGtt > 2:99983/1‑149 (MQ=255) gTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTT‑CTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGc < 5:128243/149‑1 (MQ=255) tGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGt > 1:3234/1‑149 (MQ=255) | ATGATCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCG‑‑A‑‑CATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCA‑GGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGT > NC_002947/6073303‑6073594 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |