| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 503,592 | T→C | 5.9% | F208S (TTT→TCT) ‡ | PP_0414 → | polyamine ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 503,592 | 0 | T | C | 5.9% | 201.6 / 2.3 | 68 | F208S (TTT→TCT) ‡ | PP_0414 | polyamine ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/28); new base C (2/2); total (38/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.33e-01 | |||||||||||
GCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCT > NC_002947/503447‑503739 | gCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGa > 3:160815/1‑149 (MQ=255)gCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGa > 7:201905/1‑149 (MQ=255) gACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGAc > 6:88661/1‑148 (MQ=255) cGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAg < 8:201905/149‑1 (MQ=255) cGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAg < 7:280356/149‑1 (MQ=255) gCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTACCACCTCGTCAAACGAgg < 2:221582/149‑1 (MQ=255) tGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGACACCTCGTTTGAGGAggtg > 8:134687/1‑149 (MQ=255) cAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAggtggt > 2:345774/1‑149 (MQ=255) cAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTCAAACGAggtgg < 1:103183/148‑1 (MQ=255) aGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGGCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAggtggtg < 8:141331/149‑1 (MQ=255) gggTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAggtggtggt < 6:81269/149‑1 (MQ=255) ggTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGgtggtggtg < 8:325673/149‑1 (MQ=255) ggTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGgtggtggtg < 1:345774/149‑1 (MQ=255) aaCTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCt > 1:17929/1‑149 (MQ=255) aaCTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCt > 4:52052/1‑149 (MQ=255) tCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCg > 8:100188/1‑149 (MQ=255) tCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCg > 7:73352/1‑149 (MQ=255) gcggcgGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACg < 8:115726/129‑1 (MQ=255) gcggcgGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACg > 7:115726/1‑129 (MQ=255) cggcCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAg < 7:100188/149‑1 (MQ=255) cggcCAGCCTGGGCGCGTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAg < 3:286303/149‑1 (MQ=255) gcCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGc < 5:88661/149‑1 (MQ=255) ccAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGc > 7:216502/1‑148 (MQ=255) ccAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGc < 8:216502/148‑1 (MQ=255) cTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACt > 7:301514/1‑149 (MQ=255) gggCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGc > 2:215114/1‑149 (MQ=255) ttCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCgg > 2:217904/1‑148 (MQ=255) tCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTTGTGACGCTGTTCCTCGCCGGCCCGGAGCAGGCAACACTGCCGAgg > 8:273195/1‑147 (MQ=255) aCCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCGGATTGCGCCCGGTGTCCTCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGa < 7:134687/149‑1 (MQ=255) aCCTCTGCTGGCTTTACGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAg < 7:335777/148‑1 (MQ=255) tctGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGt > 4:42349/1‑149 (MQ=255) ctgGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAg > 4:336192/1‑149 (MQ=255) tttCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCAACTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTa > 2:79842/1‑149 (MQ=255) tCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTAtt > 7:85819/1‑149 (MQ=255) cgccgGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGCGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTcg > 4:87655/1‑149 (MQ=255) gccgGGTGACCCTGCCGCGGATTGCGCCCGGTGTCAGCTCGGGAGCCCTGTTTGCCATTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTcgc < 8:288001/149‑1 (MQ=255) cgGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCga < 1:215114/149‑1 (MQ=255) ggTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCa < 1:292676/134‑1 (MQ=255) ggTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCa > 2:292676/1‑134 (MQ=255) gTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCATTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCAGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGAAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGagagca > 4:269677/1‑147 (MQ=255) ccTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCGCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCt > 5:53423/1‑147 (MQ=255) cTGCCGCTGATTGCGACCGGTGTCATCTCGGGAGACCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCAGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAg > 8:138867/1‑149 (MQ=255) cGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCg > 4:47721/1‑149 (MQ=255) cTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTcgc > 8:100750/1‑132 (MQ=255) cTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTcgc < 7:100750/132‑1 (MQ=255) aTTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGAcc < 3:47721/147‑1 (MQ=255) cccGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCcgc > 5:152375/1‑149 (MQ=255) cccGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCcgc < 4:160815/149‑1 (MQ=255) tCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCgcggcggcg < 3:336192/149‑1 (MQ=255) tCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCgcggcggc > 3:87712/1‑148 (MQ=255) aTCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAaca < 3:267725/84‑1 (MQ=255) aTCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAaca > 4:267725/1‑84 (MQ=255) tctcGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCg > 6:332541/1‑105 (MQ=255) tctcGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCg < 5:332541/105‑1 (MQ=255) tcGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCtt > 1:160460/1‑149 (MQ=255) gggAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGc > 5:250175/1‑149 (MQ=255) ggAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCt > 5:67375/1‑149 (MQ=255) cccTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGAtt < 6:152375/149‑1 (MQ=255) cccTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGAtt < 4:87712/149‑1 (MQ=255) cTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGc < 2:160460/149‑1 (MQ=255) gTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGt > 3:275450/1‑149 (MQ=255) gcctttgccACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTtctc > 7:18568/1‑149 (MQ=255) gcctttgccACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTtctc > 6:69958/1‑149 (MQ=255) cctttcccCCCTCGTTTGACGAGGGGGGGTGGACGCTTTCCCGCGCCGGGCCGCCGCCGCCAACACTGCCGCGGCATAGGTTCAGCGTTATCCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTCCCGCGGGGGCGACCTTGCTGATTGGGTTCTCg < 8:73352/149‑1 (MQ=255) tgccACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGgt < 7:273195/147‑1 (MQ=255) accACCTCGTCAAACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGtgtt > 4:89066/2‑149 (MQ=255) accACCTCGTCAAACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGtgtt > 2:341461/2‑149 (MQ=255) ccTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGttgttg < 2:17929/149‑1 (MQ=255) tttGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTgctgct < 8:301514/149‑1 (MQ=255) | GCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCT > NC_002947/503447‑503739 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |