| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 682,312 | G→T | 6.1% | P321T (CCG→ACG) | PP_0584 ← | methyl‑accepting chemotaxis transducer |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 682,312 | 0 | G | T | 6.1% | 249.0 / 4.0 | 79 | P321T (CCG→ACG) | PP_0584 | methyl‑accepting chemotaxis transducer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/36); new base T (3/2); total (41/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.98e-01 | |||||||||||
AGGCTGCGAATGGCACCGAGGAACTGGTTGAACCAGTTGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTGTTCGATCAGGCCGATGAAGGTCCAGCC > NC_002947/682170‑682456 | aGGCGGCGAAGGGCACCGTGAAACTGGTTCAACCAGTTATCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCa < 1:123522/148‑1 (MQ=255) gCTGCGAATGGCACCGAGGAACTGGTTGAACGAGTTGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGa < 1:68239/149‑1 (MQ=255) gCTGCGAATGGCACCGAGGAACTGGTTGAACCAGTTGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGa > 5:94514/1‑149 (MQ=255) aaTGGCACCGAGGAACTGGTTGAACCAGTTGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGTGCACCCGATCaaca < 8:224606/149‑4 (MQ=255) aCCGAGGAACTGGTTGAACCAGTTGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCg > 2:213497/1‑148 (MQ=255) aCCGAGGAACTGGTTGAACCAGGTGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCg > 7:233565/1‑148 (MQ=255) ccGAGGAACTTGTTGAACCAGTTGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGaa < 7:18324/149‑1 (MQ=255) cGAGGAACTGGTTGAACCAGTTGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAg > 7:88523/1‑149 (MQ=255) aGGAACTGGTTGAACCAGTTGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGc < 8:348587/149‑1 (MQ=255) ccaaCTGGTTCAACCAGTTGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGcc > 8:124076/3‑149 (MQ=255) gAACTGGTTGAACCAGTTGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGCCGCTGTTCATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGCAGGCCg > 8:172258/1‑149 (MQ=255) gAACTGGTTGAACCAGTTGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAgg < 6:202350/146‑1 (MQ=255) gAACTGGTTGAACCAGTTGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAgg > 5:202350/1‑146 (MQ=255) gTTCAACCAGTTGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGgc < 7:135201/119‑1 (MQ=255) gTTCAACCAGTTGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGgc > 8:135201/1‑119 (MQ=255) aCCAGTTGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGc < 4:95903/139‑1 (MQ=255) aCCAGTTGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGc > 3:95903/1‑139 (MQ=255) ttGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGaa < 1:213497/149‑1 (MQ=255) ttGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGaa > 4:20048/1‑149 (MQ=255) gCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAg > 3:254087/1‑149 (MQ=255) cAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAgcg > 7:90409/1‑149 (MQ=255) cAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAgcg > 2:12756/1‑149 (MQ=255) aGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCAGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCAAGGCAATTGGTGACTCTGTTGATCTGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCTCGAACAgcgc > 4:49592/1‑149 (MQ=255) gctGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGcgcg < 8:233565/147‑1 (MQ=255) gcgGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCaa > 1:191064/1‑149 (MQ=255) ggTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAaca < 1:12756/149‑1 (MQ=255) tcgtcgCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAAcacca < 2:191064/148‑1 (MQ=255) tcgtcgCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAAcacca < 8:88523/148‑1 (MQ=255) gtggctgCCGCTGATTTCCAGGTTTCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTTACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACcaca < 5:308741/142‑1 (MQ=255) gtcgCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGTGCGCCCGATCaaca > 2:212838/1‑98 (MQ=255) gtcgCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGTGCGCCCGATCaaca < 1:212838/101‑4 (MQ=255) cgGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGAt < 5:340400/149‑1 (MQ=255) gCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGa < 3:20048/149‑1 (MQ=255) cgcgGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGaca > 2:100319/1‑149 (MQ=255) ggATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCaa < 8:346675/130‑1 (MQ=255) ggATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCaa > 7:346675/1‑130 (MQ=255) tttCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATc < 6:94514/149‑1 (MQ=255) ttCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGAt > 6:114138/1‑147 (MQ=255) ccAGGTTGCGGGTCAGGTCACCTTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGc > 5:77538/1‑149 (MQ=255) ccAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGc > 8:224425/1‑149 (MQ=255) cAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGAGACCGATCAGc < 8:90409/148‑1 (MQ=255) aGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTTGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGTCGAAGGCCGCACCGACCACCGCTAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCa < 3:49592/149‑1 (MQ=255) aGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAgcgc > 8:310919/1‑116 (MQ=255) aGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAgcgc < 7:310919/116‑1 (MQ=255) ggTTGCGGGTCAGGTCACCATCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAg < 6:77538/149‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGt > 2:347805/1‑149 (MQ=255) caggtcaCCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCggg > 5:301854/1‑149 (MQ=255) aggtcaCCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGc < 5:74421/107‑1 (MQ=255) aggtcaCCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGc > 6:74421/1‑107 (MQ=255) aggtcaCCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCggg < 7:124076/148‑1 (MQ=255) ccTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTc > 4:332483/1‑149 (MQ=255) tCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCACCACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCTGGTGGTGGTCTg > 8:314893/1‑149 (MQ=255) aCCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGc < 5:114138/148‑1 (MQ=255) ggCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACtt < 1:100319/149‑1 (MQ=255) gCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTc > 5:69601/1‑149 (MQ=255) gCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTc > 7:257821/1‑149 (MQ=255) cAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGCCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCg < 7:224425/149‑1 (MQ=255) tGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCtt < 6:301854/149‑1 (MQ=255) tCTTCGAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGAACGATCAGTTTGGCGAAGGCAGCACCGACCACAGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTg < 2:111197/149‑1 (MQ=255) tCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTg < 7:172258/149‑1 (MQ=255) cATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTGTTCGa > 1:259938/1‑144 (MQ=255) cATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTGTTCGa < 2:259938/144‑1 (MQ=255) aTTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTGTTCGATCAGGc < 4:254087/149‑1 (MQ=255) gTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACCCCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCAGTTCGCTGTGTTCGATCAGGCCGAt > 4:40414/1‑149 (MQ=255) gTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTGTTCGAt > 3:320891/1‑140 (MQ=255) gTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTGTTCGAt < 4:320891/140‑1 (MQ=255) gTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTGTTCGATCAGGCCGAt > 6:253220/1‑149 (MQ=255) gTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTGTTCGATCAGGCCGAt > 2:160678/1‑149 (MQ=255) ccaaactGATCGTGCGCCCGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTGTTCGATCAGGCCGATg > 1:133300/7‑146 (MQ=255) caaactGATCGTGCGCCCGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGGGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTGTTCGATCAGGCCGATGAAgg > 5:334669/6‑149 (MQ=255) gATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCa < 4:13080/110‑1 (MQ=255) gATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCa > 3:13080/1‑110 (MQ=255) gATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTGtt < 6:276521/125‑1 (MQ=255) gATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTGtt > 5:276521/1‑125 (MQ=255) gATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTGTTCGATCAGGCCGATGAAGGTccagc > 3:86409/1‑149 (MQ=255) aTCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTGTTCGATCAGGCCGATGAAGGTccagcc > 4:227936/1‑149 (MQ=255) aTCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTGTTCGATCAGGCCGATGAAGGTccagc < 8:59325/148‑1 (MQ=255) tCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTGtt < 8:331221/123‑1 (MQ=255) tCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTGtt > 7:331221/1‑123 (MQ=255) | AGGCTGCGAATGGCACCGAGGAACTGGTTGAACCAGTTGGCCAGTTGCGCGGTTTCGTCGCGGCCGCGGATTTCCAGGTTGCGGGTCAGGTCACCCTCACCTTGGGCAATGTCTTCCAGGCCATTGGTGACGCTGTTGATCGGGCGCACGATCAGTTTGGCGAAGGCCGCACCGACCACCGCGAACAGCGCGGCCAACACCACAGCGATGACACCGATCAGCCAGGTGAGCCGGGTGGTGGTCTGCATCACTTCGCTTTGTTCGATCAGGCCGATGAAGGTCCAGCC > NC_002947/682170‑682456 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |