| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 884,566 | G→C | 7.5% | G159G (GGG→GGC) | PP_0767 → | LuxR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 884,566 | 0 | G | C | 7.5% | 213.1 / 6.7 | 67 | G159G (GGG→GGC) | PP_0767 | LuxR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/28); new base C (3/2); total (37/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.42e-01 | |||||||||||
AGGCCATGGGCCTGCTGAAAATGCGCCAGCGCCATCAGCCGTTTGCCTTTGAAGAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTGGTCGAGCTTAACGAACAGGACCTGC > NC_002947/884418‑884714 | aggccaTGGGCCTGCTGAAAATGCGCCAGCGCCATCAGCCGTTTGCCTTTGAAGAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAgggg < 8:241275/149‑1 (MQ=255) ggccaTGGGCCTGCTGAAAATGCGCCAGCGCCATCAGCCGTTTGCCTTTGAAGAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGc < 6:246556/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGAAAATGCGCCAGCGCCATCAGCCGTTTGCCTTTGAAGAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTc > 6:116649/1‑148 (MQ=255) ctgAAAATGCGCCAGCGCCATCAGCCGTTTGCCTTTGAAGAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCg > 4:58413/1‑149 (MQ=255) gAAAATGCGCCAGCGCCATCAGCCGTTTGCCTTTGAAGAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGtt > 3:66874/1‑149 (MQ=255) aaaaTGCGCCAGCGCCATCAGCCGTTTGCCTTTGAAGAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGtt < 2:70115/148‑1 (MQ=255) aaaTGCGCCAGCGCCATCATCTGTTTGCCTTTGCACAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCGGGCTCTGTACCTGAAAGCTGATACGCGGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGc < 4:27903/149‑1 (MQ=255) aTGCGCCAGCGCCATCAGCCGTTTGCCTTTGAAGAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCt < 2:290929/149‑1 (MQ=255) gccagcgccaTCAGCCGTTTGCCTTTGAAGAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATAACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTAGACCGTTGCCTGCAg > 6:310857/1‑149 (MQ=255) agcggcaTCAGCCGTTTGCCTTTGAAGAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGttc > 3:213400/1‑149 (MQ=255) caTCAGCCGTTTGCCTTTGAAGAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGcc < 1:154999/136‑1 (MQ=255) caTCAGCCGTTTGCCTTTGAAGAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGcc > 2:154999/1‑136 (MQ=255) caTCAGCCGTTTGCCTTTGAAGAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCt < 5:66616/149‑1 (MQ=255) caTCAGCCGTTTGCCTTTGAAGAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCt > 5:54936/1‑149 (MQ=255) caTCAGCCGTTTGCCTTTGAAGAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCt < 7:201176/149‑1 (MQ=255) caTCAGCCGTTTGCCTTTGAAGAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCt < 3:232907/149‑1 (MQ=255) tGAAGAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCg > 6:282054/1‑149 (MQ=255) agagTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGcc > 1:361270/1‑149 (MQ=255) gagTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCt < 2:299571/149‑1 (MQ=255) gagTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCt > 7:243317/1‑149 (MQ=255) agTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTg < 5:116680/149‑1 (MQ=255) tCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTg > 5:373452/1‑149 (MQ=255) gACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCt < 6:297851/149‑1 (MQ=255) aCGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGgt < 1:32363/142‑1 (MQ=255) aCGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGgt > 2:32363/1‑142 (MQ=255) aCGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTg > 7:185335/1‑149 (MQ=255) aCGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTg < 4:324871/149‑1 (MQ=255) aCGGCCTGCTCGACGAGCGGGCGCTGTACCTGCAAGCGGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCGCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTg < 5:310857/149‑1 (MQ=255) ggCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGt < 4:213400/149‑1 (MQ=255) tGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCg < 6:35000/129‑1 (MQ=255) tGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCATCAATCACCTGCCCCCCg > 5:35000/1‑129 (MQ=255) gacgaGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAgc < 2:248530/147‑1 (MQ=255) gcgcTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGc > 7:271648/1‑148 (MQ=255) tACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCt < 5:282054/148‑1 (MQ=255) tACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCt < 2:361270/148‑1 (MQ=255) ccTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTgg > 1:199196/1‑148 (MQ=255) ccTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTgg < 5:298817/148‑1 (MQ=255) tGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCAc > 2:335331/1‑149 (MQ=255) tGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAACTGCCgggacaggcg > 6:378323/1‑142 (MQ=255) gCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGc < 1:244216/142‑1 (MQ=255) gCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGc > 2:244216/1‑142 (MQ=255) aaGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTg > 8:67690/1‑149 (MQ=255) cTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGgcg > 5:346530/1‑149 (MQ=255) gccgcTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCgcgcctgc > 7:265494/1‑149 (MQ=255) gccgcTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCgcgcctgc < 4:225866/149‑1 (MQ=255) gctgctgctGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCgcgcctgcgcc < 5:116649/149‑1 (MQ=255) ctgGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCg > 2:249185/1‑149 (MQ=255) tgGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCgg > 4:117160/1‑149 (MQ=255) gTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCgg > 1:110005/1‑147 (MQ=255) gTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCa < 3:46213/149‑1 (MQ=255) tGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTg > 5:361443/1‑149 (MQ=255) gacgacTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTGGt > 3:72127/1‑149 (MQ=255) gacgacTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTGGt > 7:97954/1‑149 (MQ=255) gacgacTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTGGt > 6:86986/1‑149 (MQ=255) gacgacTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGC‑GTTGGTc > 2:253321/1‑149 (MQ=255) acTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTGGTCGAg < 6:361443/149‑1 (MQ=255) tATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTGGTCGAGCt > 5:205695/1‑149 (MQ=255) gagcACCGGCCCCTGGGCCAGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTg < 5:143960/138‑1 (MQ=255) gagcACCGGCCCCTGGGCCAGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTg < 5:149666/138‑1 (MQ=255) gagcACCGGCCCCTGGGCCAGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTg > 6:143960/4‑141 (MQ=255) gagcACCGGCCCCTGGGCCAGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTg > 6:149666/4‑141 (MQ=255) tCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCCCCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTGGTCGAGCtt > 4:54112/1‑148 (MQ=255) tCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTGGTCGAGCt < 4:66874/147‑1 (MQ=255) gcACCGGCCCCTGGGCCAGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTGGTCGAGCtt > 2:22429/2‑148 (MQ=255) ccTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTGGTCGAGCTTAAc > 7:220217/1‑148 (MQ=255) ccTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTGGTCGAGCTTAACg < 8:265494/149‑1 (MQ=255) ccAGGGGCCGCTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACAAGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGAGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGACGCGCCTGCACCTGTCCCGCCAGTTCGTCGACCTTAAAGACCAg > 4:253896/1‑148 (MQ=255) aGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTGGTCGAGCTTAACGAACAGGAc < 1:249185/149‑1 (MQ=255) gCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTGGTCGAGCTTAACGAACAGGACCTgc > 6:82730/1‑149 (MQ=255) | AGGCCATGGGCCTGCTGAAAATGCGCCAGCGCCATCAGCCGTTTGCCTTTGAAGAGTGGCTCGACGGCCTGCTCGACGAGCTGGCGCTGTACCTGCAAGCTGATACGCCGCTGCTGCTGGTACTGGACGACTATCACCTGGCCCAGGGGCCGGTGCTCGACCGTTGCCTGCAGTTCTTCCTCAATCACCTGCCCCCCGGCCTGGTGTTGCTGGTGACCAGCCGCCAGCGGCCAGGCTGGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGTCCCGGCAGTTGGTCGAGCTTAACGAACAGGACCTGC > NC_002947/884418‑884714 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |